| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_39983
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_55459 |
1 |
1053 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_55459
Contig Sequence (11544 bp)
>contig_39983 11544 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCTCTCTTTCAACCAGGATGGCGATGAATATGATGGTGTCATGCCACTGCC
GCCTCTCGTGGAATCAAGGGTACACCAACACTGGTGCCTCTTGCTGATCTGTTCTGTACT
GAGTGTGAAGTTGATCTCTGATTTTTTTGTCCACTGTCCAGGCATATGTCTCGTTTGGTC
ATACATTATATCTATTTTATCAACTGAAATGCCTATATACTTATGGTATTGACACATCCT
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CAGTGGAGCTGCATGGTCACCACGGGCACCACAGACATCATCATTTTTGTTACAATGGGT
GTCAAAATTTGCTACAAACCAGTGTCCAAATTTGCTACAACTGGTGTCCAAATTTGCTAC
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AGTACTGCCCTTCTTTCATTGGAAGGTTGGAATGATAAAGATGGTCGAGACGAGGAGTTA
ATTACACAGAAGTATCATAATTGAGGCAGAACGTGCAGATTGGTACCAAGATTGCTAATT
TTTTCATGTCAGTACCAACTTTGTGCGAGGCCGTTGCAAATCGAGCTAAATCGCGTATAA
ATACGCATTGATGGTGTATCTGACCGAGGAGGCCCATCTGTCAGGTTCCCACGTGGTATA
TTTTTTTGCGGAAAAACCCCTTGCTTTATACTTAATCATATAAATGTCCTTTATTTTGCA
AAGATCTTGTAATTTTTTTATTCGTAATTTTGCAACTTTGAATCAGACTCTTTTATAAGT
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GTACACATGCGACGCGGCCGAGCAACCACGCCAGAGAGTGGCTCGTGTTACATGGCGAGG
GCTGTGTATGTTATACTGGACATGCTGCGTTGGCTACTTGGGCCAAGCAAGGCCTATCTT
TTTTTTTTCATTTCACGTTGCCGATTGGGCGTAACGAGGCTGCACGCGCTAAATTATTTT
ACACAATAATATGTAAAATGTTCTTAATATCTTTAGAAAATTACGTACTATTGTAAATAC
CACTGTATAATAAACTATTAAAAATATTCATTCATTATATCTACATTTTATTGAACATTT
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TCCATAACTGTGGTCGTTCATTTCCTAGGTTATTTTTACAAATGGTAAACATTTTTATTT
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GTCACATATGTTGAACATTTTTGTATCATCATTTTTAATAGTTAATTACACAATGTTCAT
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ATTTTCATGTATTTAAATAATATAAAGAGGATAACTAATATTTATATGGATTCCTGCAGC
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TAAACGCGTAAAAAGAGAGGACTAGCTTGGCCCAAGTAGCCAGTCCATCATGTCCAGTAT
AATAGAAATACCGCTTGCTCTGTAACACGGGTCACTTTATTTTATTTAAATGATCAGTTC
AATTCAAACTTATAAAAGAGTCCGATTCAAAGTTGAAAAATTATGAACAAAAATAAACTT
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GGGCTTTTCTGCAAAAAAAAACCACGTGACCACCTGACAGGCGGGCCCCGTCGGTCAGAT
ACACCGTCAATACGTATTTATATGCGGTTTAGCTCAATTTGCAACGGCCTCGCACAAAGT
TGGTAATAACATGAAAAAAATTAGTAATCTTGATACCAATCTGCACGTTCCGCTCGCACC
TGATGTACGACCCACACCGCACTGGACCTCGCTATAGTGGAAGACTCGCGAGTAAAGGCG
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ATGCCTTTTTTCCTTTTTAATATATCAAAATGTTTTATCTCTTAAATCATGTGCGTAAAT
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GTAAAAAAACGCGTTTTTCTTTTTTTGAGGGGCACATATGTGCTTCTCGTGGATGCAAGC
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GTGTCTCATGGAAAAAACATGTTTTTTCATTTTACGAGAAACACAGTTGTGTCTCTCATG
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AAACACCTTTTTCGTGCATCTTTTTGTAGTTGTTTTCATATCCTAGGGAAAACTGGACGA
AAGCCGACGCCCCTGAAATATCCATCTAAAACCTAAAAACACGTGCAGAAAAAAAAATTC
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AGCCCATAAAAAATGACCCTTAAGGGACTCCCGCAAGGTGTACCCCTTAGCTAGTTGCTC
TCCATTCTGTGTCACAAATCCTATTTGACATGTGAAATTGTTGGCACAATGCACAAGTCC
ACTTTGAGCGATGAGAAATGGGCCATCCCACTTTGGGTCTTTTACACTAGCAACCACCCT
GGTTTCACAAACATCATATGTTCTAATTCTTTTGTGAATTAAATGTATATAGATATATTT
TAGTGTGTCCATTCACTCGTTTTAGTCCGTGTGTACTTCATATTAAAATATCTAAACCAT
CTTTTATGTGCAAATGTAGGTAGTATTTTCTATACTAGATTTTAACTTTTTTTGTTTAAT
TTTTATTTTTTCAAATAAGATATTGGGAAATTTCAAAAATTCACTATCTTTTTCTGAAAT
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TCTTTTGAAAAAATGTCCATATTTTAAAAAATATGATTTCAAAGTGTTCATGTTTTCAAA
AAGATGTTGGAAGTTTTGAAAAAGTTGTTCCAATTTTAAAAATATATTCAGAATTGTGAA
AAAATGATCACCTAAAAAATGTCAAGAATTTCAAAATATTGGAATATTCATAAAATGTTT
ATTTTTTCAGTAAAGTTTGTTTTCTCAAAACAAATTAGTAAATGATTGTTAAGTTATTTA
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AATTACTGCACATATGATGTATACCATGTCTATTGAACATATAATCAAAGAGGTAGAATG
ACGTAAAAGGAAACTAGAATTACCGCACATATGATGTATACCATGATGTGAGTTTCCCCT
TGTCGAACCTCTCTATTGCAAACAAAACGATAGTTTACTTTCAGTGCTTTGCTTTTATGC
TCTTTACTTTGTTCCAATTTCTACTTACTTTGTTTTCCATCGATGGAAGCAGCTCCGATG
GATCGAACGTCGATGTGGAAGAGGTGGCCCTCTGCATCGCATTGCACCGATCGCTGCAAG
ATCAAGGCGGCCCCGCTGATGGTCGATCTGCAGCCTTCGGGCCCATCGCATGCCAACGGA
GCGCCGACGGCGGTGGATCTGCATCCTCCGGGTCCGTCACATGTTGACGGAGCGTCGTCA
ACGTCGCAGGCCCATCCCACGAGGCGCGAAGCTTCGGTTGCTCCCGCTTCGGGAGGTCCG
CTCCAGGTCATGTACGTCGCTCACCTCCACCACCTTATGCTCCGGAAGCTATGCCTGGCC
AACACTAGGTCCTCGTGCCAGCGTCGGGGACGGGGCGCACGAGGACGCTGAAATCCGAGG
CGCGTGCAGCCCGTCGCGAGCGGCAACAGGCTAGGGAGAGGGGGGAGGCGCTGGCCGCGC
GGCGTTCGACCTCGAGCGTGCTGGTCGACCCCGAGGACCCGCTCATCGTGGGCGTCCTTC
TTAGCTTGCTGATGACGATGGAGATGGATGCGCGTTGCCTCCGTCGCGAGAATGCCGAGG
CGCTTCGACTGACCATCCAGTTATCGGAGCGCGAGGCAGCAAAGGAGGCGGCGGCGAAGG
CGAAAGCAACCCACCACACGAAGGAGCAGGACTACCTCCTCCGCAGGTTGTCCGACATGC
GGTGGAGCTCCGACGAGGACGACAGCGACATCTCCACCATGTCCGACTCCGATGACGATG
ATGACGCTTCACCGCACGCTGAGCCTACACGGAGGAGGGGCACAACAGCATGGATGACCG
GAAGGGGAAGGCGGCGGCGAGGAAATGGTGATTTCCTTCGTTTTGTTCGTATTTTAATTA
TGCTTAAGTAGTTTATAGTATAAATTTGCCGATGAACTCCAATGAACTATGATCCTTTTG
TTCGGTGAAGCAATCTCATTCGATGAAAGCTGTTGATCTCTTGTTTTACGTAGCGTTGCA
TGTATTTATATAGATATGAGGGTTCGGATATGAAGAATGCATACGTGAAAAGTAAAAAAT
AAAGCGCGTCCGGTCAGTGTGTGGGCGTTTGAGGGGTCATATTTGAGGGGCGCTCTCGTT
AACATTTTGAATAAGTTGTTCCATCAAATAATGTATAGCCCTGCGACTGCAGTTCATCCG
GAGCGGACTGCCCAATGCGATGTATGACGAAGCCATATTTGACAGATTCTACTAGCCATG
GACAGTTCTAGCTAGGATGAGAGATCCACGAAAAGCCTCAGACACTGCAAGGTCAGTCAC
TCCCAATCCTTTTGTATGACACGAGTAACCTGAACCCCTCAAACATTGACAACACATCAC
CGTGCACACGAACCTATACAGAAATTTTGATGTGCATGTTCCCAAAGCGGTGCCTTTGAA
GCAGTGATTTCCCTGAAAGGGGCAAAAGCAAATGGAGAGGTGAAAGGAAAAGGGTAGGAA
GTAAACAGTCCAAGATGGAAGTGGGCAAACTCCTTTTTGGCTTAAGAGGTCGATCATGCG
GGCATGGTGGCCAAAGCCTCTCCTTCTCTTCTAGGGTTCTTGAAGATAGTTGATACTGCC
ATCATCCATAGATCATTGCCCTAAAGGAGTTAGTCTTTGTTGTCCCCAGCTCACACCACA
TGTATTATTCCTCGAGAAGTTGATGATCAGATAGTAAGCATTATCCTTCGGATTTGGAGC
AGTAGTTGTATTTTTCTGTAGTATTAGTTGTTAGTGGAGAGCACAAGGACCCCAAAAGGC
TGACCCAAGGTAGAGTTCACATTACATGCATGCATACATGGTGGGCAGCCTCTGCCTCTG
CCTCTGCCCTCCCTGACATGCTCCATGTCTCCCAGCCTTTTTCTCCCGCATAAAGCAAAC
CCACATACTCCAAGTAACACTTGGATGCACTTGTTGGATCTTGTGCAATCCTTTTCTTGT
TTACACTTTGCTAATTTCTCTCTTTTTTACCATGACGCAGGCAGTGAAAGCTACTGCATA
AAAGTCTTATTTTGCATCGGAAAGTCAATTTGGCTCGGGTGGCATATGCTCCCGGGGCCA
TAAATAAATAAATTTGAAATGAAAAAAATCAAGACAAAATTTATTTATGTATTTAGTCAC
ATTCAAATGCTATCTGTAAATTTTAAGGTAAAAAGGGTTAAACATATTGTCCCATGCAAA
CAAAAATTTAAACATCAAATGTTATTTTAAAATGTATTCCAAATTTGTTTTTTTGCTGAC
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TCATGTATAAAAATATCTAGATTTTTTTGAAAACAGTTAATGTTTTTTTGCGCTATTGTT
CACCCGGGAGCAGGAGCCAAAACGCTAGCCCTCATTTTGCATTCTACTCCTAGGACAACT
TGAAGCGTGTGACTCAAAGTGACCTGTTTTTTTTTCTGTTTGGATCGGCGTGTCCGTCTT
CTTTTACAAATGAATCAGCTATGTGTCCAATGGAGCGACTATTTTTTCGTCCGCGCGTAC
TTTTTTATGTAAAAAAGACCTGCGGTCACAGATCATGCGAGCCAACGCCAAGAGTTCATG
CCGGTGATATGCCAGCGGCCGGCATACATATTCCAACCTTCAAAAAAGTCTGCAGCTTTC
ATGGTGAACACACTTGCTAGCAACCGACACACATGCCGACCCATAAAATGAGAATATAGT
TCGCCCACACCATCTCGGCCGTGGTCATGCCATGGATCACTTGTCATCAACGTTGAGCAT
GTCAGCCTACATCTTCTCAAGCCAAGACCGCTTCCCCGGAGAGATCGTGCTCAAGTCCAT
CTTCATGATATTTACCCTCTTCGTCATGCAAGCGAGCCGAACTTCTCTTGCTCTGGTGGC
TGCTTTGGTGGCCTCGGTCTCTAACATCTTCGCTTGCTTATCTGCCGCCAACGTGAGCTT
CTTATTTTGTATGTCAATGAAGGCCCTAATTTGCTCCTCCTTGTCTTGCCGACGCTTCTC
CTCTCTTGAATCCTTGTTGGAGATCATACCTTGCAAAGTAGCTTGCAAGGTAAGGGATAG
CGCCCGCGCTTGTTCTCTTTCTTGGAGTTGGTCTTCCCCCACGGACGCGACTTCTCTCCC
TCATCATGCTCCTCAATGGCTGGATTTCCCCCTACACGACTTGATGGTAGCGTATTGCGT
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CTCATATTGGACCTTGAATGCTTCCAAAGCTTTGAAGACCTACAAATGGACAAGCAACAT
TATGGACGAGCGAGCTATGGGACAATCAAATAAGCAAGCATGTCGGCATACCATGTCTTT
GATGCCGATGCCACTCACGGGACGGGCCTCGATGCTCTCAAGGGTGGAACAAAACTTGTT
GCACTCTTGTTGTATCACCCTCCACCGCTTGCCGAGAGAGACCCACCCACACTTGCTCTC
CATTTGGCACAGTTTAAATTTCTTGCGCTCATGGAACTCGCGATGCACTCTTTGCCAAAA
TGCCGAAGCCTTTTGCTTGGGGCC
