Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_39387 (6685 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_39387

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54771 1 1137 bp MLOC_54771.1 Available Available None
MLOC_54770 1 743 bp AK363628 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_54771






CDS Structure of MLOC_54770






Contig Sequence (6685 bp)

>contig_39387 6685 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCTCCCCCCTGCAACCTCAGGCGATGTCGACGAGCGCTGCATCTTCTCCACCGGCTG
CCGCCGCGCCTGACGGCGGTGATCGAAGGTGACCACACGAGATGCTGCAGCCGGGGCGAC
GGTTGAAACTTTTTTCATATACGGTTGAAGCTTTTGTGTCAACGTTTGCAACTTTTTCCT
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TTGGTTGAAGCTTTTTTCTTAACGGTTGAAGCTTTTCTATACACGGTTGAATTTTTTTCC
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AGCCTAGTATCCTGGCTGTATCCCTCTGGTATCCAAGTTAATTTAATTTTCTGGAAAATA
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GCTTGTGCATATGCCAGCCTAAACTTCATTATGCTTTGTTTAATTGATAATATCATTCTG
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GGAAGCAAAATCTTAGCATTGAACATTGTCGGTCGTATATCCTAAGCATTAAACATCGCC
GCGGCCACTACGCTCGTAAGTTCTGGTCAGCTGCTGATGTTTACTGCTCGCCCACGTTGG
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ACAGAGGAGGCTGACTCCATGGCTCTAGATCTCTCTCCCTTGAGATCTCCCGCTGACAGT
TACGCTGGCATCGACTCGAGGCCGGCGTGGCTATGGTTCGCTCCGGCCGCTCCGCCTGTA
GCGTCGATGGGCTCACATGCGCCACCGCCATGGGACGTAAGTGAGAGGTGCTGTCTATCG
AGAGAAGGGGTGGTTCCGCGTGATTCCAGCGATTTGGAGGAATGAGTTGATTTGGCATCT
AGGATGAACTAGCTGAATTTAAGCATGCGGAACATCGACCAGGTGTTAAGACTGAGCAGA
AAAAAGGACAATATATTGTTTTAAGTTTTTTCTGCTCAGTCTTAAACACCAAACATATTC
AGGCATGTCTGTCTATTTTCTAGTCCTTCCATCAACAAATGGCATGAATCTACCACTTCA
AGCACAGCAGAGTAGAACACTGGTGAGCCACCAAGAGGAGCAAGCTGGAATGCTTATCCA
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GCAGTTGCAGGTTGGAAGCATAGATAAAAACACACTTGCAGTTTGGAAAATGTTGCCTCC
TTGCCCTGTGACTGAAAATAACTAACAAATAAATGTATGAAACATACATACTCATTGTTT
ATAAAGCGTCCTGCTTCAGACGCTTAAGCGTCAGAGCGAGTGGTATTCGCTTTAGGTTGC
TTTACCGTCTTATGAACCATTAACTTACTGCAGTGCTAATGATTGAAGTAGGGGAAAGTA
ATTCTGCACTGTTAGTAAATTGCCCTGATAATTTCAATTGTACACCAAAAGTTTGTAAAT
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AAATTTGTTCAATAGGAAACTGTCGTGAAACCGAAAGGTAATTCATTGAGAAGAGTATGA
TGGGATGTTACATGCTAATTGATTTTCTGTTGATTTGCCTTCTTGACCATAGTATATGTA
CATAAATAAAATGGAGGAAATGCAAACAGACTTAATACTGGAGCCAGAGAAGAACACCTG
CATGATTTCAAATTTATGTACTTTCTGCACCTTCATTTGCACCGCTGTAAACTAAATATG
ATTACGCTAGCAGAAATTCTTCTATGAGAACCGGACAAAGAACATGATCAGTAAGTTCTT
TAGCTAATTCTTATGTATTGGCAATCTACCATAACCAACAACATAGAACATAGAAAGAAG
ATTCTAACCTTGTAGTATCAGGAGAACACATAGGGCCCCTTTTTCTGTCATATGTATATG
TGTGTGTGTATATATATNNNNATATATATAGGGTCGCGCTATTCATCATCCTGGGTGAGA
AATAGTTATTCCTCACCCCCCTCTA