| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_38980
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_54228 |
2 |
1146 bp |
MLOC_54228.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g32660.1, FRAME:+2, EVALUE:3e-137, 13102.m03538 protein 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, chloroplast precursor, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_54228
Contig Sequence (9783 bp)
>contig_38980 9783 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCTGTTTGATAACAAAGAATTTTCGTAGTATTTTTAGAATACTGCAGTTTTGGAGATTA
TCATAGTTTTATTTACAATGAGGTGTTTGGTTGCCTCTAAGAATTGTGATTTTAAAATTG
CAGTATTAGAAAAACTGTGGTTTTTCTCTGCATAAAAAAAAGAACCCCAGACCTCTTTTT
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TGTAGCTCATTCGGATAAGAGCTTCCGCATGTGCCGCTCAAAGGGCTCGCTCGAGGAACC
AACCAGTTTGGGTTCCAAGCCAGACAGTCTGGCTTTGCCAATTTAGCTTATATTGCCTTG
CATGTGGTTGCCTAACGAAGGGTCGAACGATGATCCAGAGGAGGATTTTGTCCAGCTATA
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GACGAGGGCCCCTACTTTCTCTCATATCAGTTGTATTCGTCTGCAATCACTTTATCCCGT
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GATATTCATACCTAAGCCTTGTGATAACTGTGATTTCCTTGTTTGAAGATTTCATTGATG
TATCTGATTTAATTGTTCATAGGAAAGTACATATGGAAGCACACTATCATAAATTTTGAC
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GTAAGTTCATCCCAGGAAATAACAACAGTTACGACAAATGCCGTCGAAGATTTGACCTGG
TAAGTTTTCTTTCGAGTGTTGCTAACAGCAATAATTTTACTACCTCCATTGAGTCAATTT
AGTTTTGGTTAAAAAAATATTCAATTTAGAGCTTCTTTTACCTCTTCTAGTGCTTTATTG
AACAAGGTACCATATATGACGTTCATCTTGGTTCTGTGCTCTTATTCTCATTAGCATTTG
GGTAGGACTATAACTTATTTTATTTTTTTGAGAAAACACAAAAGCTTTACATCTGGATGT
ATTGATTGAAGAAGTAATATGTCAAAGCTTAGCCATACTTTTGACCGAGGCATCGATAAG
AAAAACTTTCTTGTTTTACTTGTCAGGGTGATGCAGAATTTCTCAGGTATCATGGTATGC
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TTATTTTCTTTTCCTATGAAATTGAGTCGCCATCACTTGGTGTTTTACCCACTAAAAACA
TCACACTAGGAGTTGGTCTTTCATTCTTTCTGTCATGCCATTCTATTCATATTCACTTAA
CTGTCACATTAGGAGGAAGTTTGGTATGATGGTACAAGGAACATCCACTAAATCTGATTA
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TCATTTTAATATGTTGTCCGTTTTAATTATTTAGCTTACAAAATAGCAAAACCTTATCGG
TGTTTCGAAGTTGTCCTCCCCCTTTTGGGCTTGATGCTTGTATTCTTTTCTCTACATTAT
TGAAATAAGGAAGAGCACACGACCTTTCTTTTGAAATATAACCTTAACAGAACTAGTTAC
CTTGATAAATGCTGGATAGAAGAATTAAATTAGTACAGAAGGTAGTGGGATAATACTATA
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TACATCAACAATGAAAGCATTAACCTCTTCAGGAGAAAGCTGCAGATTTTCTCCTCCTTT
GAAAACACCTGATTTGTCTTCACTTTGTGAGTGCTAAACTTAGATTTGAAATCGGGGTAG
TGGATTTACAGTACCTCTACTACTGCTTTCTTGCCTTAAAATTATATCTGGTAATGTAGG
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TAATTGCAGTTTATGACATCAGACCACCAGTACGTATCTCGGAAACACGAGGAAGATAAG
GTGATCGTGTTTGAAAAAGGGGACTTGGTATTTGTGTTCAACTTCCACTGGAGTAATAGC
TATTTCGACTACCGGGTCGGCTGCTTAAAGCCTGGGAAGTACAAGGTATTCAGCTATTGC
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TCATGCTCATGCTTGAATACACTGATAGTTAGGTGTGAGGGAGTATTGGTAGTCTGACTA
GGTTCTGTTTCCTTCTTAATTTTAGAAAGAAAAAAAAAACTTTTTGGGGTTGCTTTTGTA
GTACGAGCAAACCTAGTAAGCAAAATCCAAATGATTTATACATGTTGGAATTAATTTCTC
TCACACAAATCTTTTAAGTTTAATCAAAATCCAAATGATTTATACAATGCCTATGCTATG
TTCTGGCTTTCAAAATTTATTCAAAAATTGTTGCTGCCCGACTTCCCTGTCACACGTGAG
AAGGGGTGTTAAAGTGTATATGTGGATTGCCTAACCCTTTCCATTAGCTTGGACTTTTAG
TTGCACTGTGTAGTGCATGAAGCCTAACATGATATGAGGACCTAAGGTCTTGAGTTCAAG
TTCTGGCTTTCAAAATTTATTCAAAAATTGCTGCTACCCGACTTCCCCGTCACACGTGAA
AGGGGTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGCCTAACCCTTTTCATCAGTTTGGACTTTTGAT
TGCATTGGCTACTGCATGAAACTTAACAGATAGTTGTATTCCATCTTTACTTGTAGATGA
CTTTGACTATTATATGATGAATAAAGTTCTTTACCTTAAAAAAAGAATTGACCACCTATG
TTGGTACCTATGCCGGGTAGCTATATGCCTAATCTTTTGATCCTCCCATTGTTCAACCTG
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GGCCCTGCACCCGACGAGCCGCCAGCTCCACCACTCGAGCAACTGGAGCCGACACCCTAA
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GAGTTGCAGGCTCCGGAACCCAAGCAACCGGAGCAGACACCCTGCAACCATTATCGAAGC
CGGGTCGAGAACGCAAAGTTTCTATTCTGAGCATATTGTTCAGTCTACTCATGTTTTGGA
ATTTACCTAGAAAGCTTACTCAAAATTCCTAGAATTAGTTCTGATTTCTGAAGCAGGTAC
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AAAAACATCTTATATTAAGGGACTGAGGGAGAACCTTCTTGCGTTGGGTGCTGAAAGTAT
ATTCTTTCTACCAGGTGGTGTTAGACTCAGACGCTGGACTCTTTGGTGGATTTGGTAGGA
TCCATCACACTGGAGAGCACTTCACTAATGTAAGCCTTTTGCTCAGACGTGGTTGCTTTT
AGTATATGAGTACTTGTGTAATCTCATTTCTGGTAAACCTGAAATAACATATGCTTCACA
TGCACCTTGCAGGGCTGCCAACATGACAACAGGCCCCATTCGTTCTCAGTGTACACTCCT
AGCAGAACCTGTGTTGTCTATGCTCCAATGAACTAACAGCAAAGTGCAGCATGCGCATGC
GCGCTGTTGTTGCTTAGTAGCAACATAAATCGTATGGTCAATACAACCAGGTGCAAGGTT
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GATGTTGTGCTGTGTGCTCCCAATCCCCAGGGCGTTGTGAGGAAAACATGCTCATCTGTG
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TATGGCCGTGAACCATTGCTACAACTGACAGTTTATCATAGATGTTTTACTTTTGTATCT
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TTTCCCAAACCGATAATTTGTAAAGAAAATGTCCAACCTCCCACAGACCTTAGAGCAACT
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GACCGCTCGATTTCCGTTGAGTTTAAGATTTGGGTCGGCAGTACGTCCAACGCCCGTGAC
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CAGTTGCATGTGAGTATCTCAGTCTCGCATTTCATAAAGGAATTGGACGAACTGTTCAAA
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GTAGATACATTCCGGAAGCTCATCTTCTACGATCATATTATGCATAATCACACAAGTTGT
CATCATCTTCCATAACTTTTTGATGCTCCAAGTTCTAGCAAGGTACCGAACGATGCCCCA
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TGGGCAAATTTTTTCCTCTTCTCTCCGACAGGGTCGGAGATTGTCTTCACAATAGTGGTC
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GTAACATTCACCGGTGGGTTGTTGCCTTCCGCAAGCCTTGCAAACACCGGCGAGCGTTGA
AGCACATTGATATCATTATGTGATCCGGCCATGCCGAAAAAGGAGTGCTAGATTCAGAGA
TCTCGTGAGGCCACGGCCTCAAGTATGACAATGCAAGCCCTGACATGGCCCTTATACTGC
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ATCCCTGGGAAGCCCCTGCTGGCATTCATCGCCAACAAGCGGGTTGTACCTTGAGGAGTT
AGCTCTCTCAAGTACTCAGGACCAAACACATCAATCACAGTCTTGCAAAAACTGTACATG
GACTCTAGACATGTAGACTCCCTCATACGGACGTACTCATCAATGAGATCACCGGGCACT
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TGGTTAAAAACATGCCTAGCCATACGAAAACGCCATCAGAATTTTTGATGTTTGAACAGC
GGATTGGTTGTGTCAAAGTAGTCCTTCCAAAGAAGGAAATGACCGCTCTCTCGGTTACGA
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GAGTCGCAAAGGTGTGAGAAAAGAACTCGTCGGCGGAGTCCATTTTGTACCTTGGCAAAT
TGTCGAACAGCTTGCGGGCGGCGGCGAAGGAGCTGGTCGGCGAAGAGACGCGCGCCTCCC
TTG
