Map Locations of contig_39183 (11124 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_39183

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54512 1 1213 bp AK359720 Not available Available None
MLOC_54511 1 986 bp AK251272.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_54512






CDS Structure of MLOC_54511






Contig Sequence (11124 bp)

>contig_39183 11124 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGAGTTTGGCGAGCGACCTTCTTTGAGTGATCAGTGAGAGTGCAC
AAGACTTGACCCGACGGCCTATCGAAAAGAACGGCATTTGTATCGACGCCCCCAGTAGCA
ATAATATCCTGGTGATAAAAATAGAAATCAATTAGGCAAGTAAACAACCGTCATTGCAGT
TTCACTATTGAAGCATACAATTTATCAATTTCTAAAACTAAACTTGAAATGCATACACCA
TAGTCAAACCACAATTGTAATATCAAAATCTTATCAACAAGGAAAATAAAAAATAATCTG
ACCTTTGAATGATGAATATCAATAGATAAGATCCCTGGTTTGTTTGTTTTGTGAAGTGGA
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CTGTAAATTGCGACTTGAACCATGCAAAAGAGTACAAAATCACTGCAAACCCTAAACCCT
AATTTAATGTCCTTGTGCCATTATGTAAGTCTGATTGAGAACCTATGAGATATTTTTCTG
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GTGGAGAGCCTTCGGCCAAAGAATCCTGAACATGATGGCTAACTACTTAACTAGTACTAA
GTCAAGGATTACCAAACCCAATCCAAAAGCAGGCGACTACAAAGTGCGGCACTAAAAGGC
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ACCGTCACGAGGTCGTCCATGGCGAGGTCGTCCTTGGTGACCGGGCACTTCCCGTGATCC
TGTGGGGAACCAAAAAACCAAACAGATTCAGCGCAAAGGCCCGGGCGCACGGACGGGCGC
CTGACGCGAAACCTAGAGCGGGGGGGGTGACCTCGATGTAGCGCTGGATGAGCCGCCGCT
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GTGGTAGGGATGGGACGAGAGAAGAGAGCTTACTTGCGCAGATCATGGCGGCGGAGAGGG
CGGTGGTATCAGCGGGCGGCTGCACCTCCAGAGGGCGGGTTCTCCGGCGGCGGCAACGGT
GGTGGCAACGACGAGGTGGGGGTGGGGATGGTATTTGCTGCAGGCACCCTGGAAATTTTG
CGAGTCCTTTGCTAGAGTGGGCTGACCCGCAAATCCAGAACGGGCCAACAGCTCGGCCCA
TTGGGAAAGGTATGTGAAAGTACACGAGGTTGTTTGGCACGTGAGGCATCTCCAACATCA
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CCTCCAATGATGTTCATTAAATTCTTATGGACTGATCCGCACATCTGAAGTCCCACAAAT
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GTTCGTCTTTTGCGATGGGTAGTCTACTGGCTTAGGAAAAAAAAGTCTGATTTTTCTCTT
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TTACAAAAAAATCATAATTTTGAAAAAACACAAATTTAAATAATGATCATGGATTTAAAA
AAGGTTTGAATTTTGAGAAAAAACACAAATATGGAAAATTGTAAATTTAAAAAATAATCA
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AAATACACAAATAATTCTAGCTTAAAAAATCGACCGAAAGGGAGTTCAATGGTGCCTCCT
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GAAGTTTTGTCAAATGTGTTAACGACGGATCTGGGGTTTTTCTCCAAGCCGTACTTTTCG
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CCGATGTGCGATGAGCTTGGGTTCACTCCAAGGTGAATGTGCCGCCCATGCGTTGACCGT
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TATTGTGCTTACCAAAATCTCACAGGCAGTACCAAATATTGGATGCGAATCAGATTAAAC
CCATGAGCAAGTACTTCTCATCACAACAAAGGCGGTTACATTTCTGGCAAAAATCATGGT
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CTTTTCCTTTACCTTTACCAAACCCTTTGGCGTTGCCTTTTCCGCCCCCTTTTCCTTTCC
CTTTCCCTTTCCCTTTCCCCTCTGGTCTTCGGTTCTTCTGGGATCTGCTGTCTTGGAATT
TATCATCCCTTCCAGATCCATTAGGCCTCCTGTTTTTCTGGAACTTTCCGGGAAATTTAC
CGTCTTTTGCAGATTTGTCATTCCAGCGCAGATCTTGCATCGCCTTTTCCTGCCTGCCCT
TCCGCATCTGTTGGGGATTTCTTATCTCTGATGGCACATCAGCATTTGGTATAGACGAAC
GGCCGCGGCCAGCTGCAGGGTATCTTCTGTTTCCTCCTCTTTGATAGCCAGCTGGAAAAG
GTCATAGCATCAGGCCTTGTTACATACTATGACAGTAATGATATCCTATTTTAAATATTT
ACAGAATTAACAGTTTGAAGAAACCAAGCTAACATAACTGTAGTAAGAATACGACAAGAG
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TTCGCAATTCCCAGTTTACTACCTCACCCAAATCGGGTTCGCTAAGGGAGCATACATCAG
TATTCATGAACATAAATGTACCACATAGTTCCGTACACAGAAGATTTGGTAAATAGGCAA
TGCCAGAAACAGGCCTGGTTAGCCCACATCAGAGCTGGCCAAACGGGCCAGCCCGGCGCG
GCACGGCCCAGCCCGCCATAAACGTGTCGGGCACGGCACAACCCATAGGGGCACGATTAG
TATACAGGCCATGCCATGCCAGCCCACATGCACAGCCCTCCACCAGGTACGGCCCAGGTA
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GGCTATTCTTAAGGCTATATATATATAAGAAACCTAAATCAAGATAAAATAAATAAATGG
GTCGTGCCATGCCAGCCCACATGCCCAGCCCCTGGCATGCCGCGTGACGTGTGTGGGCCG
TGCTGTGCCAGGCGTGCTACCGGGCCGGCCCAGCTATCCCAGCCCATTTGGCCAGCTTTG
GCCCACATAGCTCATCATCAATCCCAGATCCCAAGTTCCAATCCTAATAAGCACCATGAC
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CAGGGGATTCTATCAACTCCATCATCCTCATCTCATCCACACGTGACTCAGGGCTATGGC
TGCAGGTGTGTCCCCATACTATGCCAACCTACTCAACAACATGCAATGCCGACGCCCAAG
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ATCTTGGTTAAATTTAATTTTGGTCCACACCAACGAATCGGTCAACGAATTCGAACCCCA
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AATGAACATTGAAGAAGAAGGGGAAAGGTGGAGAGATGAAAGGGAAAAGGAACCAAACTA
ACATGCGGGGCTATCTTTATTTTGTCGGAACCAACTGATAGTTTTGTCAAACGTCAACCT
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CCCCCTTCTGCACCATCGTTTCCACCAGAACTGATTGCTCTATGTGACTTCTGCTGCCAT
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GGCTTGCATTCCAGAAGTTTCATCATCAACTAAATCAAGGACAGCAGCATCCAATCTGCA
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TAATGAGAGCAAATTTGGATAAGTCAAATTATTTTGCAATGGAAGCATGTGCTTTCTTAT
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TTTCAGCTGAATCATGACCACACTCTACATGGTAGGAATTCAAAACCAGCTTTTCTCACC
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TGATAGTGGCTCACTTCCACATCAAACAAATAATCAATCGTACATCAGGAAAGTAGGAAA
CGTCCGCAGCATACCTATCTTGTACAAATCCTTCATTTCCCTTTACTGACAACCCAGCTT
CTGAATGCTGAAGGGGGAAAGGAATAATGAAATCAATATTATGCAAAAAAGCTACATCAA
GCAGACTGCAGTTGAAGGAAATTAATAAAGATTCCTAGTGCAGTAAAAATTGTGAAGGAT
ATTTCGTTTTGAGCTGCATACTTGGTTTTGAGGCACTGAACTTATGTAGTGATCCTCATC
TCTAAAGCTCTGCGACTTCCGCTTCTTACCACAAACTTCTGAAATCGACAAGATAATGAA
AATATTATAACCACCGTAACAAAAGAGGATGAACTTTCTCTAGTAATACTGTTACAGAGC
TCAAGATGCACTTTGACGCTAAAACAGCAATGGCGGGTATTAATCTCACTACACTACACC
TCACAGAAAGGAAAAGAGCTGCTGACCTTTCTTCTCCCAATTAGAAATGTTTTCTGTCTC
TTCTTCCTGCATAAAATATAGCCATAAATCACTGAACGAAGCATAATAACGAAGTACCAT
ATTCAGTGTGGCACTCACAGAAGAATGAATAAAAGTAAGCTTATTAACATTAGTGTTATG
CTGTGCATTAATCTATAACATTCAAAGGGACAAGTAGAAACTGCTCATAAGTCACGCAGA
ATAGGCCATATACACAGAACCGGTGTGTAGTGGATACCAGAACAAGTACAGTAACAGTCA
TAACACTGAAACTATCAACCTACAAAAACAATTATGGAACAACAAACAAATTAAATTCAA
ATGAATCTGGCATCATTGATGCATCTGCTCTGTGTTTCATCTAAATGAAATTTCAGCATA
CATAAATAAATACTGCTCCATCGCTGCATGAAGTTGAATTGCTAAATTACTGAGGCCAAA
TTATTCAGAGCACTCTATAGAAGTAAATATTGCAGACAAAGCACTAAAGAACATCACAAC
CAAGACCATCATCTGCATGTGCTGCAGTTTTTAACAAGTCGAAGACACATAACTGGTGCA
TATGAGGCCATTTTTTAGTCAACACACAGACAACAGTCATGCAAAAGTATTGACCTTTGA
GGCCAGTGCAATAATATATTATTGCTAATCAGCTATGCAAGAAATGAATTCTCCACTTTA
GTTTGTTCCAGGCATCTTTATTGGAACAACCAATTTTTTTAGGGCTAAATTTCCCATACA
GATGCTTAAACCAGTAAAGATTGTGATATGTAGCATTTCAAGGTACATTAGGTGTATCGA
GTGATTAAGTTATGTCAGCACTACATATCTAAGTGATTGTTTGCAACTTCCTATGCTTAA
ATGAGAAGTGGAGAACAAACAAAGGTGTGACTTCAGAGTAATAATTGCCTTTGTTGCCAG
ATCGCCAGAATTCTTTTGATGCACCAAATTTATGATCCCCTCATGGACTTCTCTTTTCTT
CTTCATCACATCCAGCCATTGACTGCTACCCTACAAGGAAGACAAAATGGTCATGTTAGT
TTTAAAGGATACGGTGATATGCAAAAATATGTATGGTTTGCTTGAACCCCATTTGGAGTG
CCTAAAAATCATGGTTCCAGCATTAGTCAAGTAATCAGAACATAGTTGGTATACTAACTG
CAGGTTCTTTGGTAATACGCCAATTTAGCCACTATCAATGAGTACAAGGATTTATGTCAC
TTCTCAATCCCAAAATTCAATTAGAAATCAACATATAGAGATTTAATCTCATTTCTTTGA
TTTGTTCTCCTCTTCTACTCGTAT