Map Locations of contig_39569 (11358 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_39569

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_55011 1 3148 bp MLOC_55011.1 Available Available LOC_Os06g34440.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13106.m03557 protein dnaJ domain containing protein, expressed
MLOC_55012 1 302 bp MLOC_55012.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_55011






CDS Structure of MLOC_55012






Contig Sequence (11358 bp)

>contig_39569 11358 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATTTAGGTACGGAGGGAGTAGATTTTTTGTTTCTCTGTTCAATTGGACGAAAGAAACAG
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ATCATCGTGATGCCGCTCGTAAAAGTAAATGGCTTTGTTAGCTTATTTACGGGGTTGAAA
GAGGCAACCCCTTACGTGATACCTCAGGATAACACGCTAAGGTTTTCACATTGTGTCCCT
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GCGCGTGATTTTAAAAATTGTGACTATGAATTGGTGGAGATATTGACCCGTACTGATTCG
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CCTTGAGTTGTTTGATTTGAGGACGGGGGCGCTTGAGCGTTTTTCCCTTTCTGAAGTCGT
TGTTGTTGGAGAACCTTTCTCGTTGTACTTGTGATGTAAATAGATGGTTGATATGGATAT
GGTTGATGTTACAGGTTGTTGATCATTGTTTTGACCGTTTCAGAGGTCCCTTCTGTTTTT
TTTACTCCACCAAGCCATGGCTTTGGTCTTGTATGAAATTATATTTGGCAATGTAATTTT
GTGCGTGCGCGTCGATGTTTGTGTGCATCCTACTTATGCAGAGGCTGTGTGTGCATTCAT
TGTGTTTGTATACTTTTGATGCTTCATTATGAGTTAATAAAATTCGCCCTTTATCGAAAA
ACAACAAATGGGGGAGAAGAAAGGGAGGAACCTACGAACTTGCAGAGCATACAAAAAATA
TGTGAACATTTAATCTATATGAAGAATGGAAGAGAAGCTCATTAAAAAGAGATGTCAAAA
TAACTTCTTTATCTGATATAATGAGTAGATATGTCACGAGCAATTGAAAGACATGGTGCC
CCCTGTTCTAGACATGCATACAAGATGAATGCGTAGTGGTTGGCGCTCGCAATTTGTGCG
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GGTTCATCATAGGACTTACTTCATGTACATACAATATTTGTGCGATTTGAATATCTGAGG
AATTGGAGGAAACCAAAAGTTGGAAAGCACATGGTGGAAAACATATAGATGGTTAGGCAT
CTAGGCCTGTTTTGTCGGTTGTGACACTTTTTGATCTACTTTTGCTTCTTAAATGCTTTG
TTCGAGACTACGGTGGACCAGGATCCGTTTGTTTATTTTAATAAAAGAACCGTATGCATC
GTGCTGATGCAGAGGCAGGAGGTAACACTCATTTAAAAAAAAACATGATGTACTTCGGTT
GTCACTGGTTCCACATTCGAGCCCGCCTTCCGTTTGCTTGAATGTACTGTAGTAATCAAG
GAGCCTAAAGGATTTCTTACAGGCTAGAGCCTAAAGGAATTCTCACACAAGCAAAAGCAT
CGAATTACTTTTTCCTAGTGCGAAAGGGTCGGCCAATGCTGAACTGGGAGCAGCGCTTCC
ATACAATCAAGAGAAAATTCCTTATCTAACACTATGTTAAATATTGGTTCCCTATTTAGC
ACTGAAGAAATATTACTTCCTTATGTAGCACCGAATGTAAACATTATGCCTTATCTAACA
TTTTTGTCCATTCTGTTAGCCCATGCCGTTAAAGTAGACTTGCATTGACGAAACTGCCCC
TGCCCATAGGAAAAAAAGAAACTCCTGGCCGAGCGATTCCTCTCTCTCGCGCGACGCCTC
TCTCTCTCACGGCACACCCAGCCCACCTTTCCTCGTCCTAACCCTAGCAAGAGCGAGATG
GACGGCGGCGCTCGATCCACACCAGAGGGGGCCGGCGAGGGCGTGACCCCGGATGGATTC
GGCGAGGACGCCGGAGGGGCCGGGGCGAGGCACGACACTGGAGGAGCCGGGGCGAGGCGC
GGCGCCGGAGGGGCTAGGGCGAGGCTCGACGCCGGAGGGGTCGGGGCGAGGGGCGACGCC
GGAGGGGCTGGGGCAGGG