Map Locations of contig_39961 (7923 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_39961

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55433 1 514 bp AK365301 Not available Available None
MLOC_55432 1 461 bp AK354869 Available Available None





CDS Structure of MLOC_55433






CDS Structure of MLOC_55432






Contig Sequence (7923 bp)

>contig_39961 7923 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACCCCAACCTTCACCCAATCCCTTCAAATCCCCATTTATCCCCAATACACTAGGTAGGGA
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CCATACCTATATAGTTTACATTCACATGGACATTCTTTTAACAGTAATTTATTTTTATAT
CTTTTTTTCTTCATTCTTAAACTTGCATTTTCTTCTCATTAGTTATAGATATTTTTTAGC
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TGTCTGCGAGTTTCGTTCTCTCACGTATTGACGTCCAAACACTTCTACCATGACAGTTGC
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GCCACGGCACAAACGACCGAAGACGGTCTTGCACATTCGAAAACGCCGACGAAAATGGTC
AGAGAAGAATGCATCCGAGGTAAAGTAGTCGGTCATCAGTGTTAAATGAGAGCGCGCCCT
GTTGCAGTTTAGCACTCGATGACCCGTGATCGATCCCTTAAAATTAAGAACTTGCTCCTC
TGCACGGTCTGTGTCTTCAAGGACCATCTGCATCATCGTCGTCTCATCCGTGTAGTCCTC
CTCGTCGGACGAGCCATTGGACGACTCAACATAATGCTCGTATATGTATATGCACATATC
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AACGATGGCGGAGGATAAACGGGGTGGAGCCCGGCTAGAATGCTGGAGGTGACGGAAACG
TAGAGTTGTGGCAAGGGTGTGGTGTAGCAGCCGGTGATTGTGTCCTGAACTAGGGGGGGT
ACTCACCACGTCGTCTTCCGATCAGGTGAGTCGGGTCGAGGACCCCTATGATGGTTCCCT
GATAGGGCATTTCAGACAGCCCATGATGCATATAAGGGAGATTTCACAAGACTTAGCACA
CAAGACAAGGACTCCTCTAAATTCTACGCCTCCAACACATTATATAAGCCGATCTCAGGC
TAGTCAACAGACAATCTGATATTCATTACAACAATTACGTGGTAGATATCTATACTCAGT
ACTATCTCTCATATCAATACAATGAACAGCAGGACGTAGGGTATTATCTCTTTGAAAGAG
TCCGAACATTGGTAAAAACATGTGTCCATGTTACCATCGCTTTAAGACGTCTAGTTTGGG
ACCCCTACCTCGAGATATGTCGGATTTAACACGGACACCTAGGACGACGGAGCGGCGGTG
AAGATAAGAGAGAAAGAAGGAAGGAGAAAAAATGAAAAGGATGAAGGCATGGGTCCGAAA
AGGGTTTTGGATGGACCGAAGGTGTTGAAGGCTTACTTGTCTCCTTTCCGAATTCTATAA
AGCCTTCCACATTTTTCTCGTGTTGTCCGGAAAAAAATAGGTCTAGACCCTCGATCCGAA
CTTATAGGAGCGGATTGAGGGTTCGCCTTTGGAGATGACCTCGTGAAACATACGGGTCAA
AAGCCTGTTTAATTTGGGAGAGAGCATATATGATATTTTTTCTGAAACTTAACACACATT
CACAATTATTGTGCATTTTGAAACGAAAAATTATGAAAACACAAATGCAATTAAGTTGGG
TGGTGCATGTATGTGTTGTTAGGTGTTTTTCTGGTGGCTGCCGGCCGGATCCATCCATCC
ATCCATCCATGCCTGACTGTCACTCGGCGCCGGCCGGTCAGGTCCACACCCATGGCCATG
GCCATGGTCCAATTCATCAAAGCAGATTACAACAACAAGCTGCCCAAACAGTAGCTCCTA
CAGTAGTAGTAGTCCAGCCTCTCTTCTTCCTCATCTCTGAATCATAAAAAGAAACGCAAA
ACCGCGAAGCTTCCTCCCATCTCTTCTTCCTCTTGCATTTGCACATATCATATCCAAGCT
TTCTTTACTCACACTAGCAGCTCAGCTTAGCTTAGCTACGAGCTCTGCATGCCAACACCA
CCTCGTACCCACTAGCCGTAGCAGAACAGCGAGCAGCGCCATGAGCAACATGTTCGGGGC
CGGCGGCCATGGAGGTGGCGGTGGGGAGCAGCATGGAGGAGCCGACGGCACGGTGCTGTG
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