Map Locations of contig_40020 (10268 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_40020

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55493 1 562 bp MLOC_55493.1 Available Available None
MLOC_55494 1 1549 bp MLOC_55494.1 Available Available None
MLOC_55495 1 662 bp MLOC_55495.1 Available Available LOC_Os03g17100.1, FRAME:-1, EVALUE:2e-51, 13103.m02043 protein Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_55493






CDS Structure of MLOC_55494






CDS Structure of MLOC_55495






Contig Sequence (10268 bp)

>contig_40020 10268 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAATTGGAATTTTGAAAAGTTCCGAATTAATTAAAAGAAGGCAACAAACAAATTGAAATA
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CGATACTACAGACAAGGACAACCATGAAACAACATTACATACAGGACGCAACTCATCGAC
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TCCTCGGTCGCCGTGGCGGTGTCCTCAGCAGCCTTCTCGGGGGACTCCGCGGCGGCCTTC
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AGCACGGGGTTGATGTTTGGCAGCACGCCGCCGTGGGCGATGGTGACGCCGGTGAGCAGC
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TTCTTGTTGTCCTTGGCCGCGTTGCCGGCCAGCTCCAGGACCTGCAGACGCCCAACCCCA
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GGCCGACCGGGAACTGGAGCCCGGCCTTGACGGATCGCGTCACGGCCTTCTTCCTCTGGC
CCTTCCACCCGGCCATCTTCTCCTCTACGGCGACGTGAGCAGGAGGGTTTGGCGGCGGCG
GCGGCGGCGGCGCTGGATCGGATTGCGCTCGCTGCTTGGATTGGCGGATTGGATGGGCGG
GTTTTATAGGCGGGGGGGGGGGGTCCGCGGGGGGGGCGCAATCACCAACGAGAACGGAAC
GGAATTCT