Map Locations of contig_40123 (9839 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_40123

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55623 2 4645 bp MLOC_55623.2 Available Available LOC_Os01g05500.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m00525 protein zinc finger protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_55623






Contig Sequence (9839 bp)

>contig_40123 9839 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAAGTAGTGTACCGTGAAGTGTAATAGCAGCCCAAAAAGCGATAAATNNNNNNNNNNNN
NNNNNATGCAAAATGGACGTATCATGGCGCTACAATTTACCAAGTGTTCCTTACATTCGG
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GTGCAGGTGCGTCTTTTCTCGTCTGCTCTGGTCTATCTGGCCACCCGTGCCGGCGGTTGC
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ATTGAATGATGTTCTGGTCAACCTTTTTTTTTTTGCTCTAGAAAAAACCTTTTTCTGTGT
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TTTATGTTTGAATGTGTCGCTAATAAGAAAGGTTATCACAGGGCAAGTATGTGCTTCGCG
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TCCTTCAAATTGTTCATGCTGTTCTCTTCTATGCTGTTTACACCGACACATCATCGGTAT
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ATGATGAATCATGGGTTGTTCTGTCATCTGATGCAGTAGAGGCTTTTCCCATATTGACCT
ATTCTACAGAACTAGTCTCCCCAGAGTCTGACAAACTAAAGAAGGAAAGCATGATAACCT
TGCTTGTTTCACTAATGCACAAGGAAAAGAATGACAGCACCTTTTCTGGATGCAATATTC
CATCTCTAGTTGAAAGTTTGTTGAAGAGATTTGCCAAGTTAAGTAAGCAGTGCATGTCTG
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AGAATTTAGGATCTCCAGATTCGACGGGAAACAGCCAATGCAAAGCTACAATCATGGTAA
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TTTAGTCAAAATTCAAAAATAGGGTCTTTGTTTGGATGTGCTTACAACATTATTTTTTTC
TAGGATAGAAACGCTAGGTGTATAGTTTCCTCGATTAGCTACTGAATTTACATTTTGGAA
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TTTTGTTACTATAGATTCTAAGTGCTAGTTTCTTATCTGAATCTGTATGTCTTAGGCAAA
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TGATGTTCCAACATTTGAGCCAGATGCACCTAGATCAACTGCCATCGAGATGCGACCATT
TTGCTCTCTTTGCCAGGATTCGGATTCCAAAAGTCCACTCTGCTGTTTGATTCGCCTTCA
GGTGATAATCCTCTTCTCTTGACAATTAATGGCTTGCTTTATCCAGTGATGCTCTATGGC
AACATAAACTTGTTGTTTCTCCCTCTGTAGTATTTTGACAACTTAAAGTACCTTTCATGT
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GTTTGCAGAAATAGGATGATGCAAAATCTGCCGGTTTCATAAATACAGCTCGCAGTGTCA
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TTCTTGAGGACAAACTCAGGGCGGAAAGACGGGGTGCGGCCGCGCTCCGAGAAGAAATCG
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GGTCTCAGGGTAACCCCGGTTCTTAGTCTCTGTTGAAACTGTGGTTCTACTGGAGTATGT
CGAACTTGTTTGAGTTTGTTGTTGTGTGAAAAACTTCGTATCTTGTGTATATGTTAAATA
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TATGCAATGCATGATGCTTCTGATTGCCATTTGGCCGGTAGATGTTGCATGTGGCCACCA
CGTAAAAACAACTTCATCTTTTTTTTTCTTACTAGCAAAAATGCCCCTGCATTGTAACGG
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TCATGACTATCACACAAATAGTTCGAACATTTTTAAAATAAACCATCATGTAATTATAAT
GTTCATGAATTTATAAGTGTATGTACATCACAAAATTGCTTATATATTCACTATAAAAAG
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CTATATTTTTTTCCTTCGCTCGCTCCTTGCCAACCAACACCGGCACAAAATAAAGATGAA
TCGTGTATCATCTATTAAGTTGCACCCTAAATTACATTTTAAAAATAATGAACATGTAAA
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TACACATTTTTCTAATCAAATTTCATGTATAACATGTTAATTTACGGTTTAAGAGATATG
TTTATTTGAAAATATATATTAATTCTTAATAGATGCGGGATGATTAACACATATATTAG