Map Locations of contig_39409 (10704 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_39409

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54793 1 1060 bp MLOC_54793.1 Available Available None
MLOC_54794 15 6061 bp MLOC_54794.6 Available Available LOC_Os08g43120.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13108.m04668 protein Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_54793






CDS Structure of MLOC_54794






Contig Sequence (10704 bp)

>contig_39409 10704 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGAGGGTTGGACCTCTAATTTTTTTTACGGGTTNNAGGGTTTAAGGGTTCTAGTCTACGT
CTTTTTTTTGACGAAAATTGTAAAAAACGGTTATTTTAAAGGGTTCGAGGGTTTGAGAGC
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GATGCTGCAATTCATGAAGCCCAGAAACAGTGCTGATCCATATACAACCCCTAGTATGTT
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GGCGCTGGTTGCCCCAGCTCATCAATTAGAAGCATGTTCTCCCTGCAGAAACAAGGTACA
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TAGCTTTACTATCTTATCTGGCTTACCTGTATAGGGAGGAGCTCCGGTAAATTTCTGCAT
AGTCCACTCCAATCTCATATTCTGTTATGTGTGAACTTATATCCAATACCCATGCTGCTG
GGTTTTGTCCCTCTTTTATTCTAGGAACACCAGGTATAGCCTATGACAAAGCAATTTTAG
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CTTGATCATGTTGCTAGATAGCGGACCTAATGGACCACTGTATATGATCTGACCACCTCT
TTTCATAAGCAAAAGCTGCATTTAGTCAAATTGAACTCAAGTTTAGAAAGTTAACTCTGT
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CATATGTTTGGTCAACGCGTGACTGGAAATGGAATGGATGCAAGTATTCAGTAAGGCACT
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ATTTAGGGCAACGGCATTCTGTGCGTAGGTGAATGGGGATGTCCAGTATCCCCACTGCAA
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TTATGCACTGGTTGTCCTCAAGTTTGCAATATAGATTTATTCAGTAGCTCCCTCTTATTA
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GAACAGAGGGTGATAAGAGGAACGAGATACATAGTAAAAATCATAGAATGCTTACCAATC
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GACAAATGTATAAATTGAAAAGTTATGAATTTACCTTGATAATATAGTTTGTTGTAAGGT
TGCTTCCTTCTCCGAAGGTGGTGGCCTGCAGAAAACAGATTTAAGTAATTGGGGAACTCG
ATGCCGGTGTTACCAAAATTGGCGGAAATAAATTTAGTAACCTTAATAAATGAGTCAAGA
TCTTGGTCCACTTTGTTGATGACACCTTTTTTCCTTCTTATTGCTTCTCCCAGCATCTCT
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TACCTTGAAAGAGTGCTTCTTGATTAGCACTGTCTGGGTTTGGATATAAATTAGCTCATT
CATATACTCCTATACCCAAGAGGGTGTCTCACCAAATTCATTATTGGTTCCCAACATCTT
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AATGTAGGCATGCAGGTATTGAGGTGTTGATGATTTCACTTCTTCTCCATTGTACATGAC
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GAGGAATCCAACTTTCCTGCCAACGCTTTTAAAAAAGTAGTTTTCCCAGAACCAGGTGCT
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GTGCTTTGATCTCCATTTTTTGTTAGATTGTTTTGGTCAGTTTTATACTAGGTTGATGTA
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AGGTAGGCTTAGTTGGGGCCAACCTATTTGTACCAGCATTCATTTTAGCAACTGCTCCCT
CCGTTCACAAATATAAGATGTTCTAACTATTTTCTGAATCGGATGTATATTAGACACGTT
TTAGTGTGTTTGTTTACTTATTTCGGTCCATATGTAGTCCATAATAAAATATCCAAAACA
TCTTATATTTGTCAACATAGGGAGTATTTGTGTAAACATATGACCATGTTTTTGTTCTTG
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CTTTAAAAAGCTGAATTAGTACAACACACAAACAACGGCTTCATTGATTACACAATTAAT
GCTGGGAGTAATCGTTGATTCCTTGATTAGGACATAAAGCTGAATTAGTACAACAAACAA
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CTTTCTTTGGTACTCCCTCCGTCCGGTGAAGAGTGTACGTTTGTCTTTAAATTTTGTCCA
CAAAAGAGTGTACTTTTATCTTTCCAATGCATTTTAAAGTAGGAAGATCAATAACATTAT
ACAAATGCTTCTCCTTCATCACACGGTAATCAAGATCAATAACATTATACAAATAGTCTT
CTTAATTTTTACATGCACTTAGCTCATTGGGGGTTAGATAATTAAAGAGGAGAGAGATGA
TAGCTTGCACCTTTCCAATATTTTTTTTGCTCCATTTTATAATTTGTCTTAAAATATCTA
TATGTACACTTTACACCGGACGGAGGGAGAGGGAGTAGGCCTTACCTAATCCATCAATTC
TGGATCTAAGAAAGAAACAGGACTATGTTTGATGATGTCAACATGATAGCGGATTAACAA
GGACGGCAGCTAAAATACTCAAGTGACCACTAGGATTTTCCACATAGCAACTTCACTAAC
CATGCGTTCCAATTTGAGCGAGGATTTGGTGCTCCCTTGTTTCTCACCGTTAGATTTAGA
TCCTAGGTGGTGTGTTTTTTTGAAGATAAGGTGGTATGGTAGGCGGACCGTGTGGCCAAG
GCACAGCATGCCTTGCCCCATATCATCCACCGTCCGAATCGATTCTACGGCTAGCAACAG
TTCACAGCCAAATGAAACTGAATTCTTAGGTGGGTAGGGGAAAAGGGCGCGGGCCGGGAG
AAAACTGCGGGGGCAGGCCGCCGCTCGCTCGCCCCGTTGCCGCCACCGCTCGCTCGCCCC
GCCTTTGTTGCTGTTGCCACCTGCCCCGTCGTCGCTGCCACTCGCCCGCCCTTCGTTGCG
GGCGACAACGGCGGGGGGGGGGGG