Map Locations of contig_39514 (7314 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_39514

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54939 5 2749 bp MLOC_54939.5 Available Available LOC_Os02g04040.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13102.m00405 protein RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_54939






Contig Sequence (7314 bp)

>contig_39514 7314 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGTGGGGAGGGCGACGCGGGGAGGGGGGAACGTTGTTAAGAGTTGATGGGACTAACGA
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GTTTCTATTTCCTTTTACTTTACCCGCCAACTTTGGTTCTGTTTCTTTCACTTCTAGCTC
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TGTGACCCAGCTCCGTTCTACCTCTTTGATGAGATTGATGCTGCTCTGGATCCTCAGTAC
AGAACGGCTGTCGGGAGTATCCTTTTAATTATTTCTTTCTTTTGCATTTTTATCCTTGCC
ATGGAGGAACTTTTATATGTTTGTTCTTCCAACGAATTCAATCCTCCGTAATATCATGTC
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GGAGCCTTTGGATTGCTAAAACTTATTTAAGTATGCTTAGGGAGCATTTGCGTGATTGGA
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CTTTGAGTGAGAGCACCCCCTTCCGGTTTCGACAGCTCGCCTCCACCATCTCCTACGCGC
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CAGTAGTAGCCTTAAAAAAATAACACGCTGTTGTTAATTAGCAGTAGCGCTGATCTACTT
GAGCGCTACTACTAAGAGCTTAGCAGTAGCGCTGCTTGTCGGGAAAGCGCTACTATTATG
TGGGACCAGACGATGCCGCCGAGGGTAGCTGTAGTAGCAGCGTTGTCGATAAGCCAGCGC
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CAATTAGTAGTAGCGCGCGTCTGTAACAAGCGCTACTACTACAATAATAGCAGCAACGCG
TTCTGGTATGCAGCGCTACTGCTAGTTGCAGCTGGTGCCACCTTTCTACCCCTC