Map Locations of contig_38386 (8922 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_38386

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_53460 1 609 bp MLOC_53460.1 Available Available None
MLOC_53459 2 4851 bp AK371808 Available Available None
MLOC_53461 1 800 bp MLOC_53461.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_53460






CDS Structure of MLOC_53459






CDS Structure of MLOC_53461






Contig Sequence (8922 bp)

>contig_38386 8922 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGGCGCCCCCCCCGCCGCCCCCCCCCTGCCTGC
GCCGCCCCCTCGCGCTCGTCGTCGCCGCCTTCCTCCTCCTCGGCGCCGGCACCTTCATCG
TCTGGCTCCTCCTCCGCCCGCGCGCGCCCGCCTTCTCCCTCTCTTCACTCACCCTCTCCC
GCGTCGCCTATTCCCCGGCCAACTCCTCCCTCTCCGCGGCCTTCGACGCCTCCCTCCTCG
CCGACAACCCCAACTCCAAGCTCACCATCTCCTACTCCTCCCTCGTCGCCTACGTCGACC
TCGCCCCCTCCTCCCCCATCGCCGTCACTTCCCTCGCGCCCTTCGCGCAGGGGCCCCGGA
ACGCAACCACGCTCGCCTTCCGCCTCGACGTCGACGGGACCTACGTCGGGCCCGACGAGG
CCGCCGCGCTCAAGAGCGGGAACGGGGGCACCATGGAGGTCCAGGTGAGGCTCGCGGCCA
TCGCCGTGTTTGATAGAGGGGGCTGGCGCACCCGCCGGAGGGCCATGAGGGTGCTGTGCG
ATGGAGTGCCCGTCACATTCCGTGGCAAGAACGCCACCGACGCGAAATTTGATGGCCCGG
CACGCCGCTGCCAAGTCGTCTTGTGAAGGTTAGTTGACATGATTCCAGTACCTTTAGTGG
TTATGCCTTCAATTTACATCCAGAGAGAGTTCCGTGTGGTAACCCAATTTTATTTTGTAC
GGATTGTAAGAGTGGCAATGTATCTGTACCTATGTCCGTACTATATTCTTTCCTGATGTG
GTGATTTGCGAGTTTGAAAATATGGTCGTTTGCAGCCTTGATTTTGATTTTGATGTTGAT
TGCCAGATGGAGAGATGGGTCAAATGGTCAACTCGAAGGAGTGTGGCTGTGTTCAAGTCA
TACTATAGTGTTGAAATGAATTGTCAACGGGAGTCAGAGAACACACTTTCAATAGAACAC
CCAAAAAATAGTAAAGAGTCGAACAGATGTATGAGTCGCTCATAACCTTCCACTACTAAC
AATATCCGAAGTTAGGCAATAGGAAATCTGGCAAACTGCAAAATGATAATTATATTATAT
TATTACTTTCCATTTTTGTAAAATTTTGTGAGGATATATAAGAAAAACAAAGAAGATGAT
CAGTTAATAATCCACTATCATCCTTTGATGTTTCAAGAGAAGGAAACTATCTATTATTAA
AAATACAATCCATCCCTACCAGGTAATGTGTATGAGCTGGGTGTCTGGCTCGGTTATCAT
TTTGTTTGTGGACCAACATCCACTCCATTTTGTTTTCTTGTCTCTAAAATACACATCTGG
ATCTAAGTTTCTCAGTCATTTTAGAGACAACAACAGTCCTTGTTGTTGTTGTTGTCTCTA
AAATGACTGAGAAACTTAGATCCAGATGGGTCTAAACTTGCCAGAATATAACTTCTACCG
TGTAATGTTAAATTTTAGCTCTATCTATAGTTTGAGTCCTAGAAGTTGCACATGCATTCT
AAAAAATAATTTGGATGGCTCCTAGTGTTTGGGACCTAGATTTATACTACAAAGTAAAGC
CCGCAAGTGTTTCTTCGTCAAAATTGCGCATATGGGATTGGGTATAGTAGCAGCAGTGAA
CTTTTGACTGCTGCAAACTAGAGATAGAACTACATGAAGATGAATCTTAGTGAGAAGTGT
TAATTGTCCGTACTATATCTGTGATTGAGCTTAGGACTTGCTGTGAACTATATTTTCATA
TGCAAGCCTGTACACTGGCATATAGCTTCATGGACTGATTTTTGGAGTGCCCCATAGTGG
TTCACTGAATTGAAATGAATCAAATGATATATTTGAGGGCTGCATCCTCAGTTCAACTCT
TGTATTAATACATAACACATCATCTGAAATTGGGAAAACAAAGGGAGGCATAGGGCAGAG
TCTTGGATCTGACTTATTTAGTGCCTGTTTGGGACCGCGCAGCTCCATCAAAATCAGTTC
CGGTTCACCAAATCTACTTTGGAGCAGTTTCATATAGGAGTTGCAACCATTTCAAAGAGA
ATGTTTAGCTTTCATCTAGCTCCAGCTTCACGAATGGAAAATTTGGTGGAAAGAATCTAT
TTGATTGGATGAGAGGGGAGAAACGAAGGGGTATCCACTTACTGATGGCAGTGGTGGGTA
ATTTTCTTTCAACTCCAACTTCTACAATTTTATGGAGCACCTCCTAGAGAGCTTCACAAA
AAACAAGGAGCTGGACCCCAGATTCTAGTTTTTTTGCGGGGCGGTATATCCTGGAGCTAC
CCCGTATGGCTTACGTTTTCTAGAGCGGAGCTGAAATTTTTGGAGTAGAGCAGTCCCAAA
CAGGCTCTTATTGACAGCTCTCATTCTACTCGTATGCTTGTGGAGATGAATTTGTCAAGT
TGTTGTGTACATTGCGAAATACAAGTGGGTTTCTTGTGCCGCCAAAATTGGCACTTTAGT
GATCTAAACGGTCTTATATTTCTTTACAGAGGGAATACTGAAGAAAGATTTGGCCTTATG
CCATAGTTGTCTGAGCTTCACTTAAAATTTTGTAGTCATAGGAGGGAATAATTATGATCT
GGCTACAAAGCTAACCTCTGTTACCCCCTCCGATACGAATTCATAGGGAGTACCATTATT
TGGGTATGGGGAATATGTTAAATTGTGCCTTGATGGTCTGTATATTAAAATTTTCTTTGA
GGTTTCCTGTGTGGCTAATTTCACATGTAATAAGTTCTAAATATCGCCAAATCATTTGTT
TTGACACTATGATGACCTGTGAGATCATGGTAGTTGTCCACAAGGGCCTTACAACTGGAT
GGTTTTAGCTGTGAGTTGGCGTCATAATGTTGCAGATCTACAAAAAAGATTCCAAATGTT
TGCATTTCTGCATGTTCCTGGAAATGATTGCATGGCCACTAGACTACATTCTTTAATATA
TATGTTTACTGTTATTAGGGAACCCCGTCAATTATAGTTGGGACGCTATATTGTACTCCC
TCTGTAAACTAATATAAGAGTGTTTAGATCATTAAAATAGTGATCTAAATATTCTTATAT
TAGTTTACGGAGGGAGTAATAGTAGACACATTTCTTTTGTTTCGGTTTTTTCCTTGTTTG
TTTGCTTGAAAGAAACTATATTCACATTGTTCTGTTTCTGCATGTTGCCATTAGTGTCTT
ATTATTGTACTCCAGCTGCCTAGAGGGGCACGGCGCATTTCCTTTTTTGTCCATGTGTTA
GTACTGCTTTTTTACTTTAAATATGTTGGTACCACACTTGCTTATCGTCAGCTTTGTCAC
AGGGTATTTATGACTACATAACCATATACACATATATATAGAATATATCGGAACTTTAGT
TGATTTTATTATCTGAATATTGTTATACTACTGTAAACCCTGGACTATGTAGCCATATAC
CATGTTAAAAATAAGACTTCTGGTTCGGATTGCCTTGCAGTATGATCAAAGTATGATCTT
GTCATCCAGTATTTGTACTCGATTGCACATCCTTTATTGTGTACTGCTAAGGCATATATC
ATAGCTAACTGTTGGCTCTTATCACTTATCAGGATTGTTCACGCCTGTCAACTACTCCAG
ATGATGATCTGAGGGGCCACCTTCAATAGGTACGAGAAGGTAGCTGATCTTATAAGAAGT
TGGCCAGCCACTGATTCATGAGTGATAGCTGGGTAACTTACCTGCCTGCCAATAGAATCC
ATGACCAGGAAGAGTCTGAAATGATGCTTAATTGATAGTATGTGACTTTTTCACCCGTCA
TATCATAGCTTCAAGATGGGTGTACATTGAATATACCGAGTGTGCATGTGGGAAATGCTT
GGCAAAAATGATTATCCCTGGTTGCTAACTTCCTCGAAATGAGAACCTCAATCATGTATG
AATCCTTAGGGGTGGGCTTCATACTTCAATGTACCTCCGCTTGAAACAGGCTCTAATCAC
CTATTGTGCTTATATTTGAAGTTCTGTATGTCCAGGATCTCTGTTTGCATTTGTAGTTTA
GCTAGAGAAAAAAATGCCAAAAAAATTACCGTGTATTGCCGACTTGAGAGTTGCTGTTGA
TTGGGATTGGCTGTTTAGTTTTAGCTCCTTTGTTGGCTACAGATCTGTGGTCCAGCATGG
CGGATCCTAATATGCTCCGGTGATCTTCCAGAGCATGTTGTTTCAGACTATTTATGTCAC
CGTTTCAGTTAATCTGATCCAAACAAACTTTCGTGTGACAATAAGCTGGTGCTCTCTTTG
TGGATGGAATCCAGTTCGTATATAGAGAAATGCTGTTCACTGTTGTCTTGTTGTACACAC
TGGTGATAATCTGCACAACGGAACCTGTAGCTTTCTTTTGTCATGAAAATTAGCAGGCCG
TGCGGATTTAACGGTAGTTGTATTGAAGTTTGAATCAGAGGAAACTGATGCTTCCTGATT
TCCCTCATAACATTGGATTGATCTGCAAAGCCTGCTTGGATCACACAACAGCAAGGTCAT
GCCTTGTCACTATCTGAATTTAGCCGAAAGTTGGTATCAACCTTTTAAAAGAAAAATTAG
GCTGTTCCTGAATACAGCTGTTTAGTTAGGCGCAGAAGCCAGTTTCCTGTAAGGTGCTAG
ACAATTCTTTGACATGTTGGTACCGTATCCAGAAGAGGGATATACTATTAAGGGAAATTA
GGTGGTTCCTGAATACATTTGTGTAGTCTGATGCAGAAGCCAGTTACTTTGTGTTTAGCA
TTTTGTGGAGCAGCTTAGTGGTTAAGTATGAGCATAGCTAAAATGCAGGTACGCAAGGTT
TTCTGTAGCTTCAGATGGAGTTTGTACAGTCTGCACGAGCGGTAATTCCAATCAGTGTGT
TCATCCCTGTTACCACGGTTGGTGTTTCCAGTCCTACGTTTTTCCTTTTGGTGAGTGTCC
TTGTTAATGATCGTTAGGCGTTAAATCCAGTGCTTGAAATGGTTTGGTTCTGTTTGTTGC
ATGATGCCTGCTGGGTGTTGTATATGAAAAGCATTGATGGCAGGCATTGCCCAAGACCCA
TCCAGTAATCATCAGGAGCCAGTCAACATTGCAAATCGATACAGCCTGGTATGAGTCGTC
GTCTTCCAAGTAGGGCTCGTGGGCTGCCAGGCATTGGCATGTTTTTCACCTATTTGTTTA
GCTTCATGTGCCGAACTTACTACGTTTGTGCAACAAGATGCTGCACAACATTACCAAGGC
CAAAGCCGCATCGCGTCCCCGTCGTCTTTAGGTTAATGTTGTTAATTGGATGGTCGATCA
TGGTTGCACTTTGCAGAAGACAAGCTTTAATTTCTTCCCAAGTGGCCGACTTAGCCTTGC
TTTGGATGGTGGTGGCCATGTACGCAACAACGCAAGTGACATGACAGGATATGGAGGGCA
ATGCGGACGAGGCTAGCAGGCAGCCATGCTCGGTTGGTTGTTGGGTGGTCTATTGTGAAG
TGAAGTGGACTGAAGAGGAGGATACCTGACCTAATGTAATGTGATGTGGGGGGTGGTTCA
TTAGAATCTTGCCTACTCGCGGGGTCCCGGGTTTCCTACTCCCCCCTGTTGAGAAGATTT
GCGCTTGTCGGATTATTATGGCTTTTATCAAGGGACAATGGACGATAACGGATGTTTTCG
CCGGTGCTGCCTGATAGGATTACATACAGGGGGTTGGTTGGGGTTGCCCAGGGGCAGAGG
GGGAGGATGATCTTATCTCCTGTCTGAATGGGGGCCATAAGATTTGCATTTGTCCGTGCA
CAACTTCTATCGAGCTCTCCTTTTTCTTTTCTTCTTTCTTTTTTAAAAAACATGATGCGT
TATGGAATTGATTGTAGTAGTAGCTATTACTCTCTCTCTTCCTACATATACTTAGGTACA
GACGGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTGCGAAGGTACAGACGGGAGTACTTGATATGTTTC
TACCAAGTTACTGCATGAAGAGATTTGGTAGCATATTGGCAACAACGACACGGGAAAAAC
GATTTGGTAGCAACAGGGACCCAAACCGTTACTGGCTGAATTTTGTTTCTATTTCAATTC
TTGTGTCCTGCCAATAGCGGGAAGGAAGGCAAGGTAAAGTCTGGGTCAAACGGGGTCGCG
TTACCTAGTAGGTTAGTGAAAGGTGATTGCAACAGTGGAGAAACTAGCAGTAGAGAGGCT
TGCATTTATCCGGGCTTGCTGGCTGTTGCTCGGCGCGCATTCGCCATCAATGGTTGTTTC
CTTTTCTATGCGAAGGCGACGGCCATGAGGGAGGAAGGAAGGAGGGGTCTTTGTCCCCTT
CTCATCTTTTATCATCCATCGGTGCGCACAACTTACATGGCAACACAAAGGTCACGTCCA
GTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTCTCTCCCCTCTCTCTTAACACCCAGAGACAAGGCTTG
TCAATTGTACAAAGAAAGAAAAGGTTGAAGAAAGTTAATGGTAGTGCTAGTTTGGTCGCC
GGATTTGGTCTAGCGTCACAATTCGTTAGTGGCCACTGCCCACTGCACTGCACTGCATGT
ACGTAGCAGAAGGAAGGAAGGAACGAACGATCCACGACGCCAGCCGGCCGGCCAGCCGTG
GCTCTCACGCAGCGTAGGAAGGAACCGGGATTAAGAATCAATCGTGCAGTCCAAGGCCTA
AAAAGGTGGAGCCGACTGGGCGCACCGCTTTCGCTGCAACCACCGCCGCCATGTACGCCA
CGAGAAGGCCGGTGCCGCGTCGAGTCGAACCCAAGATATAGGTAGTAGAACCGCGTGATG
AATGGACTGGACTGACTGTAGGACGCGACGCCGCCTACCGTGTGGAAAATGGGTGAGCAA
CCCGCACATGGCGGCGAAGCTTCCATGCATGCCTCTCGGTCGAGCCTGGACTTTCCCGAT
GCGTCTAGGCAGGCAGCGGCAGCCGGTGGGTGCGCGTCCTTTCGGCACCACCCCCCGCCA
CCGATACTGGCAGTGTTATAATTCGCCCAGGGAGGAGTAAACTGTGAGCCATGTGACCGG
AGGCAAACAAGTTGATTAAAACCCCGTTATGAAGAGACTTTGGAGTGACTCCACCTGTAT
CTGTTGGTTGGGACGCATGTGTCCCTCCCGTACTTACCAGCCTTCGTATCCGTGGAAGAA
GCCGTGCTTCGGCCGCATGGTTCGCACGCACTTTGGCTCAGCTCAGGATGGTCGCCATTC
GTATATGCTTACTTGCTGACTACTCCCTTTATTCTGGTTCAGATCATTGCAAATCCAGCC
CCCTAAATGCCCGTGGGCGGACCTGGTTGGTCACGTTTTAAATTTCTCTCTCTCTCTTCA
CATTCAACCACTAGCTAAGCCAGAAAATTAGTACAAGGGAGGCGAAGTATAGTTAAACCT
TGTTAGGGAGGGCCAATCCATCAAAAAACACCATTTTGGCATATAAAAAATCTATTACTA
TTCATTCTAGGCTTAAATCACTAATGTTAGGGGGCACGGCCCTGACTGGCGCCCCCTGTC
TCCGGCAGTGCATTCAACTTCCTCATATTTATATAAAAGCATGCGGAATATATCTTACAT
GCTAACTAGTGTACTATACTTCTTCCTCGTCACGGATGGCCTGATCCGCCTTTGTCGGAG
CGTGAGCCGCTTGCACCGTCTCTTGCATCGCTCGCGCTTCCTCCATCTGTTGTCGACGAA
GACGCCTCACCTCTGCAGCCGACTTCAAGCGGATGGAGTTGACGATAGCCAACTACTTCG
GCCACAGACCGATGATCGTCGGCGATCGTAGGCGTCTCCTCCTTCAGCGCTTGCGGCGTC
GCCTCCTCCTTCGATTCCGCCGCCTCCTCCGACGCATCTGGCTCCTCTTCGGGCTCCTCC
CTCATCTCCCCCTCGAAACCCTCCTTTGGTTCTAAAGGTAGCCGCGCTTCCTCGGATTTG
GACCTGCTGAAGGAGGAAGAGACGATGCTAGATCATGTAATGTTGGTGACGTGTGGTATG
GCTGACGGGCTCGGAGAGGGAAGTGCGAGAGGAGGCGGATGTGCTCGGGTGGCGGCAAAG
AGAGGGAGGAGGCGGATGTGCTCGGGTTGGGGGGCGTCGACCGGCTTAAATAGACGGCCG
CGACCTCTGACGGGGAGCTGGAGCGACGCCACGCGGCGTTCACACCGCGTCGACAGTCGA
GGCGCCTGTCAGACCGGCGGGTTTCCTAGTGAGTCTGCATGGGGCCACGTCGTCATTCCG
ACGTGGCGGGTGTGCCCCGGCGCTCGGGCTTCCCCATATCCGCCTCATATTTGGGCCGGA
AATCGGGGGTGTCGGTCAGCCCGGGCGCTTGAGGTCGGTTTAAGAGGACCTTGTGGATCG
CATTTTCGTCATCGGGGCGGCCTGCCTGACCGTTTGAGACGGGTATGAGGGGTCTGGATG
TAAATGCTCTTAGTCCATATTATATTTAGGGAAATGTTTCCTATCAACCGGCGGATCGGT
TACGCGCGTCGAGCATCTCCGCAACCGTTCGATCAACACTTAATCGTGCGGCGACAACAC
TTCTCATACCGCACTCGTGTTTTGCAACTTTGGTCGCGTTGCAAAACTGCCGAGCGCAAC
ACATGGCATGTTGCGGAACGCCTAGTCCATCTATTTTTTCGTTGCCTCGACCAATGCACA
ACGTCGCCGAGCAGGAAGATGCATGTCACGCCAGCGCACCCCATGGCGGGCAAAGAGATC
ACCCCATAGCGTGTCTTCCGCCTTCATGTCGGATCTATCGAATTCCTCCCCGCTGACCAA
ATCGAGTGCCGCCAACCTTGTTGTTGCTGCATGCATTGGTGATTAAGCTGAAGGTACGGC
TGCAGTGATGAGCAAAGATGAAGTTGTTGGGGAGCTGGAGAAAAACCAAGAAGTTGCAAA
AGATGTTGGTCAAACTCGTGAGTGATACGTCTCCAACGTATC