Map Locations of contig_39037 (8769 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_39037

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54304 1 996 bp MLOC_54304.1 Available Available LOC_Os05g44050.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-144, 13105.m04647 protein ras-related protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_54304






Contig Sequence (8769 bp)

>contig_39037 8769 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTGCTACCACGCACCATCAGCTTCGTTTTTTTTGCTACGATCACGTAGATATTTTTTTT
GCTATAATTTTTGTTTTTTGTTGCAACCGTTGAAAAAATTGCTGCATCACATCAAAATTA
TACTGCATAAGGAGAAAAATGTTGCATGCGGATCCAACGGTACGGACGACGCGGGGTTGG
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GGTCTGTCCTGTTGCCCAACGCACACGCACCCTTGTTCCCCGCCTGCTCAGGGACGGCAA
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GTTTAGTCATTGCACAATTTTGAGAAGTTAGCACTGCGCTGATAGAAATCACCATTGCTA
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GTGTTGTCAGTACAGTAAAACAGTACCTAACACTGCAAATTATCCATCCAACTATCAAGT
TGGTACTCTAATTTTGTATCTTGCCATCGGAATCATAAAGCATTTTCTGTAATTGGCATT
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TACTGCCATCTTAGGTCTCTGAGAAGAAGGCAAAGGCTTGGTGTGCCTCAAAGGGCAACA
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TGATATGTCCTGAGCTTTCTATCATCTTGCATGTTGTGCAGTTTATTGTGAATACGATGA
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TGTTTGGAAGAAGCTTCTTGGTGAAGCTCTAGCGGCATGGTCTTTTTTGCTTGTTTTGAT
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GGAGCGGCGTCTCCTCCTCCTCTCCACTCCCCCCTCCTTCGTTGTCCTTTGTTTTTCCAT
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TATGTTGTATTTTGAAGTTTTGTAGATTGTAGCTTTATTTTGAATGATTGAATATGATGT
ATATGTTGTAGATGAATCCTAGTTCATATTCTAGTTATAAGTTTTGTGGATTCTATCTTG
TTTGAAGATGAACCCTAGTTTATAAGATTGATGCTGTTAAATGTTTGTTGAATATGATTG
ATGTTGATGCATTAATGTTGTTGATTTTGGATATATGAATGTTGTTGATATTAGATTTTT
TTCTATAGTCAGTACTCCCTCCATCCCAAAATAATTGTCTGAACTTTATACTAGCTCTAA
TATAAATTTGTACTAAGCTTAAGGCATTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACTGTATTAGTA
GATTATGTGCATATAGAGTTGATGTTGTTGAATTAATGATGGTGCATGAATGTTGTTGAT
ATTTGATGAATGAATGTTGTTGATATTAGTTGCCTAGTTTTCTTTTCTTTAGTTAGTATA
TATTCTACAACCTACCGTCATGGGCTCCGGCAATATGTGTGCAGTCTACCGCAAAAATGT
GCTCGTTTCAGAAACAGAACCGCTTGGGGTTTATGGGGGATGTTTAAACCCTACCGCCGC
TGTCGATGGCGGTAGGTTGTAATAGCCTACCGCCCAGGGGTGCTGGCGGTAGGCTCTTTA
GCCACGTGAGCACCACCCAATGGCCATTAGCCCGTGACGTCAACCCTACCTCCAAGGGAT
CCGACGATAGATTGTTTTATCATACTGCCATCGACCCCAGCGGTAGGAAAAGGGCCACCT
TACGTTTTTTATCAAAGTAGGGACATATCTTTCTCAACATTGCAAAAAGGTCAAAAAGGT
CAAAACAATAACAACCCACCGCCCAAGGCCTATGGAAGTAGGCTCTTTAGCCACGTCAGG
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GACCATTTGGTGGGACAAAGGAGGACTTCAGAGTGTGTGACGGTCGAATGAACATATGAG
GCCGCAAGATTCTGGCCACGCGGGCCTCTGACGAACACTAGCTCTTTTGATATATGGTGG
TTTTGATGGTGGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGTACATTGTGTGCGGAAAAAATCATATG
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TTTTGGGATGAGACTGGCCTCACCCTGAAATATACAAGGGAGATTAATTAGAAGATGACA
TGTATACCTATAGGATTGTTTTCCTAAAGTTGTCCTTAAGTGTATACTTTCCATTAAACT
AATGTGTCATAAAGGCGATGGTGAACGTGGGACCAGTGGCGTAGGCAGAATTGTTTTGAA
GGCTGACATAGGTAGACATACATAGAACATGACCGAGCTTCATGTTTTCCTAACCATCAA
CATGCTCAAAGCCCAAATTTCAATTTTTCTAAGGTGTGGTGGAGGCCTAACCTTTCCGGA
TTGTTGCCTCCACCATTGTGTGGGACGAGACATGACGTTCGAAGAACCCACATCCTCCAT
GACCGGTTTATTTCCCTTTTAACCCCTCCTAGGTCGCAGGGTGAGACATGCAAGTTAGAG
CCTCACCCCTCCTCCCCCTCAAACGTCTAGGGTCCGGCTAACCTCCATGCCCAACAAATC
GAGCTTCACCGCTTGAGGTGTTTCTGCGGCAACAAGAGGTCGGAATGAGCCGCATGACAA
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GGAATACCCATTCCCTTGGGCATATCACGGGCGAAGAGGCCCTCTAAGCCGTTCATTTTC
AGATGGCTTGCCGCGAAGCCTTTTGGGGCAGCTCAACACCTACCGATGTGCAAGGACGCC
GCGCGCCCGAGTAACCCGGCTGGAAGTGACAATGTCATACACCGGGGTGGATCACCAAGG
GGATCCCAACAAAAGGCCCGCCAGAGGACCGATGAGGCCTAGCGATACGAGGGAGCCCAA
AGAGGTGGATAAGCATGTGCGATCATCTTCGCCCTCAAGCTATTGGCGCTAGCTAGCCAT
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TGTAATACCTCGAACGAGGTATCTCTCCATCATGAATAATAAAAAGAAGCACCATGTAGG
GTATTACTCTCCGGAGGCCGAACTAGGGTAAATGGACGGTGTGACCTTCGCTCTCAACCT
TCGAGCTATGCTAGGTCACCTACCAATGGATCTAACGCTTTTCTACATTGTCAGTTGGCA
TGCAACGCACGGGTCGCGTCAGCTAGAGACCGATCTCAGATCGGATCTTCCCCAGCCCCT
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GCGGGCCAGGTCAACATCAACCCACTGGGCCCACCCGGTCGACACGATCTACGACGGGGT
CATGGCCTTCATCATCAACAATCATGACGACCTCTAATGACGTGCAAGTGCACAAGGTTA
TGTAGCAATTTCGTGACAAGTAAGGTTTATCGACCCCACAAGGAGCGAATATGATGGCAC
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TAAAGAGAATGGAAATTCAATACTAAACTGAAAAATATGATAAACTAAGAGAGGTACGTG
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TGAGGTAACTCATTCATCCTACTTTCTGTCCCATGCCTGTGATGGCTAACACAAAAATAT
TAAGGTCTTGTTGGTGTAGAGGACCGGACGAAGGCATTAGGTTCGATGGAAAGCCGTACT
CCTGGAACAATTGTGTTCCCCTCAAGATGTCTCCACATGTCATGTTGTAGGTCTATCAGT
TTCCACAACATTCTATAAAATTCACGTGTGGCCTAAGAGTTGAACGTCTCCAACTACGCC
AATGGATTGAACGTCTCCAATCACTAAATTACCGCAAAGTTAAATAAGCAACACATATAA
ATAGACTAAACATATCAAACAACCACTTAGTAATCGATCGTCCCATATCCAACAATTACT
CAAATAACATCACGTAAAGAGGGGTTCAAGAGTTGTTACAACCGGTCACAGAGACCATTA
TGGGGCAGGAAGAAGAGGTGATGATGGTGGTGATGAAGGCGATGCGGAGGCAGATGATGG
TGGTGAAGGTGCGGTGACGACCCCCCATGGTCGCGCCCCTCCTACGGTGGATCCCTCCCA
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GAATGATGAATGAGACGTGATTGATTGTTGATGGCGGCGACTAGGGTTGAAGGTGTTGTA
TAAACAAGAGCTCTCCCATAGCCTCCTCCGTTGATGTAGCATCTCCCCTTTGATCTAAGG
GCTCTTGGTGAGCATTATCCTCTCCCAAATCACCCCTTGAAGGCCAAGGAGGTTGTGGGA
ACAAACGGGGATAAAACTAAAGAACCCCGTCATGTCACGGGGTTTGGATGCACTCGCTAA
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ATGAGGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGTCACATTAGTCATAAAGAACCCATATAC
TTATTGCAA