| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_40093
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_55594 |
2 |
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MLOC_55594.1 |
Available |
Available |
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| MLOC_55595 |
2 |
932 bp |
MLOC_55595.2 |
Available |
Available |
LOC_Os03g18570.1, FRAME:-3, EVALUE:2e-124, 13103.m02227 protein 40S ribosomal protein S7, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_55594
CDS Structure of MLOC_55595
Contig Sequence (20580 bp)
>contig_40093 20580 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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ATGTCCACCATAGGACTAGGGAGGGGCAACCGCGGTATGGATGCCCAATCCATTATTTCC
TTGAGATGGTTAGGGTTCGTGGCACTAGCCAATTCCTTGGTGGAATCAGCATCTGTATCC
GAGGAAAAGGGATTAACCATTTCCTTGGGATCGGTGGGAGGTTTGAAACTCTCAAGAAAT
TTATTTAGTGTGTCCTTGACCTCGTCCACCAAGGATGATCTGAAAGAGGCCATGGCCTGA
TTCAAATCACCACAGGTGACCATGGTATCGACCGCGGCTGCAGAGTTATCTTCATCCTAA
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TCCATTGGCGAGGTGTGGAGGCACAATGCTCCCCAAGAAGCCACTAGGGCTACCATATTC
TCCTCATGTCGTCTCATAATGCAAGATATCATTTTTCCACTAGTGGTGCCCTTGAAGGCG
GTTGTCCGTATACCTTTACAAACAAGGTTGGGGCANNNNNNACAACTTAATTGGAGGCTC
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TTCTCTTGGTGAAAGTGTAGATCAAGGCCTTCTCCTCCAAACCCTAGATGATCAACAAGT
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GGTATAAGAGGTAAGTCTTCTTGGGTAAGAAGACCCCCTATTTATAGCGGGAGAATCCAA
CTGTTTTCTACCCTCTGCCCGCAGTAAAGCGGTACTACTGCTTCTAGGAGCAGTATTACG
AGGCACAAGTCAGAGAGTACATGTAGTACACGAACGGTAGTGTTGTCAGAGCGGTACTAT
CATCCGTCCCAGCAGTAGCACTGATGTGGGTCCCCAGACAAGGCCAGACAACAGTAGTAG
AGAGGACTAGGGTGACAGTACCACGCCAAGCGGTAATACCATTCTAGTGCCGCTCTACTA
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AGCGGTAGTACCGCTTCCACGGTACCGTCGTGCTATTATCGGACAACTATTGCGATCTAG
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GCCCGGTGGTACTACCGTAGGGTGGTACTACCGCTTCAAAGCAACTGACTACTCCACAGA
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GTCCGCAAATTACATTGTCATCAATCATCAAAACCAATAAGGGAGAAATATGACCTAACA
GGTCTCGAAGGAGAAAACTTACTCGTGATGAATATGTAGACAACCTTAATATGATAGTTT
CTTGAGTCCAAACTCTAATGGCGAATTTTCAAGCCATCACTTCCTGAATACCAAGAAGAA
AATATGTGGCTGGATCAATCCCCGGAAGGTACAATAAAGTTAAATGTAGATGTTACCTTT
GATAATTATCCCATGTGTGCGCCGGCTGGTGATGCTCTCGGAGATAATAAGGGATACATT
ATCATCTCTTGTAAAAGCAAATTCAAGGTTGCCTCGATGTTGCCTTGTCCGAAGCCAATG
TTCTTCTCTTTAGCATGTACCTTGCCCATTCATTTGGGTGCAACATATCAATTAGCAACT
TTGATAATTTTGAGGTGATTTCAACGATGAATGAAGAAGGATGATTGTATGTGATAGTTG
CCTCTATCTTCGACGACTCCTATCATCTAACGTGTGATTTTGTGCAAGATTTATTTATGC
ATTGCCATAAAGAAGAGAATTATACCGATCATGAACCGACAGAGATGACTAAATTTGGCA
GTATTAATGAATGGATAGGTGAACTTCTTACTGGGCTAATTTCTTTTTTCTTAGGCGGCC
TCTATTACAATGAGACGACATATTTTTGTTATGTGATGTAACCTTTGATCGAAGCTTAAT
AAATAAAGTAGAATTTTGTTCCAAAAAATAAAGACGGCTCTGATTTTTTTAGGGCAAACA
CAGCCCTGATTTGTTTTTTAGGGGAAAACACAGCTTTTTTTGAGTCGAAGGGGAAAACAC
AGCTGTGAGGGAGAAAGTTGAAACGAGCCCACAGTAGTCACCCCCACCCCAGCTAACACA
AGCGGCCTTTGCTAGAGGCCCACACAGCCTCTCGCGTATCGCTCTCGCTCTCGCTCCTCA
CCTCGTGAGCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCCCCCGCCTCGCTACTCGCCAGCAAGCCAT
CCACCCAAGCTACAAAGTGCGCGGCCGCACTCGCATGCTCCTCCGCCCTCCTCGCTTCCC
ACGCCTCTCTCCTCGCCGCCTCCGCTCGGAATCTCCGATGGCTTCCACGCTCGCCTTGCT
CAGGCCGTCGGCGCCGAGCCCGGCGACGACCCTGAGGGCGCCGTTCAGATCTCGGGTCTC
CACTAGAGTGTCTGTCGGATCGGCAGTGGCAGCAGGCGCCGACACGCTCTTCGCCGACTA
CAAACCCACCACCGCGTTCCTTTTCCCCGGCCAGGTACAAGTCGAGGCGAGGCGGCCTCT
TCTCGCTCGTTAGCTGATGTGTCTGGTACACGCATGGCATTATGACAGCCAGCTAAGTTG
CAGGAATGGTGATCGTTATGCAATTATTCGTGCGAAGGTGTTTAAATTTTGAAATAAAAA
TTGGCACTCCTATCATGCTGAGTAAAATATCTGGCAAAGATGGCAAATCTGAAGGGATAT
AGGAGTATATACTACACCTTCTGTCCCAAAATAAGTGACTCAACTTTGTATTAACTTTAG
AACAAAGTTAGTACAAAGTTGAGTCACTTATTTTGGGACGGGGGAGTACATATTAGGCAA
TGGGAAGTGTTCATTTTTACTTGGCTAGTTGTACGAATGGGGAAAAGATCACTTCACTGC
TTCAGTTGACGTGGATCATGTTTTGGCCTTGAGAGATTAGGTATTAGGTTCTTGTAGGAG
ATTATTTTAGTTAGAGTGAGGCATTTCCCTTGTGGGGCAATTTTCATGAGCCACACATAA
TTTGAGTTCAAATACATGTGCATCGTGTGTACTGCCTCATTTATGTGTGTTTATGCTTTG
TTTTCCTCTCAGGGTGCTCAGGCTGTTGGAATGGGTAAAGAAGCTCTTAATGTTCGAGCA
GCTGCAGAACTATTTGATAAGGCAAATGATATACTTGGGTATCTACAAACCTCTGATGCG
ATTTACCTGTTGCTCCCCCTAGCAAACTTACGCTTTAATGTTAACAAGTGTCCATAACAA
TTCCAAATGGAAAAACGACAATGCTCATGCTTGTTTAATTTTGAATGTAGCTACGACTTG
CTGAATCTTTGCATCGATGGACCAAAAGAAAAGCTGAACTCAACAGTGATCAGTCAGGTT
TCTGAATTTCACTTCGCCCCCACTGTATTTTACATTATGCATTTTCATGTCTATGCAACT
AGTATTCTTAGGTGTCTGCCCTTTGCTGATATCTACTGTTAGCAATTGAAACATGTCTCC
TTAATCGTCATTCATGGCAATATTGTTTTCAACCATGAATGCCTATTAGGTGCCAAATCT
GGTTAATCAGTTCCAATGCGAGCTAAGTATTTTTTGTACTAACATCTGTTGCTTCAGAAT
GGGACCCACAAGATTGTTTTTGCATTTGTTTTTCTCAGCTATGCTGCATACATTGGAGTG
TGAAGGATAATTTGGTTCAGATACAGTTACGGATCTTGTCAGTTAAAGCTGTATTCTGAT
TGTCGAACAAAACCATTTTGCAGCCAGCTATATATGTTACCAGCCTTGCAGCTGTAGAAG
TGTTACGTGCACGGGAAGACGGTCAATCTGTAATTAACTCTGTAGATGTCACATGTGGTC
TCAGCTTGGGAGAATATACCGCGCTTGCATTTGCTGGTGCCTTTAGGTATTTTCCTTGTT
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AAGCTATCAAAATATATGTTAAATTTAATCCTGGTGAACATGGTCTTCAATCTGCTATAC
CTGTGACAAGATGGTCAAATTAATAGCCCCATAGCTTACTAGTTTTTTCAGTGTGTCAAG
TATGTATGCTTAAGCAATTTTCAACATGCAGCTTTGAGGATGGTCTGAAGCTTGTCAAGC
TTAGAGGAGAAGCCATGCAGGTTAGTTCCAATGAGATATGCATACTTTGAGTTTCTGACT
TTCCAAATAGATTGCTCATGTTCATTATCTTTGTAGGATGCCTCAGATGCTGCCAATAGT
GCGATGGCTAGTGTGATTGGTCTAGATTCAGAAAAGGTGCAACAATTATGCGATGCTGCA
AATGAGGACGTGGATGAAAAGGAAAGAGTTCAAATAGCAAACTTTCTCTGTCCTGTAAGT
CATTCCTGACTCTGAGATTATTAGTTCCCTACTGGGGCTTGCTAAGGCCTTAGCATGGTA
ATACTTTGTTGCAGGGTAACTATGCAGTTTCTGGTGGTGTGAAGGGTATTGAAGCAGTTG
AAGCCAAAGCAAAGTCTTTCAAGGCCAGAATGACGGTTAGTGTTCCCATGCATCCAATTT
TCAACACTGGCCCACGTATGTAAACATGTGTTATACCTGCAATGAAGTGTGAAGCCTGGT
TATCGTAACTTGTAGTGGTTTTGAAAAATGAAAATTCGAAGGGTCATTATACTGAATAGT
GCTCCCTTGGTAAAAAACATAAGCTGTTTTGGACTGTTACTCGGCTTTGACTATAAATTT
TGGTGACAATATGTCGGACAACGGACCATGGAGATAATAAAATAATATTGCAAGAGTACA
GTTGGTGAAATATATGGTGGTACCATTTTCCTGTGATCAATTTATATAGATTTTGTTTGT
ATTAGTGGTGAAGGCTAAGAAAGTTTCAGAAACATGCGTTCTAACATGGTGCATGCTGTT
TTTTAGCAGAGGGGGTAATTGTATACTACTCCCTATGTCTCATAATATAAGACGTTTTTT
GACACTAGTGTAGTGCCAAAAGACGTCCTACATTATGGGACGGAGGGAGTAATATGTAAC
TTAATACTGTGACTTATTGTGGGGATTAGGAAAAGTGACTGCCCTGTTGCTGTCTATCTA
AGAGGCATTGTTGAAAACCTTTTCCTATGTTGCACAGATCATAGTCATAGTAACCAAAGG
TTTGTATATGATGTTGACAATTATCTTGCCAGGTTCGCCTAGCTGTTGCTGGTGCTTTCC
ACACAAGCTTCATGCAACCTGCTGTCTCAAGATTGGAATCTGCGTTGGCTGCTACCGAGA
TTAGATCACCGAGAATCCCAGTAATCTCCAATGTTGATGCACAGCCCCACTCAGATCCTG
ACACAATCAAGAAGATCTTGGCACAACAGGTGTTGGCTTTAGACTATACTTGAATTCATG
CCGCAGCCTTATTATACAATGACTTCGGTGTGACTGACTTGGTAGAGAAACAGGTAACCT
CTCCTGTGCAATGGGAGACTACTGTGACGACTCTTTTGGGTAAAGGCCTTGAGAAGAGCT
ATGAACTCGGACCTGGAAAGGTAAAAATAGGTTCTTAATAATTTTTGACTGGATAACAAT
TCTTTAGAGTCTGTGATGATATTTATTTATTTATTTTTGCTCGTCTGGCATAAACCAGGT
TATAGCAGGAATCATTAAACGGATCAACAAAGGTGCCAGCATCGAGAACATTGGTGCATG
AGACATCGGATCGCCGATATTATAGGGGCAAATAATAAAGCTAACGGGAGCTGCTTAGAT
TTAAGCAACTGTCCTGAATGTACTACAGGGCACGAGGTCTGGCAATTTCCTGTCATTTGT
GAGGAACATAGATAGTGTTGTACAATTATGTTTCATTGGCTAGAGCTAGGTTTCTCGGCG
GTTCAGATTGCCCTCCATATTGTGAGGATCAGAATGAATTTCGCTTATGGTTATGACTTA
CAAGTAATTTTATCCCCATGGCCATGGTTCACTGTCTGCATTCCAAATTTATATGTCTCG
ACAATGAATTTACCATCAACTGAACGCATACAAAAACGCAAGGCTGGCTGAGATAAGCCA
ACGCATTGTGCTAAACAGAAACAACCAACACGGTCACTCCATGATGTAGAAACAGTCTCC
TTCCTCTCTCCTGCCCGAGGTCCTTATTTTCCTTAGATTTTGGTTCGCCTATGAAGATTT
CCCAGATTTGTTGTGCAGGGTTACTAAATCTTATTGTGGTAACCTTTACTGCTTGTTCAA
TATTATTTTTGATGTAGTTTTGCCTTTTACAAGTCGTTTTTTGTTTCGTTGTCATTTTAT
AGAGACACGACCCTTCAGTTGTTGCTTCTTACATATTTCTCTCCTTAGTCCTTACCGAAA
TAATAGAGAGTGTAACTCCACTCCCTAACTTACAAATGAAAATAACGCTCATCTGATTAA
GTTTGTACTACACCCTCCAATCAGGTTTATAGGGTAGAACATGTTGTATATACCATCTAA
AGGATACCATCAAATTTGTAGGAATTTGTGAGAAAACTTGTGTTCATTGATTGTGGGCAA
GGCCCTATTTATACAAAGATTTGGGGCGCCTCCGGAGAGGCATCCGTTTACAATAGGGCT
TGTACGGCGTGAGAAGACGCTAGTACGGACGTTCGCGTGTGTACGATGCTTTGGACACAC
GTGACGAATCCTAACGACGATTAGTGCTAATGGTGTTGGTTTATTCTTAACACTCCCCCT
TGTATAAAGCTGCTTCTTCTATGTCTTGTATCCTTGTATAACTTTGAGGATATTGCTCTT
AACCACAAGCGTATATGATCTTGAATAACTTCTCGAAAACCCACATTAAAAACCTTGATG
AGACCCATGAGAGTAACTCATAAATTTAACACATGATTTAGGAGAAATATGCTTAGTGAC
ATTGCTCTTTATATAACCCGTTTGCATTTGAGCAACACAAACAGCATTATCTTCGTAGAT
AATGGTTTGAGATTCGATAGAACCTTTACCACATGATTTTTGTATGTGGTTTATCATTCT
GCGAAGCCACACACATTCACGTGTTGCCTCATATAATGCGGTTATTTCAGAATAATTGGT
GGATGTAGCCACTAGAGTCTGCTTGGAAGACTTCCATGATATGGTTGTCCCACCTTGTAG
GAATACGAAACAGGTTTGTGCTCTGCATTGTGGGGGTCAAATAAGTAGCCAGCATCAGTA
TACCCAATCATATCAATGTCCAAATTTCTATGAAACTGAAAGAATAGGCCAAGATCCTTT
GTGCCTTGGAGATATCGAAAGATATTCATTACTCCCGTCCAATGGCGTTTAGTCGAAGTT
GCGCTATGTCTAGCTAGTAAATTCACTGTAAACGCAACATCACGCGACACTAAGATATGG
AACTTCAGGTCCTAATATCTCATGTTCATTATCCATTGGTCTAAATGGATCTTTCTCTAC
GTTTAGAGATCGAACTACCATTGGAGTTTTTGGATGGATATGATTTGTCCATATTGAATT
TCTTTAATATTTCTGGATATATGCAGTTTGATGAACAAAAATACCCGAGGGAAGGTGCTC
AAGTTGTAATCCTAAGCAAAATTTAACTTTACCAAAACCGTTCATCTCAAATTCTGTCTT
TAGGTGATTGCGTGCTCCATCAATATCTTGTGTGGTTCCAATGATGTTAAGATCATCAAC
ATACATTGAAATAATGCAAAATCGGGTTGGGACTTTTTTATGAAAACACATGGGCAATCA
TCATTATCGGAGTATCCTTTTTTTCAGAAAGAACTCACTAAGTCGGTTGTACCACATGCG
ACACGACTGTTTTAAGTCGTATAAAGACTTATTTAGTTTTAGACAATATGTGTTGTGTTT
TGCGTTTGGATTCGGGATTGGGACTCCACAAGGAACATTCATGTATATGTCTGAATCAAG
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TGCCATAGAAATAAGGTATCGGAAAGTAATACCACTCCTTACTGGAGAATATGTTTCATT
GAAAACAATGTTTGGTCTCTGTGTGAAACCTTGGGCTACAAGCCTTGCTTTATATCTCAC
CACCTCATTGTTCTCGTTTCTTTTACGAACAAAAACTCATTTGAATCCCACAGGGAAAAC
TCTAGGAGGTGTAGGTATTGCTTCAGTGAATACATTTCGTTATTGAGCGAGGCTAACTCT
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CCTTACAAGCCCTACTTAGCAGATAACTTGGTGCGCCTCCAACTATTCCTAACTGGGTGC
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GAAATGCAACAAGATTACACAATACCTAGATAAGCAATAGTGCAACAAGATAACCGAGCA
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AATAGACTACCTTGATGACCTTGGCACCATCCAAACGGTACCTGACGCGCTTCCCCACAA
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CAAAGACAACATCCTGTGCAAGGGACAAACAATTTATTAAACTTCATTGTTTCAGTTTTT
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TAGAGATAACAACAATGGCTAGCTGTTGAGCAATTTGCTTTCATTTAAAGGTAACCAAGG
GAAAAACATGAGGTAAACATGCTCGTGGATGCCACCTAGCCCTGATCTCTAACTGTAAAT
CAGCTTATAGACTAATGATTAACAGTTAGGGTTCATACACTAATTATGTTGTCATGTATT
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ACGTATATAATTGTTCAGCATATACTACTATTTACAAATTACAACAATCGTATGGCAACT
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CCAGCTTAAATCAGCGCTGGTGTGGTCTACCTTATTGGGCTGGCTTCTCAACGAAGATGG
GATTGTTATAGAATGTGTTATGTGGTTTTATCCGCGAGGTCCTATACGGCGCCTTCAGCG
CCGGTTAGGCAAACAGGCGCCTGCAGCGCTCCTTCTCGTGGACCGGCCCATGTAGAATGT
GTTGATCTTTAAAAATATAAAAAAGTTTATAGAATTTTAGAAAAACAGATCTACGAAAAA
AGTTCAATGATTATTAAAAAAAGTAAAAAAAGTTCACTGATTTTATAAATATGTTTATGT
ACTTTTAAAAAGTCCACACAATTCGAAAAAATTAATATTGATTTTCAAAAAAGTTCATCA
ATTTTCAAAAAAAGTTCATCGGTTTTAAAACAGTTCATTGATTTTGAAAAAAGTTCATGA
ATTTTAAATTATGTTCATAGATTTAAAAAAAAGTTCATCTATTTTTAAAAAGTTCACCGA
TTTTCAAAAAAGATTATCGATTTGGAAAAAAGTTCATGGGCTAAAATACAGATCGGATCT
CTAAATGGATCGGCCCATGATAGAGCGTTGCACGCGCTAGTTAGCAAAATTTGCCTTTAA
CCGACGTGCGTGGTGCTAAATAGGGTTTCCCGTTTTATCCACACATTGTCATGAGCATTT
CTAAACGACAAAAAAAATATTGTCATGAGCAAACATTAGTGACTTTTAGGCTCGGAGCGG
TGAGAGGCGGGGAGTTTTTTCTATCAAGTTTGCTTACACCATGATATTGCATACCGAAAT
CAATAGGTAAAACTGGATTGATGAGAATGATGATTGATGAAACGTCGAGAACGAAAGAGG
AGAGTAATGTGTGCTCAGCTTGCCCTCCTAGATAATGTTGTTCGTGTGGAGGTTAGCACG
GAGCTTTATACCCATGGCGGATTTGCTTGAGCATAGGAACATGGTTACTTCAGCAGCACG
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CATTTGGGCGTTATAGGACGAGGGTTTTGTTGTACAAATGTGCGAAGATGTCAAGAAGAA
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GGCCATCACCCTATGGGTGATTTGGGTCGAAGAGGAAGGCGGTGTATGAATGTATTTATG
AGAGCCCTTTCTCAACTCACTTATTTATCCAATCTTACATGAATGATCTCCAAGTGATGA
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CAGCCCAAAAAATACGCTCAAGGTGAACGTGGACGTTGTCGCCGAAAGCTTGGGAGTTGG
TTCAATAGGAGTTGTTTGCAAAGACACAAAGGGCTTGTTCTTGGGTGCATCACCCATTGT
CTTTAGTGGCATCACCGAGCCCACTACCTTGGAAGCGTTGGTAGTTAGACAAGCCATGGC
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CTACTCGAGTAGTTTTATTTTATGTGCCTTTTCCATGAGCTTAGGAGCTCAAATTCCGAG
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ATCTCTGTGATTTTTTTTGTCCGTGCAAACATTATGGTGGGTTAGTAAAGCTTTGCCTAG
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TGTTTTTCCATATATAAGAATATAAGAAGGTCAGCTTCCGGTGGAAGAACTGGATTGGTA
AACTAGCTCGTTGGGATGGTCAGTTTTGTGAGGATCGGGATAACCTTGGGCGCATGACTA
CGTAGTTTTTATAAAAAAAGTATGTGTCACAAGAAACCATTGGAATTAAGGATGTTCTCT
CACATGTGTCTTGTAAAGTTACAGACGAGATGAACCAAGCTTTTTGTGGTGGCTATACCA
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GACCCGTCGGCTCATTTCTTTCAAAAAAATTGGGAACTTTGTTGTAAGGAGGTGACTGGA
ATTGTATTGCGGATTCTTAATGGAAGGGAATCATCTGAGGAGTTAAATAAAATGATCATC
GTTATCATCCCTAAGGCATCAAAACTGGCACATCTATACCCTTCATCAGTTTATGTGATG
TGATATATATATAATTGTGTGTAAAGTGTTTGCTAACCGGTAGAAGCTCGTCCTTTTGAA
GATCATATTTGTCGAGCAAGCTGCTTTTGTCCCAAACAAGCTCATTGCTCGTGATGTAAT
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TTTTTAGTGTTGTTCAGTGGAGGAAAATTGGAATACTTTAAGCAAACTAGGGGTCTCCGA
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