morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_38211
Source Contig contig_38211
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_38211 (6582 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
		No map location
Predicted Genes from contig_38211

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_53292	13	2273 bp	MLOC_53292.7	Available	Available	LOC_Os09g12500.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13109.m07559 protein EMB1381, putative, expressed
MLOC_53293	1	734 bp	MLOC_53293.1	Available	Available	None
CDS Structure of MLOC_53292

CDS Structure of MLOC_53293

Contig Sequence (6582 bp)

>contig_38211 6582 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGCCGCCCGTGGCGCGTGATCCCGCGGCCGGTTATGGAGACCGTCC
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GCTGGCAATGCAATTTTTTTGCAGCATATTTCTGTAAGTATAAATATATGATCAAATTCT
GGACCAGTTCATGGTCTGACGTGCGCATAATACTACTGTCACTCAAATTTTGCGGCATGT
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TGCCAAAATGCTGAGGGTGTGAACCAGTTCATTCCTGATTTGTTGGCCCATCTGTTCCGT
GCTTGTCTTTTCCAAAGGTTTTCTTGTTACTCGGAAAAAAACTGACGTTATGAGCGCAAA
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