Map Locations of contig_39051 (8325 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_39051

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54323 1 768 bp MLOC_54323.1 Available Available LOC_Os06g04290.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-72, 13106.m00382 protein S10/S20 domain containing ribosomal protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_54323






Contig Sequence (8325 bp)

>contig_39051 8325 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTAAGGGAAAACTTCCTGCTGACTACANNNNNNCCTTCCACTTAGGGTAACCAACGGGGT
GCAAGAAGTATATACATCATTTCTTCATCAATTGCCCCTCCGGCAGGGTACCAGAAAGGG
CTCCGGATGAGATTTCTTCTACCCAGGGAGTTGCGGCGACGGAGCGGAAGTTATAGGTTA
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GTGATTCAGAGTACCTCTTGTCGTCTGAGATATCATCTTGAATTTTCGTCGCCCTTTGGT
GTGTTGCGCTGGATTGGATATTTATACATGGCTCACTATTGACGTGTCTGAGATTTGGTG
TCATCGGTTGTCAAAATTTCCATTAGTTCATCCACTCTGAGGACATTGCTTCAGCTAATA
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TGATCCACTTTATGGATCTAGCAGTATCTGCAATGTGGGTTACATTGCTTTATAGGGGAT
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GGAGAGGCACCATCTTCACCTGTAATTTATAGCCTACATTTGAACTGATGAACAAAAATC
CCCACAACGCCATGGTTTGCAGCACTGCTTAATTTTACTTATAAAAGACACTAGGACAGC
AGCCTTTCTCAGGTCATCCACGTCGGCTATGAATAGCAAACGCACCACACGAGAAAAAAA
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CGTCCCTCGTTCCTCTTGCCGCCGCCCCGCCTCCGCTCCCCCATCCCTCGTGACCGCCTC
GCCCCTCCGCCTTTAGCACCTGCTCCTCTCCCCCTTCCCCGCCTCCGGATCTAGACCACG
TGATGTGGACGAGGAGGTGATAGCTCAGGAGGCTCCTGCCACATAAAGCATGTTGTCTTT
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GAACGTTCATTAGGAGTACATGTTTTATGAGGCTATGTCTTTGCCACAGGTATGATACTA
TCGCTGTACCTGAATTTCCTTGAATAATGGAACATGACATGGCTAATAAGTACTTGCACT
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GTTTGAAGATTTGAAAAGTTATGTCATGTGATACAACCCTCCTTTCTAACTGTGCTATGA
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CCACCCCGGTGGCTGCGCACACAGGAGGATAGCTTGAGTGACATCTACCAGTTTGTAGAG
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GAACTTGTCTGTTTCTCTCTCAAAATAGATTTTAGACTATGATTTTAGTCTTATGGTTTA
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GTTGTAACTTGACTTTGTTGTGATTTTGGGCCAGCAGCTCTTCATATAGCTTTTCATGTG
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TTAGATGGCTCATGTTGTCGATTTAAAGTAGCTCGAGGTTTCACATAAATATGACATCAA
CTTTGATCAACTGTGGTCGGATGCGGTCTCCTCAAGCCATGCCTTCACGGCTCACGCTGC
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GCATGTTGCTTCCTAATTTGCATGTGTTAATTAGCGATATGTCATGCTTGCTTTGAGTTC
TTGGTTCATGGAATAAATTTGTAGTGTTGCAAGCTTTAGATTTCATAACCTACGTAGGTA
TCATCACCTTATGTCCTTGTCCATTTTACTTTCATTTTTGCTGTCTCACACCATTGGCTT
GGTGGAATCTTCAAAAGTTTTTTTGCTGGTGGTGTCGGTTAGTGCGATAAAAAAATTAGC
TGCCGTAAGCTTGTTGTATCGATTATTGAAAGGTGGTATTTCCTTGGTCATGAAAGGTAC
ATGTGTGTATTGTAGAAAATTTCAATGTGCTCTTTCCTTTGTGTTATGGAGATTTGGAAA
GTGGAAATCACTCTTTCGTCAGTCAAAACATTTACTTAAGTAGTTTCACTTCCATACTTA
TTTTTGTTGGAAGAAGAATGAACTCATTATTGAATATGCGATAATTGCATAGATTATTAA
ATTCCCTTCATAATATGCCCACGCTTTGGATGGTTTTGACTTTCGGTTAATTGTTGTCAC
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TAGAGATGATGACTCATACTGTCGATGGCACCATGAATATATATATGTAAGGCTTCCTAT
GCTATGAGTGTCTATATTATATGTATTCTCATTTGTCCAAAAGAGTGAACTTTATGTTTT
CTTAGAGTGTACATTGTGTTAGTCCCACAGTAGTTCAACAAACAAGTTCAGGAGATGGAC
ATATTTTTTGGTTATTGACTACAGTAATTCCGTTAGTTGGAGGAACTGACACTATAGACA
ACAGATTCTGGCATATATATCAGGTGACAGTGATGTCGCCGATGTGCTACTTCTGTTATG
CAACAAAGCATGATCATCTTAAAGGTACATTTCTGATAACTACATCTCTAAGTCATTCAT
GGATCATTTTCTCTATCTTATGCTGGACGAGTCCAACATCCTTTATCTCTGTGTTGGACA
ACACTAGCCTTTATAGTACTGTATATGGTTTGAGGTTTGTCTTGGATCATTCCTCCGGGG
TGATAACAAACCTGTTCATAATGTAGCCTGAGCCACAGTTCTAGATTTTCTACCTTGTAT
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TTTCCGAGTAGATTAATCCACAAAATAATAACTAGCATGGCNNNNNNNAGACTAATGACA
TACTGATCTTGAGCTANNCTAGCACATACTACGCATATAGTGGAT