Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_39813 (6440 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_39813

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55265 3 1301 bp MLOC_55265.2 Available Available LOC_Os02g18690.1, FRAME:+3, EVALUE:3e-54, 13102.m02094 protein BURP domain containing protein, expressed
MLOC_55266 1 203 bp MLOC_55266.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_55265






CDS Structure of MLOC_55266






Contig Sequence (6440 bp)

>contig_39813 6440 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTTAGGCCTTTAGTCCCGGTTGATGAACCNNNNNNNNNNNNNCTTACGGGCCGGGACTAA
AGGCCCTGTCCCCACTAGTGCATATGTAGCAGCGATAAACTAAAGAAATGAACACGGTAC
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GTGCAAATGTTTATAAGGTACTCCCTCTGTCTCAAAATATGTGTCGTTGATCTAGTACAA
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ATGAATGTATCTAGTCATGTATTAGTATTTAGATACATCCATTTTAGATAAAACTAAGAC
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AATGTGTGAAGTCTGAAAATAAGCTCTTAGTTTCGTACCGGCAGAAGAATTCTATATGTA
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TGAGGTCTTTTATTGCCATCGGCCGAAAGAGGTTCAGTCTTTGAGGGTGCAACTCAAGGG
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CATGCCTACCAATTACATCATGTTCTATTAGATATATTTCAAGTTTCTGTTGTACTATGT
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AATCACCACCAGCTTCATGAGTCTTTGGACCGCTACTGATCAACATATTCTTTTGTTGCA
TCCCAGATAACTCTAATTAATTAATTACCTATGTTTTTTTGTGGGTGATTACCTTTGTTG
ATGCACTTGAGCATTATTACTTTTGCATCTCGCCGCTCGGATGAGCCGTTGCCGGCTTCT
GCCAACCCGCCGGTGGTCCAAGAGAGGTGGATTTGTGCCATCTCAATCATCCCTTGTCGG
TGCAGATGTGCACAGGTCACCTATGGGACCTTCGGGCCCCTTGTGGTTCGACAGGGAGGT
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GGAAATGAAGTTCGCACGGAGGTATGTTCCGGCAATGGTCGCCGGGGAGAGCTAGCACAG
GTGAACGCTTAATCTACCAAGCGTTAAATATCTAGGCGCTCAAATGCCTAAAGATCCGAA
TCGTTTGTTAGGTTGCCTCGGGACTCCTTTTATAGCTAAAGAGGCGTCCACAGATAGGTA
ACAGTGCTATCATACCTAACTCTGACACTTAAGACAGAGCTCCATAAATGCGACCTTAGG
TGGCGAGCAGGGATGCGTTCCCGGTAGGCTTCTGCCACCCATGAACTCGCCGTGGCTTGA
GGTCTTGACATGCTTCTAGACGGGTGTCAATAGGATGCAACCTGTCTTCCGGCGTGGCGC
CACGTAGCTAGCGAGAGCNNNNTAGCCATCTGGGGGCTCGACACCTCCTCAACAAGTGAA
TGGTGTAGCGATCAGGTGGAGCTGTGGCAGGCTGGCCTACGCCTGCCGGGGAGGCTCCTT
CCCGGGTCTTGGTGAGGATGATTCGCCTTCGCTCTCGGCAAGTGTCGGGGTCGTTAGCGC
GCATTGGACTCTTGGTGTTGGTCTTGATGAAGTGGTATTGTTCCCTGACAGTCTTAGGTC
GTCGGGCCGGTAGCTTGTCGTTTGTGCACACGTCAGGGGAAATAAATGCCCCTGTTTGTG
TACCCCGACAGAAGCCCCTCAGCCTGAGCCATACGTATTGCTGGGAATGTTGGGTTAGGA
TCCCCCAATGCACGGACCCGTGTCGAGGAACTGCTACTCCTCCCATGACCTACGTCCACT
TCGCGCATTTAACGCAGATCGTGGGGGGTGATGACCCACAAGCGTATGGGATCGCATCAG
TTTTCGAGGGTAGAATATTCAACCCAAATTTATTGATTCGCTCACAACGGGAAGCTAAAG
AATATTCTCAAGTATTATCA