Map Locations of contig_39371 (10524 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_39371

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54759 2 4704 bp MLOC_54759.1 Available Available LOC_Os04g53310.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13104.m05484 protein soluble starch synthase 3, chloroplast precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_54759






Contig Sequence (10524 bp)

>contig_39371 10524 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCCTCGCGCAGGTCCGCCTTCTCTGCAGTTTCTGGCTCTGCCCCCCATTCCCCTCCCCC
CTCCGTAATTTCGATTGGGCCCGAGAAGTTTTCTCGCCATTGCCTGTTATTTCTGCTACA
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CTGGAGTGGGCCTTGTCATAGTTTTGCTCTTCTATGAAGCTATTATTGGTTCGGCCTGAT
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ATAGCTTACACTTGACTTACTCCCTGTATAGTTACTTTACCTGAAAGCGCATTGGTGTTG
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GTAAAGTTATGTTTCATTATTAAGCTGCCTTTCTTTTGTTGCAGGTGAAGGATTTACATT
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ATATATACTATCTACAGTTGTTATTTTGTTCATATTTCATATTCTACTTTGTTGATGGAT
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AAGACCTGATGCCTGATGGATACCAGATAGATTTTACAGCAAAATGCATGCTTGTCATGC
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TTCTTCTCCAGAGTGGCTCTTCTCCAGTAAGTACAAAACAATGTCCCATATCATTACCTA
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TGTTTGTTAGACTTTGCAAGTACATCATCAAGCCATTCCATGCTGTTACATTCTTGCTTT
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AAGCTTATAGATAACACCCCCTATGTTTAATTGCACGCTTGTTATGTGTTCTTTCTTGGC
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TTCACGGTGAATTTGATGGTCGCGTGAAGCTTTGTTTAACTTATGATGAGCCACTATCAC
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TATTGCAGCGCCAGTGGTCAGTAAAAGATATGCTATGCATTGTGTGCAGGCCTTTATGAC
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CGGCACACAGTGCGTAATTATGCCACCTGTCCACCGCTCCATTTCAGGGCGATCACGACA
TGGTACGACGCCCGCGGCTGGTTCCACTCCCTCTGCAAGCGGGTCATGGAGCAGGATTGG
TCCTGGAATCGGCCTGCTCTGGACTACATGGAACTGTACCATTCCGCGCGCAAGAACTGA
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GCGACATGCCAATGCCTCACTGTATATGCCGTTATCCGGAAAGCCATTCTTCCGTCAAAT
GGGCTCTGAGGAGAAGTATAGGGCTTCTGCGTCCCTCTGCGAGAGGCTGAAATGTGAGCT
GTTTACTTCATCCATTGATCATGATATTGCAGCATGCAACGCGCACGCACACGACAAATG
TGGCACACGGGAAAGTTTGTTCCAGCGAGAGTCTTCAGTTTTTTGCAACATGTACCGATG
CAAATATGTTCCCATTTTACGGTTCTGTAGTTCTTCAGATGTACATATTTTGTAAGCTGT
TTGCTAGATTCTTAGGGCCGGCCCACGCTCAGTGTAGTTTGATTTTCTGCCTCGTCTAAA
TAACAAAGTGCATATCAAATGGTGTAGCCCAGCTCTATGGTTCTTATTCTGCTGCATGCG
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GTGTACCCTCTGTGTCCACTGTGCGACGTGCGTCCGTGGCTTCGGGAGTTTCCATCGGAG
ATGAGCGGCGGTTCCATTGACCACTTCTCATGCGCAAAGCAGGCATTGGTGGTGCCATGG
TGTTCTACGGCTAGAATTTCGCTTGCTTTGGTTTGATTTTATTTGCTTTCGGTGCCGATT
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AGGTGGATTGCCTTGCTTTGTTTGGGGAACACGATGGCATCAAGGACAAAGGAGATAAAT
TCACCAGCGGTCACTTTATTTGATGATCAAATTCATTTTGGTCACTGGACTATAGAATAC
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TTGCTTTGGCCATTGATTTGAGGGGTCGTAGTGTAAAATGTACCGGTCGCTCCGCAATTA
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TCTCTCGTCCAGAGCCTCAATCCATGGATTTGAATTAGAAATTTTGTGGAGAAAGGGGTT
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CATTGATGAGAGTGGAGATAGTGAAAGTCAGGTGGAAGATGGTAGTGAAATTGATTATAT
GCCAGAAACTGCAGATAGTGACTATGCCATATCAGAGGGGGATGATGACCTATATGTCAA
CAATTGCTTTGATGCTGCAGAGAAGAGGAATGAGGAACCCTTGGAAGTGTCAGAAGATGA
CGAGTTAAGAAGGCCAGATTCTGATGATGAAGGAAGAATTCAGATGAACTTCAAAACATT
TGGGGATGAAGATTTGTTATGCCCTAAGTTTCATGTGGGGCAAATTTTCCAGAATGTGCA
GCTGCTTAGGAAGGCTATCAAAGAATACTCATGCAGGAATAGGGTCAGCCTCAAGATGCC
AACTAATGACAAGATGAGGGTTTGTGCAAAGTGTGAAGAGGGGTGCCCTTTTTATCTATG
GGCATCCAATGACAATAGGTCAAAGGCATTCATGGTAAAGAATCTTGTGGACAAGCACAC
ATGCAACAAGAAATGGCAGGTGAAAAACTTCACAGCTCCATACATGCAGAGAAGTATCTG
GACTCATTTAGGGCAGATGAAAACATGAGCATGAAGAACTTCTCTAGGTTGGTGCACGAA
CAGTGGAACATGAAGCCTACAAGGAGTAAGCTTAGGAGAGCAAAAAGGCTACATGTCAGC
TACATGTCATGCATCAAATGCAGGAGAGGGAATATTCCAGGTGAAGTAGCCTGACTTTGC
ATTTTGACAAGTTCATTTGCATATTTCTGTTACCTCCATTTCATCATATTGCCTATGTTA
TGTGTGTAGGTTGATAACACACGGGGATCTTACATAGTGGACGTAAAATCTTTAAGTTGC
ACTTGCAAGAGGTGGGACCTCAATGGCATACCATGCCATCATTCTGTGGTTTGCTGCAAA
GATGAAAGAATTGAGCCTGAAGACCTAGTGAACAAATGCTACAACATTGCCTCATTTCTG
AAAGCCTACCAACCTATCATCATG