Map Locations of contig_38832 (9987 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_38832

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_54036 4 1370 bp AK370375 Available Available None
MLOC_54037 1 2343 bp MLOC_54037.1 Available Available None
MLOC_54038 4 1244 bp MLOC_54038.3 Available Available LOC_Os03g49710.1, FRAME:-3, EVALUE:1e-51, 13103.m05402 protein ribosomal protein S13p/S18e, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_54036






CDS Structure of MLOC_54037






CDS Structure of MLOC_54038






Contig Sequence (9987 bp)

>contig_38832 9987 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGGCCTACCTCCCCGCCGCGCTCCTCCGCCGCCCGGCGCCCGTCGCCGCCGCCAGGTT
CTACTCCTTCGACCTGGTCCGCGAGTACCCGCACGACCCCGAGGCCTTCACCCAGGTCCC
GCTCCGCTCCCTCCTGATCTGGTCCGCTCCTCTGCCACGGGCAATTTCATCCTCGCCATT
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CCTCTTGTGGATTTCGTTTCTTGCACCTCAGGATAGAAGAATCTGCTGCTCCAGTTTAGC
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GATGTTTGGGGAAGGCCTAACGCTTCTCGGCGACAGGTAGACATACCTCGATTATACCTG
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CCCCTGTTTCTGTTTTAGTGCATTTATAGATGATTCAGATTTTTTTGTTGTAAAGTCTCA
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GGTTCACAATCATTCACCTTGCATTTTGCTGGCCATGTTTGAAGTTATTCAGCCAGTTTA
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TTAAATACAAGCCAACAAATTGGGTACATACACTTTGTTACAGATTGCGTTTTAATTCCA
CCTGCAAGCTTCGAGCAACAGATGCGCAAATTTGTTAATATGTAGCCTTCAACTCTATTT
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GTGGTTTGTTGCTGATGTCGAGGTAATAAGTTAACGTGTTCTCTGCTGCAGCGTGAGAGT
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AATCCACACGTTTGATATTCTATTAGCTTTGAGGCTTCATTTCTTTTGTTTGACATCTAC
GTTGATACAGTGACGAAGACAGTAACCGTGAAATATCAAGACAATGAAGTGTCCTATATT
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CTGAAGGAAGAGAACATTTCTCTTTAGTTTATCTTAAGTGGCATCGTTTTTATATCTTTC
GTCTAGACAAACTGTGGTTGAGGTTAACAAACTAACTATGGGGTGTGTATCAATTTTTAC
TGAGATGTACCCAAGCTTTATCCTGTTTTGTCCTTTTTCTAGTACTTGAAACTCCCAAAT
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AATTTCACATGCCGATTCGGTATCTCAGGTCTTTGCATGATTAGTTAATGCCATTTGTGT
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GCTGGATCTTTCTTCATGAGCTGAGGTAAGCCCCTAGTAGAAATGACTGTTGTTGTTCTA
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GTTAATTTGAACTCGTCCTACAGATCGAAGCCTACGAGGTTCATCTCCAATTAACCCTTT
GGCTCTACTACCACAGTGACCGGGAAATTGTGGCCAAAACTTTATGAGATCAAGCTACGC
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TGTTGCGATAGTTGTTGTATAATCGTGTATGTTCTCCACTGAAGTACAAGATGTATCCTC
TGTAAAGACGATTCTGCTACGAACAGCTTTAATAAAATGATAAAATGCATAAGCAGCCAG
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GGTAAATGTCGATTAACAGTACCACGGTGATGCAGTACAAACCAAACCAAGAAAGGGGCT
AAATAATGGCAGCATGACTAATTATTCCTGGGAGGGTCGCGAACGACTTGTTGGCAACTC
AAGCCCTCTTTTCCTTGCGAGTCCTGCCATTGGTCTTTGTTCTTTGGCCACGTACCGGGA
GCACATCCGCGTGCCGGATGCCCCTGTAGCATCTAATCCCTTCCAATCTCTCGACTGCCG
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TTTTGGTCGATCAAACTAAAAATGACAGATACGCCTAGGATTAGGAAGGCTTAGATGAAC
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GACCTTGTTCTCTAAATTGAGCTCTGAAAGGATCTGGCGGGCGCGTGCCCGTCCAATGCC
ATGGATGGACTGCAGCGCGTACTCCACCCTCTTGTCGTTAGGTATCACAACACCACCAAT
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AAACAAGAATCGAGTTACCAGCATGTGATTGTTGTTACTAAAAAAGGCAAATTTATCATA
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GAAAGCAGTTCGTTTGTGAGTGTCACCAAGCTGTGTCTGACCAAGGTCACACTGAACTTG
CTGAGGCAGCTGATTGAAGGATCAGTTAGCGAGTTTATAAATGTACTAGCAGTCCCATCT
TGTAATACGATGCATCAGTTGCATCCTAGCATTCGCTGCTGGTAAGAGAGCAAGTGTGTA
AGCATCTGATGCTGGTTAGAGAAGCATCGGTTGCTTGTAAGCATGTGTTGCTAGGTACTG
AAAGGAAGGGTATGTGACATATCTGGTGTTTGTCTACTCTGTTTCCTCTGTTTGTCTCTC
TGCTCTTTGTGAAACTAGGAGACAAAACATGTGTGTGTTTGTGTGTGCGTGTGTCCACCA
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AAGCAGGCAGGTCGACCCGCTGGAGATTCCCCTGGCGGACCGGAGAGGAGAGATCGGAGC
TGACGGCGCTCTCCCGGCGAGGCGGCGCGCTATGCCGCGGGCAAGGGACGGCCATGCGCG
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CTTCACGACCTACAAGTCATGCGGTGTGCTCTGGGCTGGCCCATTAATAGTTATGTGTTG
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TTTCAAGCATTTGAAAAAGCATTCATTAGCTCATAAATTTCACAAGCTCGAACCAAAATT
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TAAAATCATGATTTGAGGTCAAAAGTCCACAAGTCTGGAAAGCAATGTTCGTAGATTTGA
AAAAAGTTCACATATCTGAGGGAAAAATTTCATGAATTTTAGTAAAACTATTCACAAAAA
TAAAACTTTGCAAACTTGGGGAAAATCCCAGAATTTGAAAAAACAATCATTGTAAATATT
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TTGATTTGGATATATACACAGCCAGAATATTGAAAACGTTCCCTAGTAATATCGGACTCA
TACATGTTTGGTATTTTCTGTGATAAAATAAAGTGATACTGTTGTCGATATCCAGAGTTG
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TTAAATTCACACTTCTGCTAATCAACTTGCGTCTAAGAAATGAGTATTTTTATATGCAAG
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CTCATGTTCTCGCAGTGTTTGTGGAGATGGCATGCATATATATTAGAATAGCTACCACAT
GTTTGGATGTTGTTGTACCTCCTACTATATACTAACAATCAAATCCGTGCTAGGACCAAT
CATTTATTCAGTGATAGCCGGTAGGTTCTATATTTATTAATAGCGAGATGTTTACGAAAA
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TCTGCTATGTTTGAGGGATCCCTCATCACCATGTGGTTACTGCTTGTACTTTTCTTCTGC
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AATCTTTAGTCTTCTATGGTTGAGGGCTCCTTCATCACCATGTATTAGTTTCAGGCGTGT
TGCTTTATATATAAAGCAAGACAAAAGCCTGTTCCGAGAAACATAACTTGGAAAACTATC
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TTTTGGCATGGCAAATCTCCCGTGTAGCGACCTAGGAGATGGCGCTCTGCTAATGGCCGG
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GCTTAGACCGTAACAATCCGATGGCAATTATGACTTACATTGTTTCTCTAAACCATATCA
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GTTCTGCAATTGTTCGTCAATAATGATGAGCCATTATATTTCTCTAGATGCATGAGAAGT
GGTTGATTGTAGTTTTCATGCTCTAGAAAAATAGACACACAAAGTTTGGAGTTGTTCCAG
ATCCCAAATGCTATATCCAGCTCAAACAAGATAATAAAAATAAATGGATGGTCAATAACC
ATGTTCTTTTCTTCAAGTTCTCAATGTTGTTACCTATAAGTCACACTCTACCTCAACATT
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TAAAAGATGCCATTGTAATTCCTTTGCACTAATAGTCTTTTCTCGGGCTATTCTCCTGGA
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CTTTTCAACTTATGTTCTCAAGAAAAATTCCCCCCTACCTATAACTTTGCGTGCTAAATT
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TTTTTTTTAGCCACAACAACTATTATC