| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_38369
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_53435 |
4 |
2218 bp |
MLOC_53435.4 |
Available |
Available |
LOC_Os09g39210.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13109.m03926 protein nuclear pore protein-like, putative, expressed |
| MLOC_53434 |
2 |
470 bp |
MLOC_53434.2 |
Available |
Available |
LOC_Os09g39210.1, FRAME:+1, EVALUE:8e-80, 13109.m03926 protein nuclear pore protein-like, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_53435
CDS Structure of MLOC_53434
Contig Sequence (7987 bp)
>contig_38369 7987 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGACATTGTATCCCCCCTTGGAAAACTGAGAATCAAACTGTTC
CCTCTTCCCTGTGCAAGTCTCTTTTCCATACAGGCCCTATAGTGCTAGCATTTCTAGTTG
TCATCACTATCATTTGGTTGTGCTTATGTAAAGAATAAATGGGTTCTGAGTACTTTCTTC
TTTCCTCTAGCTTTCTGTTAAAGGTGGTCCAAAGATTGGAGTTTCCATTGAGTACACAAG
TCTGAACGTGGGAACGTTGGAAGTTCAAACTGCTACTGGAAAGCTGTCTGCAAAGACTGT
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TGAGCCCTAATGTCTGGTTTTTGTTGTTACAGATCTGCAGGGAAAACCAAGATCTCCATT
TCAGTTACTTGTGATTTCTCGCTACATGGCAGTTCTGGATCTGTATCTTATGATGCCTCC
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TATGCTGATGAATTAGGTAACACATTTACTAGTGTCGAATGCTTAATCAATTCTTCGACT
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GTTTTTCTTGGTTTCTTTTGATGGGATGTACATATTGAAGTGCTGCCATGTATTGACTAA
CACTTGTTTTTAACTCTCAGGTATCTGTTGGTGCGCGAATGTATCCGAGAGATGTGGTGA
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TTTTTCTACTAGTAGTTGTTGCGATTATCTTTTAGTATTGTACAAGATATTATCTCTGGT
CACATCATTTTGGTGTGCTTAACCTTATTTGTGCAGTTTGCTTACTGCATGTTGCATTCT
AAGTTAGCACAATGCAGTGATAGCATTCTAGTTAGCACTATGCAGTGATCTCTTGAATAC
TCTATAAATGGACGGGAGTTGGTAGCATAGTAGGTGAAAGATAGGCAAACACCAGGAAGT
TTGCAGTTAATACATGTTTAATAAAGCAAAAGATCTTGCTAGAGAAAGGGAGCAAATTTT
TTAGCTTAATATCCTGCATGAAGTAGACAGTTGGTAGCGATGTTCTGTGTTTGTCAATGT
TCTTGTTTTCATAACCATGGCCTATTGTTGTTATAGGCATGGATGCGCGTGGACCTGGCC
AGTGGTTAAGTACCAACGAAAATGTTATGCGTGTTAATCAAATAACAGGTGAAGCACATG
CACGTGGTGAAGGTATAGCAGAAGGTATGGAACTACAACCTATATTTGCTTAGTAGATTG
CATTGTTGAACTTCTACACAATTCATTTCTAGTACTTTGGGTTTTGATAAGCCCTTTCCT
TATACAGTGATTTTCAAAGGCCCAAATCTGAAATTGCGGACAACTGTCAATGTGCTCAAG
GTGAACCAGATAGTTGTTGATGCTCCTGCAGAGATTCTGACGAATGCTGCTGTCCCACCT
GATGGATACAAGTTCTCTGTGAAATTAAGGTATGTAGTGCTCATATCATCATACTGCTTC
CACATGTGTTGATTAATATCTAGTCAAATTCGAAGTCACTATTGGGTAGATGGTCCTGGT
GTTTATACTTGCATTGTAAATTAGATATGATCTTATGTTAGAATAATGTAACAGTAGGTT
ATCATAGGTTTGTGGTGCACCATAAGCCTATCAAGCTGAAATTAAGGTATAGCAGTAGGT
TATTATAAGTTGGGACACTTATTTTGGGACGGAAGCAGTATTACAAAAATGGGCCCTGAG
GTCATAATGCTGCTTTTGATACTACCTGCTAATATGATCTGAGACTAGAAGTTTCAGATA
TAATATGTAAAAAATAGATAGCATAAGATATGCAATAGGTCATACTCAGCAAATATAATT
ATCACTACATTAGAGAGTGAGAGGACAGGGAAGCATATAGTTGTAATGAAAACTAGGCCA
GTACTGCTGTATTAGATAATAGTCTTTACAAACAATATAATCACTGCTACTACCTCCAGT
CCAAAAGGAATGCAGTGAACTATTTTTTTTTTGCTGTTTACATTTTGATACTCTTGGATT
TATTTGTGCTTTGTGGAAATTAACCTTTTATTCCCTTGTTGAAAAAAGTGATTCAGCCGG
GCATAGCACAGAGTCCTCTGTGAAAGATCAGATAAATGTCCCATTTGACTGCAAGGTCGA
ACCCTCTTTTGTCGGGTATGTTTCCCATAATGGTCATTCGACCACCTGTTCCTCATTATT
CTTTTCAGGGATACATCGAGGTCTCACTGTTTTCTCTCCTTAGGTTTGTTGAGCCATGGA
GTGACCGCGCTGTGAAGAAATCCTACTGTGTATTTCATCCATACTCGCCCGCACAGCTGT
TGCCTGTTGAGTCGAACCCAAAAGACGGTTTTTTACACATTTCAGTTCGTGCAAATCTGA
AAGAAGATTCTATGGTGACTGGATCTGCACATGCCCTGTTTGTCAAAGGATTTTACATTA
AAGAACCTGGAAAGGTAGCTCCCCTCGCCCAACCTCTCACACAAGCACGTCTGTTTATTC
CAACTGACTGTCTATCTCATGCAGTTAAACTTGACTCCAAGCTGCAACCATAGCATAATC
ACTATTGGCGGGAACACTGGTATGGCAAAGCCTATTATTTCTGCAAACTTACCTTCGGCT
GTGTTCGTTTCTAAAGCCTGAGTTGTATTCCTGGCCCAGATGCTGAGTTATTTTGGAGTG
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AAGTTGTCTACCGGGTGAGTCACAGATGACAAAGCATCAATTTTTGTATCAATGCTTAAT
GCTGTAAACAAATTCTGACTGCCATCCTTTTTCAGGTGGAAGCACTCAAAAGGCAACCTT
TCGTGGATAAGGTCACTATAATTCTTCCAGCCACTGGTATGCCATTCTATCTTCTTTGCC
ATATCCTTGTAACAAGCTGACTGGTTATCTGAAAATAGTATCTCTTGGTCTGATGAGCAT
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GTCCACCTAGTATTTCTACGAAAAACTCCCCCTAATAGTATATTTCTGTGATTTGAGTTG
AGTTTTTGCTGACCAATAGGAATTGCTCCCTGATGATTAACTCGATTCAATTGTTTTCCC
CTTGTGCAGGCCAGACTGAAGAATTAGAAGTTAACTATGTTACAGGAGACAAAACAGAGC
CATCGTCATCAGGCTTAATCACACTTGGTCTTTTCATCGCATGCATCATCGTGCCAGCAG
TTATATTCTGGCCCATCATGAAACTACTGGAGAAACTGACCCGGCGGGCACCACCACGGC
ATGCAGCGCCTGCACCAGCAGCGGGCCCTGCCATGGCGCCTGACCCTGCCTCCCCGGCTA
TTGGCGAGTTCTCTCCTCGCACTCCCCAGCCTTTCATGGAGTACGTGAGGAAGACCGTCG
ACGACACGCCTTACTACAAGCGTGATGCGAGGAGGCGATTCAACCCTCAAAATACGTACT
GAGCGTGTGTAAACCGGGCAGTAGAGTCGCTGCTGCTGTGTTTCCCCCCTAGTTTATGAT
TTAGAAGGGTAGCCTTGTAATCCCTGTACTGTAAAATTCGTGTATCATCAATACTACGCT
GCCAATTTTCAAGTCGTGGCGGCATCTGTATGAGCAATGGTTGGTTCTGAGAAAGCTATA
GAGCTAGATAGATCACTCAACAGATGGTTTTGTAGAGTAGCTTTGTAATTGTAAAAACCT
GGGAGCTCTGTATGTAAATTAAACCTGCTTAATTTGGTCGAGAAGCCATTACTGTGATAG
ATAGCGCGCACCAGTACATCATTACATGATATTTTTCTCTTTGTTACATTCTCTGTGTTT
TCAGGTATGTATATACTTGTCCTATATCCGTAAGGCTGTTATTGAAAAATGCCGTACAAT
GTGTCCCTGTTCAACGAGGCTCTGAAACTTGTGCGGTAAAATGCGTGACAAAGCAGGCTA
TTTTTCAACAACAGTCCTTGAGTTCAAACATCTTGAAAATACATCTTCCATCAAGAATAA
TTTTCAACCACGTTAGGTCAAAAACCGAAGGAATCAAAGTCAACCAGTGGATCTCAAGCT
CTATGAACTTGTATATTTACTTTTTTTTTACTGGAGCTGTATGAACTTATAACTTCTTGT
GTGGTGAGGACGACCGAACAACGTGGTTAACCCAAGCTACAACCAACTCCAAACCGGGGT
TGCCCCCACCTCACCTGCTTTGAAAGGAACCCACATGGGATCCGCCAGTAGTGACAACAA
TATAGGAATGTTAACAATCTGAAGCCATATTTATAAGCATTACAAATCAAACGTTTTTAT
GAAAATTTTCATGTCGTGAGCATATGACAATTCCCTTAAGCAAAGCATTGGCAAATCTTG
ACAACAAAAAGAAAAAGACATGCCAGAATTTGTCATGCTTGCTAAAGGGAATTGCCAAGC
TCGCGGCACGTACTTTGCCATAGAGATTTTAATTAGTCATGTTTAAATTCTGATATCAGA
TTTATAACGTGGTCCATTAATCATACAAAAGCCCTAACCATCTTTATTTCTAAAAAGACA
GACAATTGATCTAGAAATAAGAAAATAGTGGTACACAAAGAGGCCAACAATTAGAGGAAC
GGTCATGTAGCACGTAAAGAGATAGCTTTGCTATAAGGAATAAGGTAAAAGAAACTTAAT
CACAAAAAAAAGGAATAAGGTAAAAGAGACACCGTTTGGGATTACTAGCATTTCTCCGCC
ATACATAAAAGAATAAATGAATAGCAAAACCGAGAAAAGAAATCAAGTACCCCCCCCCCC
CCCCCCC
