Map Locations of contig_40440 (6545 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_40440

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55970 3 1750 bp MLOC_55970.1 Available Available LOC_Os05g03780.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-98, 13105.m00370 protein cation efflux family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_55970






Contig Sequence (6545 bp)

>contig_40440 6545 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTGTTGTCTATGTATCGATACATGTATTTGAGTTTCCAATCNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAAAAATAACCAATTTATTATTGCTTCTA
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GGCGGCGGTGGCGGCGACCGCAGCACCGCTGCTGCTTCTGCCGCTCAATCCAGGTTAGCA
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AGGCGAGGTTCGGGCTTGAAAACTAGGCCCGGTCAGTAGTTCGGGTTGGGCTCGGGCTTG
CGAGAATTGACATTCTACACGGAGGCCCGGTCCGGCCCGACCCGATATCCGTCTTTTTAG
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CGGGCTTAGGATTTTCAGTTTGGGCTTACTAAAGCCCGACCTGAATCGTGGCCCGACCCA
CGGTGTGACCAGGTTTACCCTATGTTACTACCCACTATGTTACTAACGTTAAACTACCAC
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CCCCTATGTTACAACCTATTGTGAAGGTATTAACTTAGACTAGTAACATATGCATGTTAC
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TACTTTCCATTGTGGGTATTCTCACAGGGGAGAATAATTTAGACTAGTAACATACACCTT
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ACTTCATTTATTAGGTTATAAACACATTTTGCCTTTGTATGTGTGATATTAGTAAGGCTG
GTTGTAATGGGGAGTATCGTATACTAGTATCTTGCATATGATACTAGTATAGGATACTAC
ATCCGTAGTGCATAGTATCATGTGTTAGTATCATAAGGAAGCTCATTTATTGCCATGCAT
GACAC