Map Locations of contig_39594 (10419 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_39594

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55033 2 3265 bp MLOC_55033.1 Available Available LOC_Os06g04560.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13106.m00415 protein kinesin motor domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_55033






Contig Sequence (10419 bp)

>contig_39594 10419 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACTCCGCCGCGCCCCGCTCCCGCTTGCCCGCCCCCTCCCCTCCCGCCGGTCCCCGCCCC
TCCCCGGGGTCTCTGACGCGGACGCCGCCGCCGCTGCCTATAATGGCGAGCGGCGCCAGG
AACGGCGGGCTGGGGTCCAGGACGGCCGCGAAGATGGACAGGCAGCAGAGCTCCACCGCC
ACGCCCAAGGCCCCCGCCGGGAAGCCCCGACTCTCCGCTGCCTCCGGCGCGTACCGCCGC
ACCAGCTCCGGCCCGCTCCCCGCCGCGGGGGGCCGCAACTCGTCCGAATCCGGAGGTTGG
TGCCCCCGCTCCGCTCGCATCGCTTCAACGGGATCCGGATTTGGATTTGCTGTCATCGTT
ATCCACGGGAGGTTTGTTTTTGGGGGGTTTGCGGTCCGGTCCGGTCCGATCCGCCGCATT
CCGCCGGCCCTCCGCGATCCGGCCTGCCCGCTTTGGCCTCCGGATTCCGAATCGCCGGCG
CGGGCGACCGTGTCTCTGTTGGATGGTGCGATCGCTTCGGGGGGAACCTCTTCGGATTTG
GATTTTGGACGGCCGTGTAGGCTCTGCTCCTTCGGCGCCGCCGCCGCCCGCGAGCTCGCC
TGAATGACGGCCGTGTGACGTGGCTCCCCAGCCACCTCTGCACCGCCGCCTGGAAGCTGT
AGAGAGAAGAATAAAATGGTTGAGATGCGCTTGGTGAATGGGTCACAGTATCCTTGGATC
GCACCATTCCTCCTGCTAAATCAATGGCGGATGCCGTGCTGGTCGTTTTTCTTTTCGTTT
CTTTTCACATTACAAAATAGAAAACGCTGTTTCCTCGACGGGAGGACATTGCTGATGCAG
CCTTAGTTGTGCTTGGACCATTGCTGTTCGTCATCCAGCTGCCTCGTGCACCACTCACGA
CGGCCCTGCGCCCAGCCACCACGGCGCCACCTACCCTTCGAAATTTATTTTGTACAGTTT
ACAGTAACTGCGAATGGTACTGAAGAGCACGGCTTGGTAGATGTGCATCCATAATTTTCT
TGAATGTTCCCCTGTTCTTCTCTTACTGAATTGTGGTCCGCATTCAAAGTAGGCAATTGG
CTTACCATGTCCGGGAAGTGCCCTGTGATTGCAGAGCGAGAGAGATCACTTTGTGAAATG
GAGGACACAATTTTCCTATCAGAGATGAAATAAATCAATGCTTCTTTTGCTAGATTTTTT
ATCGCACGCTATGCTTTAAATTTGGTTGACATGGTCATTCCGAATCCGTAAGCAAATTTG
CATGCGTGCGTGGTGATTTTGATTTGACCTGGAGCGTCCGCGTTTCTTTAATCAAATGAG
TTTTGCCTCCCCCATTTTCCTGCAGTTTCAAGCAGAGTTAGAGTTGCTGTACGGCTAAGG
CCTCGGAACGCAGAAGAGCAGGCGGCGGATGCTGATTTTGCCGACTGTGTTGAACTCCAG
CCAGAGGTTTGATCTCCTGTTTAGCATACTGCGCGAAACAAGATTCTTTCAAGTTTCCTA
TGTACTCACTGGATGAACGTTTGATGTGTAGCTCAAAAGACTAAAGCTTCGTAAAAACAA
TTGGGAGTCCGACACATTTGAATTCGATGAAGTGCTTACAGAGTTTTCTTCGCAAAAGAG
AGTGTATGAAGTTGTTGCTAAACCAGTTGTGGAGGTATGTGAACTTCTAACCTTTATCAT
TTTAACCTTTGGAGTAAAACCTGTTCATCCTTTCTCGTTTCCATGACTCTATGTTACATC
AGTAATCACAGTAGCTTGTGCTCTTAGTGAAACCTCTAAGAAACAACATACGTTTGCATG
TTGCAAGCTTGTTGCTCTTAACCTTATATTTTTGTGGATAGATATTTAGCAGAACTTCAA
ATGACTTTTGGCATGGGTGTTGACATGTAATGAAATCCGAAACTTTAACCAATTAGCTGA
CATGATAGACGAAACCTGGAGTTGAACTCTTGGAACTTTCTAATAGTGCCATAGCCTTCA
GTTTTACTCCTGCCATTTGTTTATTTTTACCAATAGTCCAATACTCCTGCTATGTGTTAC
TTTCTTACCAATGTCAACGATGTCCTCGTTCTGCAGAGCGTTTTGGAGGGATATAATGGT
ACAGTTATGGCATATGGGCAGACTGGTACCGGCAAGACTTTTACGCTTGGGAGGCTTGGT
GATGAAGATACTGCTGCACGGGGAATCATGGTCCGTGCAATGGAGGATATTCTTGCTGAT
ATAACCCCTGAGACTGATACAGTATCACTATCTTATCTACAGGTTTGTGATGCTTGGCTT
CTGTGTGATTTTATCTTGTGCCTTCGTTTTGAATTTGTGCACTCTAACTTTATACAGTTC
TCTGACCTAACTCTGTATTGGGTTGTCGATGCAGTTGTATATGGAAATGATACAAGATCT
CCTTGATCCTGTAAATGATAACATAGCCATTGTAGAAGACCCAAGAACAGGGGATGTTTC
GTTGCCTGGGGCCACTGTAGTTGAAGTTAGAGACCAGAAGAGTTTTATGGACCTTTTAAG
GATTGGTGAAGCTCATCGTGTTGCTGCAAACACAAAGTTAAATACAGAGTCATCTCGTAG
TCATGCAATTCTCATGGTAATCTTTATGTTCTTTGATCTTGCTGCCTATTAGCACATGAT
TACGACTACTGTGGTTATTTTTTTGACCTTCTGTGATTATCTTTGGTGAAGGTAAATGTC
AGAAGGGCTGTAAAAGGTAGAAGTGAAATGAATGTTAGTATGTCTGCTGAAAATGGGCAT
TCATCTTCAATGATGGACTCTCTACGACCACCTATTGTCAGGAAAAGCAAGCTTGTAGTT
GTAGACCTGGCAGGATCGGAGCGAATAGACAAATCTGGTAAGTGCATTCTCATCGATAAA
ATTTGGCACATTTTTTCTTAAAAATGTCATGCCCTCCTACAGTTTTATATCTTCGTCTTG
AGATAATTGTTTTTACTGTAAACTGCAACCCTGTAGAGCTGAAAATTGATGTTGTGCAGG
AAGCGAGGGTCATACATTAGAAGAGGCGAAGTCTATTAACTTGTCCCTAAGTTCACTAGG
AAAATGCATCAATGCACTTGCTGAAAGTAGCGCACATGTTCCTGTTCGTGATTCCAAGCT
TACTAGGTTGCTTAAAGATTCATTTGGAGGTAAATTCCCTTGGTTTGGTCAAAAGCGAAA
ATGATTTGACATAGCTAGGTCATCAGCCATCTTTTTGCAAAGCTAGGAAGGCTTGCCTTT
GTGCGCCTTGTTGCCTGTAGGCTATCGCAGTAATTTGTTCTCACAGATGTGCTTCTGTTG
TTGGATTTCATAGGCACTGCAAGAACATCATTGGTTGTGACGATTGGTCCGTCTCCAAGA
CATAGGGGGGAGACTACGAGTACAATAATGTTTGGACAAAGAGTATGACCTCGCACTAAG
ATGTATTTAATGGTTTTATTCTCTTATCTTGACCAACTGGCCATCTCATGATTCCATGGA
AGTGTAGGGAAACTATTCTGATTTGCTTTGTTTCTGATTTGCTTCGTTTGTGGAATAACA
TTTACTTTCATGTTTCATTCTAGGCAATGAAGGTTCAGAACATGGTGAAATTAAAGGAAG
AATTTGACTACAAAAGTTTGTGTAGGAGACTTGATATTGAATTGGACAAGTTAATCGCAG
AAAATGAAAGGCAACGTAAATATTTTGATGATGAAATTGAACGAATAACAGCAGAAGCGC
AATACCGTGTTGCTGAGGCTGAAAAGGAATGCAAAATTTCTTTAGAGGTTTGCTTCCATC
ATAATGTTCTTTTACTTCTGTTTTGTGTGCGTTGAACTCCATGAAGGCACTATTTCTAGG
AATTTGACCGTGCTTCTTATATGCTTTTACCTTTAGTTAGAGAATAAATATAAGATCTGG
GACATCAGTAGTCTTAATTTCCTAAATTCCACAGATAAGCTTGGTTCTAGGTCTCCACCA
TAAACTAACTTCTGTTTTGTGTGGTTTCTGATTGCAGAATGAGAAAATGAAGTACCATCA
AGAATACTTGGACTCTATAAAGATACTAGAAGAGAAGTGGAAAGTACACCAACAATCACC
CAAGAAACAGGTACATTTGTACATGATTAGATCAGCTTTACTTATTGATTATTTGGTCAG
TTATGAGTTAATCTTGCAAAACATCAGTTATGATGAAGTGCCACATCTTTTGTTGTAAAA
TCTGAAAATGATTACCCATGCAATTTTTGAAATGTAGATTAAAGAACCCGAGCCTACATC
AAATGGTGACGTGCAGGACTTACTGCAGAATGAGAAAATGTTACGCCAATCTGCTGAAGA
TGAGTCCAATGACCTTAAGAATCAACTATCGCACTGGAAAAAGATGGAGGTACTGTCAAT
ATATATTGCTAGAAAGATGACCTTAAGCATCAAGTATCGCATTGGAAAAGATATATTGTT
TTTGAAATAAACTCGATCCTCAGCTTCGCTGCTAACCATATTTTCGTGTTATACAGGCCA
CAGCTACTGCTGAAGTAGTGAGACTCCGGAGAATGTTGGATACTGAAGCTAGCCAAAAAG
ACAAACTCGAAGAAGAAATAGCTGTTTTGAAAAGTCAGTTAATGCAGTTAAGTCTGGATG
CTGATGAGGTAGGACTTATTGCTGATGCTAGTTTTTATGTTATTAGTAATGTTTCTGAGT
GATGTGAAATTGTTATTTTTAATTCAATAAGTGGTGTATCTATTGTCTGGTATTAATTTG
GTGATTCCCTGTCAACAGCGCAATTATTATTCTTTATGAATTTTTCACCTTGTAAAAGCA
TTATTAAGTTCTTTGGCTAGCCAATTTTAGTTGAAGCAAACTCATAAATATTACTTGACT
TGTAGCCTTCCCTATTATGTTGAATATAGTGTCTTTATTCAATGCATCCAGCCATCTACA
ATTTGTTGGAACTTGTTTCCCTTTTTTACTTCTAATGAGTACTATAGTGCTACCCTAAGG
TCCATAATGTGCCTTTTCTTTCGTTTCAATCAGACAAGAATGAGCCTTGACACAGGAGAT
GGACCAGGAAAAATATTTCCTGGTTTAGATTCTTTGATGTCTCACTCTCGGAATTCGCAG
CCTAGAGAGCAGAGCAATGGACCTAAGGCGCCAGTCGCTAAACTCTTTGAGCAAGGTATT
TATTATTTATTTGCTGTTTCTCGAGAATGAAATCTTGCCTGCAGTGTTGAAAATTTCAAA
TAGTCGAGTTTCTTTTCCTGCCACTGATTTTGGTTCTACACCTGACTTGCTCATGATTGC
CTTCCAAATTCTGCTCTACTTGACCCTCTTGTTCTTTAAAGCATCCCCAAACTGTAAAAC
CGAATGATTAGCTTAAAACTATTACTCTACCAGTTATTTCCCTGGCTATAAAAAGTGGTG
CAAAATAATTCTGTTTTCTGAAAACAAATGATAGTCCTTAAGTGTGTTTTGTGCTTCCAA
ACTTACACAATCATGGCAGCAGAACAATCAGATCAGATGTGACACATTTTGAGGAAATAT
TTTGTAGTATACTTACACATGCATCATATATAGTGACGATAATGATAAAACAATACTGTA
TGATCTTGTGAATCAATACAGCTATTGTGAAATCAAAGGCAACTATGAGAATATTGATTT
AAACCATTATGAAACTACTACAGCGTTTCGTCCCTGTTTTTAGTCTTTACTATGACTGTC
ATTTGAATTGATTGACATCTCTAGAGTGTGATTGATCTTTTGATGGAAGTTTCCCCCCAA
TCTGTTTCAGTTGGGTTACAGAAGATATTGTCATTACTTGAGTCGGAAGAACCTGATGTT
CGTGTTCATGCCGTGAAAGTTGTCGCGAATCTGGCAGCTGAAGGTATAAGCTTCACATTT
TTTAAAGCTGCTACATATTGTTTTACGTGCCAGTGTTGCATTTGTTGTATGTGTATATTT
TCCAGTCATCATATATTTGAAGTTGATTTTTAGGTATCATCATTTGCTGCATGTTGCTAC
ATGTGGGTATATGTAGAGCTGTTTGTTATGCGTGATGAAATGATATTGCTCCCTCCGTCC
CAAAATAAATGTCTCAACTCTAGTAAAACTTTAGCACAAAGTTGTACTAGTTGAGATACT
TATTTTGGGATGGAGGGAGTAGTACTTATCTATAAGCATGTTACTGATCTCTGGATTACC
TCCTGGTTAGATATTATGATATTGTAGCATTGTTTTTCAGTTTCTACTTCAATTTAACCC
TGGCACTAAACATCACTGGTTAATGGGAATATGTATTTTTTGGTGCGACATCTGATGCTT
GCTTGCTCATGTCGATTCTCACTCTTTGGACACAACTTGCAAATAGTTGCATTTATTTGC
TGAACTTTGCCCCGAACATCATATGATTATGCACTAATTTCACATAATTGTGAAGTAACT
ATATTTGGCCTTCCATACTTCAGAGGCAAATCAAGAAAAGATTGTGGAAGCAGGTGGCCT
CACTTCCCTCCTAATGCTGCTTAGGAGCTCTGAGGATGAGACCATACGCCGAGTAGCAGC
AGGAGCAATTGCTAATCTTGCAATGAATGGTTAGTAACCCAACAGTATTTTGGTTTTGTA
ATTCACGAATATTAGGTAGTAATTTTTTTTTTCTATGGTAGAAAATGTCTTCTTATCTTA
TTGTGATAATCTATATATGCAGAAACGAACCAAGATCTTATAATGGCTCAAGGTGGTGTA
ACCTTGTTGTCAATGACAGCATCTGATGCAGAGGACCCACAAACTCTAAGAATGGTGGCT
GGAGCTATTGCTAACCTGTGTGGCAATGGTAACTATATTCTGCTGGTTTGCTGAAGCAAG
CGCTCTATTATCTTATAAGAATTTAACGTGCCAAAACACATGCAAATTTTAGATTACTTT
TTGGGAAAAAAATAGATTACTTAAAGGCTCATGTAGGAGCCTACATATTCTACAAATAAT
TTGATGTTTACTTGGACAATACATACATCATTTCTATCCATGTGGCTATATCTCTAACTT
CACATTTGTCTTGAACCAGACAAACTGCAAACTCGTTTAAGAGGAGAAGGTGGAATTAAA
GCATTGCTGGGAATGGTTAAGTGTGGCCATCCTGATGTCCTCGCTCAAATTGCTCGTGGC
ATTGCAAACTTTGCAAAATGTGAATCTAGAGCAGCTACTCAAGGTAAATGGATTGATGGC
GGGACGGACATGAATTTTCAAGTTCATTCAAACTTTGTACGATATCCCTGCATTATGTGG
AGACGCATATTAGCTAGACCCTTGATACTTTGCAGTCCCACGTAATTTTTCTTTTGAGAT
CGATCTTTTATGTTACTAAGATATGCATATTCCTATTGCATCAGGTAACAAGGTGGGGAG
ATCATTATTGGTGGATGATGGGGCACTTCCTTGGATAGTAAAAAACGCGAATAATGAGGC
TGCCCCAATTAGGCGGCACATCGAGCTTGCACTCTGCCACTTGGCGCAACATGGTTACTC
CTCTTTCTCTCTCATACAACTCAGATAAACTGGTACTAGCAATTGCATGTACTTATGCTT
ACGGTGTCAATCTGGCCTTCTGCAGAGGTAAATGCCAAGGATATCGTGAGTGAAGGCGCG
CTCTGGGAACTTGTTCGGATCTCGAGGGATTGTTCTCGGGAAGATATAAGGATGTTGGCA
TACCGCACGCTGACATCCAGCCCAACTCTTCAATCGGAGATGAGGAGATTGCGGATAGAG
TGTTGATGAATCAACGTAAAAGGATGCAAGTGTGCCTCATCCTCACACCGTGTGGACTTA
TGTTTCTCGCCCAAATCTCCCAAGTTTAGTAGAGGCGCTGCTGTTGGGCAAGCACTGGTA
ATCAGGCGCGTCGGCCCTTGATATGCCCAGCTTCTGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCATA
CATGGCCAGGCCGGGCAGCGGACCCGTTGAGTTTGGTCTGCGCCATCATTCTCCCCAAGA
TGATTCATTTTGTTTATGGCTGGGATTCGTTTTTCAAATCCTAGCGTGTGAGAGCTTTAC
TTACCTGGATGTAACCTGTAGGAGAATCTGTGTTGTAAAATCCACGAGCATGGTCGGGAT
ATGTGCAGCTGAGTGGCTTGCAGTGCAGATAGGTTGGCTTGGGTTGGGCCGTGGCATGGA
TCATACTTTGTATACTTGTATTAATTGTACAGTAGACAATCTTTTGACTGTAACTTTATA
TAGTACGCGAGGAGGGTGCTGATAATCGGTAGCTGCTTCCTTGCCGTCTCTGTTTGTTAC
AGGAGTGTTTTTTGCGTGTAGTTGGCACTTGGCAGATATGGTCGTGTCTGCAGCTTGAGA
ATTACGAGGACTGTCTGGTTCAGTTTCGAGAGCAGCTAAAGTAGTTACCTAATAAGATAG
ATGAATATTCCAGGATCTATGATTATGAAAATCTTATTACAGAAATCTAGTTCTTTCTTC
TTTTAGAAAAGGAAGTCTTGCTCTCCTTTCTTGCTGCTACTTGCGTTGCCAGCCAATCTT
CAAACTGTTACGGAGAAGTCGTTTACTGATTAGCTGCTTGAATGTAGCCTTTCTTTTCCT
TTCAGAGCCTATTCGAAAGAGAATTTAGTACCTCTCGGTCCTAAATATCAGAATAGGACA
AACGAAACGAACCGGCCTTCAGGGATATCTTTGCTTTGGAAAAGAACCCTGCAATCAAAT
AGATTGTCCCAAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAGTTATGCTATTGAAAATTCGTTTG
TCTAATAGTTTCGATTTGAGCATTTCGTTTCCTTTTTCAAACTCCACTTCTTTTCATATA
GCAATCCCTAATCAAAGAGAGAACAATATCCGCGTTGCAAACGGTGCTTGGGAGTGCAAC
TAGATATCAAAACTCCCCAACAAAACACAGAGCTTGGTCGGCAAAATTTGTTGATTTCCG
GGAGCATGTCACGAAAAACTTTCAGTCTATGCACAAAACTTCAGTGGATCTGCAATCTTC
TCCGTCTCAATTCATTTCAACTTCTCGAAAGCCAAGAGAAAACCCACCTGACATTGCTGA
AGTTGGGCAACGTAATGTGAACAATATCACTCCACCACCACCATCCAAACACCCCTACAG
AAGAATTTATGACTCCTCAATCTGTTGGTTGGGCAGTCCTGCATGATTAACAAACGGACC
GAGAACTTCAGCTTGATGGCAGTAGCAAAACCCTTCACACGCATCCCTGCTTTGCTCGAA
ACCAATCATGCTCCTCCTATTGTTGAGCAAAGACCCGCTACTATTGCACAACAACATCTA
GCACTACAAAATACAAATTGACGTGGAACAAATAGAAGGCAAGGAGGAAAAAAAACACTA
CAAGAGGAATGGCTATGCTAATAGAGAACTACAATTTGAAAACAAAAGATTTTAGGCTTT
GTTAAAACCAACCAAGATGAACATACATGAGTTTGAGGGCATTGGGACTGATTCCTGGAT
TCAAACCAATGAAATGTATTTTTAAAGCAACCAGAATCCCGCCATAACAAAAAAAACATA
GATTGCTGTCGCTCATTTGAAGGGTGATGATATGGAATGGTGGAGATGCACATGAATTGA
TGCTAATACACTTCCATGGTACATATTTTGCAAACACCCGGGCGAAGATTTGCGGAAATG
TTCATATGTAACAATGTCACAACTTTTCATGCCTTGACCGAGACTAGCAGTGTCAATGAT
TAAAACATCTACAGCCGGACCCCTCAAATGACCTCTCATACGCCCGCGGACGCGCCCGGT
CAGTAAGCGGACAGGAGAGAGAAGGAAAAAAATGACCCAACTGGACCCCTCATATCGTCC
TTATATGAGGGCTCGTATCCATCTCAAATATGAGGAGGATATGAGGGTTCGCGGACGCGC
CCGTGCGCGCCCGATCAGTCCGCCACATAGGACGCGACCCCACCCCGGATCACCTTTTTC
TTTTCTTTATTCATTCTTTTATTTCTCTCTTCCTCTCCACCAATCACGTGCAACTGACCA
GACATATGAGAAAGAAAATAAGGAGTGTGGCTGCACGGACGGACAAATAGGGGACACACC
CGGTCACTGATCGGGCGCGTCCGCGGGCGTTTGAGGGCCCGAATTTGCAAGTCGTGGCTG
AAGATGCTCTTATATCCTTAAGTTTGAACATAATATGAACTTAATGAGGGGTGACAATCC
GGCTTTCTCTAATTAAAAGTTCACTTAAGTTTGAGCCTTTACAGTTTTGGCACGAAGTTA
CTCTCGCTGCCCATCTTCAATCGACGCTCCTCGCTTCTCCACACTTCTTCATGCGTTAGT
GTGCAACGAAGGTCGTTGATCTTCTATTGGTCGGCTACGACAGACCAAAACATCGTTGTT
GAACTTTTTGGGCATAACTGTTAGAGCATATTTCTCCAT