| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_38862
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_54073 |
1 |
601 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_54073
Contig Sequence (8429 bp)
>contig_38862 8429 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCACAAAGGCCCAGACTAGAGCGCAACATGGATTTCACCTTTCCAAACTCAGNNNNNNNN
NNCCACCATGAGTTTGAGGGGGGGGGTAGAGTTATATTAGTGATGTTTTTTGGTCTTTTA
CATTCTAGTCTCTTGACATCCTCGCGTAGCCTTTTGGCATTCTCATGTATGTGTATATAT
GTTAGCTTTGGCCTCCTAATAATATATGTTGCTATTCCTAACAAGCGCATCCGTCGTGCC
GTTCTCGACGCCGCGCCGATACTTGAAGGTGAACAACAGTCCGACGAGCTTGGACATGGC
TTTTCGCTGAAGCTCTGTGTCAATTGTTGCTCGCCTAAGCTGCACAAGCTTTTGTGGTCG
GTGAAGATGTGAACGGATCGCGTTGGAGGTAGGGGCACCATTTCTCGACGGCCATGAGCA
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CGTATATCTCGATGGAGAAGGGGCGTGAGAAATCCAGTAGCGCCAGGTTGAGTGTGTTAG
CCATTGCGTTTCCGAGTAAGTCGAATGCTGCTTGAGCTTGCTTGGACCAGACAAATCCTT
TCTTGGCAGTGGCGTGTGGAGAACGGTTATAGCAGGGTCGTCGGTGTCAGATCTGGCGGG
CGGAGTCGACGAGGCCGAGGGGGAAGCCACCTTGCGGACGTCGTCGACCTCGGCTTGGGT
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TTGGATCTCCACGCACTTCTCCGCCGCCAGCTTCTCCTCGTCAAAGCGCGTGAGCAGATT
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AATAGTACCGACGTCGGCTAAATTCACACGCCATAGCTATTTGCTTAGTGCTGGCGTTGC
GAAATTAGGCCTGACGTTGAACATTAGGCTCACGCGAGCGCTGGTCGGTTTTAACAGCTC
CCGGTCGATGCAGTAAAAAAAACTTATCATCCTTTCGTCTTCCTCTTGATCCCAACTCCA
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GCCGATGTTGCCTTCGCCCGACACCGCCTCCGCCTCCGCCCAACGCCGCCGCCGCCTCCA
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TTTATTTAATTTGTTTCATGTTTATTCATGTTAAGTTTAGAAGATACATCTTCTTTACAT
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CTAGTTTCTGGATAAGCTCCTGTGACCATTGGTGGGTGTATGGCTCACATAAAGGCGACG
TGAGCACCAACCAAGTAATTACGGTTACAAAAAGCATGCATGAGCTAACATTAAAAACAT
CCATATATGTAACCATTAATTAATTGGTTGATGATTTGAAACCCTTGCCAGACATACGTA
CCAGCTGGTGTGCCTTCTCCAGCACCTGTTGTGCACAAGACACGTAACGTGGACGTGCTT
AATCACGAGTTGGCCGGGGCACGTGAGTCTACCATCAAGGCCCTAAGGGAGTTGAATGAC
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ATGGAGGGGCAGATGAATAAGAATAAGCTCCATGAACAATAAGCTCCGTTAACTTAATTT
AGTCCTTCGAGGAAACTAGTTAGTGTCGAGAGGGGCACATAGATACATGTGAAGTTGCTA
CTTCTCTTTTCTGAATTTGGCATACTATGCTTGGTTTGTGAAGCTGGCCGGTACCATCTT
TTGTGAATTGTTGGCAGGTTTAGCAGGTGAAGCTGGTAGGATCTTTTGTGAATTGCTAAA
ACGTTTAGTTTGTGAAGGTGGTAGTATTTTTTATTAGCTAAATATTACAGTGTTGGCATG
CAACTCTGTCCAATGTCATAGGTATTCAAAATACTGTTGGCGTCGACTCCAATGCCACTA
CTATATTGTAATAGTGGCGCCATATTGGTGGTGTTGGGTGTCCACGCCACGAGGTTCCCA
TGGCTAGGCTTTTCTGCACTAGTGTCAAGTGAAGACTTTGGTGTTTTCTTGGAGACTTTG
AAAGTGAGGAAATTGATGTGTCCTTGAAGATATTGATGCGAGTAATATGAAGCATGGGGA
CTTTATTTCTCTTGTTTCTTTTCCCTTCTTTTGAGTCATAGGAACACCATGTTATTAAAG
GGGGTCGAGGTAATACTAAGGAAAAATTTCCAAGTGATGCTCATCTCAAAGCCTACACAC
ATCCAATCCTTCGAGTGAAGCCTTTAGAAATCTCTTATAGTCCACACAAATTCTCCGGTG
ACAGAGACGATGTTCTTCTGGTCTCTGAGGAAATTGGTCTCACTAAGGAGTTAGGATTTC
GCTAGTGCGAATTGCCTATAGTGAGGAACATGATAGCCCTGTGGACTTTCATAGTTCAAA
ATTTCGACCGTTGGTGCGCTTAGCGCTAGCTGTCCCAATACATCTTATCCATGTAATGGT
CATATCATTTGAGGCATTTATGTCATAGCATACCGGGTTACATCCTGGCTATAAATAGAC
GCCCCCATAACCACTAGCTGGTTGGCTACTCCGAGATAGAAATTGACAAGTTTCATTTGA
GAGCAACCCATCCTCCGAGGACTTTGAGAGAAAATCATCGGTGAGGAAAAACCCAAACAC
CCAAAAGCCCAAAGGGATTGAACATCACTGAAGATATTGTTTCTGTGTGGAACCGACGCT
TGTTTCCTTCGAAGATTGTGTATCTTCGAGACAATTACGTGACATGGTGTAGAGCATCCA
AGAGGAAATTGTGGNAAGAGGAAATTGTGGATTGTCGGGTGANCGAGTTTGTGAGGGTTT
GGAAGCCTCTCGTGGAGACTTACCACGAGTGTTGAGTGAGGTCTGTGTGACCTTAGCTCA
AGGAGAAAACGGTAAGGACTGTGTGTATTGGAATTGTGTGTCCTTTGGTTTAAATACCAA
GCCGCTCCAAACCAGACGCAAGACTGTCACAACAGTTGGAACTAGATCATCAAATCATTG
TCGTCATCGAGCTCCTGGTTATATTTCCTCAACCCTTTCATTTCCTTGAGTACTTGTTGA
TGAAATTGATCATTACTGTGTGACAACTTTGACTGAAGACTTTCTCAATTTCCTCAACCC
CAATTCTCTAGTCACCTTGTTCTTCACTTGCTTATCATGTTTACACGCTACTTGTGCTCT
GTGTATGTTTCGTTTTATCATGATAGCTATGGTACTGACATGTTATGCATGCACGGGAAT
GCTTATTCCGCTCCAAGTATTTCTTCACTTAGCAAATTATTCAACGAGTAATTTCTCCAT
GACGAATTTGTAAAAATTTCCTATTCACGCCCCTCTAGTCGATATAACGCACTTTTAAGT
GGTATCAGAGCAAGGTACTCCCTTGTTATATGTGATTTTGTTTTAACCACGTGGAGTTTT
AGTTATGTCAACTACACGTATGATCAGGGTCTCTACGGGTTGACCTACCTTCGAAGGGAC
GGACTACCCCTACTGGAAAAACAAGATGTGCATGCATCTTGAAGTAATTGACAACGATCT
TTGGTATGTTGTGGAAAATGATGTTCCCTCCATAACTCCGTCTATCAACGATGTCGACGT
GAAGAGATTTAAGCAACTTGACTCTCAAGCGAAGAATGTCATATGTGTCCATCTGAGCAA
AGTTCAGTTTGACAGAGTGGGTGCTTTGGGATCTACGAAGCTCATGTGGCACAAGTTGTC
CAAAGTCAACAAAGGAATCTCAACTTAACGTGACTCTCAGGTCGATGTTCTTCACAATCT
CTTCAACCGCTTCAAAAGACTCGACAACAAAAATGTTTAGCAAACCTTATATCGCCTCAC
TGATATCTCTAATGAGGTTGAAGCACTTGGTGCCACTAATATCACCAATAATGAGGTAGT
GAGGAAAATGCTTAGATCTCTTGATTCCTCATTTGATACACTAGCTTTGATGATTCAAGA
GCGTGGAGACTACAAGTCACCAGATCCTCCTATATTCTTGAGACTCAATACTCATAAATT
CCAACAATCTGAGAAAAGAGATCTCTATGGGCCAAGCTATGGAAGGTCTTGTGCACTGAA
GGCAAAAGCAATTTCCTCATCTGAAGAAGAAGAATCTGGTTGCAGCCTTGGTGATCCTGA
AGAACTTGGTCAGGAGCTTGCAATGCTCGTAGGAAAAATTTAGAAGTTCTCAAAAGAAGG
CAGTTTGGAAAACTTCAAAGAGAGATACGAAGAATTCAGAATCTCATGTGAGGACTACAA
GAAAATAACTTGCCACAAATGCAAGAAGTTCGACCACTACATTGCTGATTGGCCTCGATG
GGTAAAGGAATCAAAGAAGAAGAAATACAAGGATGTTAGTTTTGATGACTCAAAGAAAAA
GAAGAAATCTTCAAAGTCCTCATCTTAAAAGTCCTCGTCACACAAGGAGAACAGTTCCAG
AAAATCTCGGGCACTTATTGGCAAGGAAATGGACCCTGAGGAAGAATCTGAGGAATACGA
GGAAGAGGAAGGATCTGAGGATGAGTTGGACTCTCGTGTTGCAAACCTAGCTCTTGTTAC
CGCATTTGTGAGCAAGTCCATCTTCAACATTGAAGAAAATGATATCGTCAACGACAGTAA
TGACTGCGTCGATGACTCAGCTCCCACCTATTACTTCATGGCAAAAGATGCCAATGTAAT
CAAACATGCTTCCTCGTATGACTCAAGTGAGGATAAACCTGATGATTATCAGAAACCTAG
TTACTACAAACTTGCTAATATTGACAATAAGCAACAGTATGCTATTGATAAGCTTCAACA
ACCGCTGGAAAAAAAGCGACGACCTGTTGGACGAGGAAATTAATCAGACTCAAACTCTGA
CTGATGATTTTCAACATCTCCAGTCTAAGTTTGATAGCCTTTAGAGTCATCATGAAACTC
TCTTAGCTGATCATGAGAAGCTTTCTTATGAATTTCTTCAAAGAAAGCAAAATCTTGAAA
AACTAAGGGTGTCTCATGATGATCTTCAAAGGAAAAAACGATTATTTTCTTGCTCAACAG
ATCAGTTCCGCTCCATGAATGAAGAACCAGGAAGAATTCATTCCACCTTTTTTGAAATGC
ATCGAACGTCAAACTCCTAAATCTTCACCTGAAAGTTCAAATGCTTCTATTGTTTAATTT
CTTCAACTATATATGTGGTCACAAATTCCTCAACTAAGGAAACCAAAAGTATCACTAATG
AAAATGCAGGGTTGAAGGACTTGTATGTGAGAGGCATGTCTCGGAATCGGGGCTCCGCGG
ACCCAAGGAAAGGTTCAAACATTGTGGTGCGCTCGGCCTCCAACCCTGTTCAACCTCTCA
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CGAGATGGACCTAGAGGGGGGGGTGAATA
