| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
 |
 |
Predicted Genes from contig_38147
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_53211 |
1 |
1317 bp |
MLOC_53211.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g52860.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13102.m06025 protein phosphate carrier protein, mitochondrial precursor, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_53211
Contig Sequence (7651 bp)
>contig_38147 7651 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGGTGGGGCTCGGGCCAGGGGGGGGGGGGGCGCCCCGGCCGGGGGCCCCCCCCCCCCCCC
GCGCCCCCGCCGCGGCCCGGGCCGCCGGCATCGTCGGCGCCGGCGGGGCCGGGGGCGGCA
GGCCCTTCTCGATCCGCGCGCCCAACGAGAAAATCGTCATGTACTCGCCGGCCTTCTACG
CCGCCTGCACCGCCGGGGGGATCGCCAGCTGCGGCCTCACCCACATGGCCGTCACCCCGC
TCGACCTGGTCAAGTGCAACATGCAGGTGAGGGACCTAGATCTGCGCTCCCCCGCGCGTC
CGGGGCTCCGTACCCGACGGTTTCCGCCTAGATCTGGCCGTTAGCTTCGATGCGGGCGCG
AGTTTCGATCTCCTCCGTCGTCTAGGCAGGCATTTCGCGATCTGGATGCGTAAATCTAGC
CTGTTTCCGCTTGACCGCGCGTGTTGGTGCTGTCTAGGATTTGTGTATTGTTTTGTTCCC
CGAATGCCTTTTGGTTTGCCCAGATGTGCTTGCTGCGCTTGCTTAGGAACTGGTAACTAG
TAGGAGTACATGCTAGCAGTCAAGTATTGCACTTCCAGTAGGTACATTTCATCGCTTGCT
AGTTGATTCGTGTGTCTTCCTCATCGGAGTAGTCTCGTTTTGGTACAAATTGTGTTGTTG
AAAATGTAATTCTTAGGCGTTTACTTGGTTCAGTATTGTCGTGCAAATTATGTTGATGGA
TGTGTAATTCTTAGGGGCTTACTTGGTTCAGTATTGTCGTGCAAATTATGTTGATGGATC
TGCAATTCTTAGGTGCTTACTTGGTTCAGTATTGTCGTGCAAATTATGTTGTTGAAAATG
TAATTCTTAGGCGTTTACTTGGTTCAGTATTGTCGTGCAAATTATGGTGATGGATGTGCG
ATTCTTAGGCGCTTACTTGGTTCAGTATTGTCATGCAAATTATGTTGATGAATGTGCAAT
TCTTAGGCTTTTACTTGGTTCAGTATTCTCGTGCAAATTATGTTGAGGAATGCACAATTC
TTAGGCTATTGCTTTGTTCAGTATTGTGTGGTTCAAATTATGTTGATGAATGTGCAATTC
TTAAGCTTTTACTTCGTTCAGTATTGTGGTAGAAATCATGTTGAGGACTGTGCATTTTGT
AAGGTTTTTTACTTTGGTTCGATATAAAATCATGTCTGAACCTGAACCATATAATCTGTG
GTGCTTAGCTCTTTTGTCGGTCCATCAATAAGTTAATTCAAGTCTATGCCTGAAAGGGGT
GTGAGTTGCCTGTGATCACTTTATATGTGCTTCATTTCTGTTCATACATGAAAATTCAGT
ACCAACTGTACGGCTGTAGGCTATTGATCAAAACTAAAGTTCACTAGTTTGATCATCTAA
TGTTGTTTGTTTGAAAATTGGTATTGTTCAAGCTTAATACTTATCCATCTTTTGTTTAGG
ACTGTTGATTTGTTTATTTTTATTTTCTTATTCCAGTTAGCATTGTACATTTAAGTACCA
TCTACTAAGATTTTTGGGATTTTCCTTTTGACATTTGAAGCTGTAACTGGTACTAGGTGT
GAACGAAGTACTTTGGATCTAACCCATTTCTATCAATTGTTGCAGATTGACCCGGCGAAA
TACAAGAGCATCACATCTGGATTTGGTGTTCTGTTAAAGGAGCAAGGAGCTAGGGGATTC
TTTAGGGGATGGGTGCCTACCTTGCTTGGTTACAGTGCTCAGGGGGCTTGCAAGTTTGGG
TTCTACGAGTTCTTTAAGAAGACCTACTCAGATATGGCTGGGCCTGAGAATGCCGTGAAG
TACAAGACCCTAATTTACCTTGCAGGGTCAGCTTCTGCCGAGGTAATTGCTGACATCGCT
CTGTGCCCCTTTGAAGCTGTCAAGGTCCGTGTGCAGACACAGCCTGGATTTGCCCGTGGC
TTGAGTGATGGGCTTCCCAAGTTCATCAAAGCCGAGGGTGCTGCTGGGTAAGTAAATCTC
CAGCCGCCTCAGAAACTTCATGATTTGCTTCTCTTATCCTTATCACATGTCCTCTAACTT
TATTGGTTAATAATGCCAGGCTTTACAAGGGCATCGTTCCGCTCTGGGGTCGCCAGATTC
CTTGTGAGTGTTTTCTCTTATCATTCTCTTAGTCTTTTAATTTGAACTGTCGCTATCATG
ATCGTTTCCTAAATTTGGCCTGCTTTGGAACCAAATGCTCTAAAGCTGGTCTCCTGTTTC
ATCTGATTGGCACTGTTTGTTTTCTTTGATATACCAATTGGTGATGTTTTGTTACTTCCT
CTTCTCCTGTATGAGCAAGCTTCTAACCTATAGTTGTGATGGAAGTTTGTAGCTGAAACT
CCAAAATTCACTTTTCTTGTAAAAAATAAATATGTTAGCCAGACATGGGATTACCGTATG
CCTGTATCTACTGAACTTGACAACTTTTGTCTATCGGAAATGGGTTATGGCAGAACATTT
TGTATCTAGATGTCTGTTGTATGTTTGGCAATTTTGTTTGGGTACTCTGTTCATAAATGA
CAATAGAAATTCCCATCAATCTCAGTTCCATACCTTATACCAGTTTTTACATGATGAATG
TTTTGTTTCCCCTCTCGTAAAATGTTATGTTTGGTTATGGTTCATCATGTTAACTGATGT
AGATCGTTAACTGATGTTAACAAGTCTGGAAGTTTATGCAGACTAATGTTAACTGATGCA
GATTGCAAGTATTTGCGACCAATTCTAGAATTGGCCATTGTTAATTGAATGACATAATAT
TTGAATTTTATTAGTTATAGCCTTCTAGGTAGCACATGTCATCTACTCCCTCCGTTCCTA
AATAAAGTCATACGTAGCAAAATGGATGAATCTACACTCTAAAGTATGTCTATATTCATC
CGTATGTAGTTTTTAGTGGAATCCCTAAAAAGTTTAAGAACGGAGAGAGTAGATAGAATT
GGAAAGTTGCTGAATGTACAGTGCTTTGAACTTCTGTTATTGCTCATATGTTACTTCCAT
GCTTTATTCAGATACCATGATGAAGTTTGCGTCCTTCGAAACTATTGTTGAGCTTATCTA
CAAACACGCTGTTCCTGTTCCGAAGGCCGAGTGCAGCAAGTCTTCCCAGTTGGGTATCAG
CTTTGCTGGTGGCTACATTGCCGGTGTTTTCTGTGCTATTGTTTCTCATCCGGCTGACAA
CCTTGTCTCGTTCCTCAACAATGCCAAGGGTGCTACAGTGGGCGATGTAAGCTTTGTTTC
TATCATTTTTTCATTGTCTTTGAGATCTTCTATCCTCTTTGTTGAACTACTGGACTATTT
GCTGACTTTATGCTGTTATTAAACCTTTGTAGGCTGTTAAGAAGATTGGCATGTTGGGCC
TTTTCACCAGAGGGCTCCCCCTTCGTATCGTCATGATTGGTACTCTTACTGGTGCTCAGT
GGGGAATCTATGATGCGTTTAAAGTTATGGTGGGACTGTAAGTATCTCATCCCCTATGCA
AATCCATCAGTATGTAATGGTAAACAGCTTCTGAGGAAGTACTAACAATTGGTTATCCAT
TTTCTTCCAGCCCGACCACCGGCGGTGCTCCACCAGTTGCTCCGGTAGAGGAATCAGCTT
GATTGATTTTTGCTGCTATGACGATGTATTCCTGGTTGTGGTTATTGGTGGATGGGACTG
TATCAATTACTTGTTTAGCACCCAAAATCTTTTGTTATTGTAGCAGATGGTTATTGTCTC
TATCAGATGAGAGGAACTCATTAAGCAGGCGAAATAGGCCTTTTTTTGCCCCCCGGGAAA
GTTTGATGCTTGACATAATAAGTTTTAGGACAGCAAGGCTGTTAGAGCGCAGGTTCTGCC
ATCACCTGTACTGAGGGATTCCCATATAATCTTGTTTACCTCCAATATTACGCTGTTTAT
ATCGTGGATGCTGGTTTCTGAATGGTTGGAAAGTTTACTTGTACACTACTACTCCCTCCG
TTCCTAAATATAAGACCTTTTAGAGATTGTACCATAAACTACATACGGATGTACATGAGG
GAGTAGTAGTTATCTTCATGCTGGCAAAAGTTTAATCTTCTAGATGAAGTCACGCACTTC
CAAATCAAAGTCACTTGCCTTTCTTATTGGCTGGTACTGTTTAACGAAGAAAGATGCAGT
GGGGGTAGATTTGTATTCTAATGTATGGGGCGTATGTTTGGGGAACTATTCCAAGGCCCT
GTTTGTATCCTGAGTTAGAGTATGTTAGATTGGATCAATCTAACCTTAAAACATCCAAAC
AGGGAGGGTTAGAGTTGGTAACCCATTTAAAAAAATTAACCCACCCAAGAGTGTTTATTT
GGGTTAGAGTTAAGTTGGGCCCACAAAAAGTTACTTTTTTCTCTATTTTCACCACACCAA
AGCCTTGATAAAGGAGCCAAATGATTGAAAAAGGTGTATTTATTGACAATCTAACCCTTC
CATCCGAACACTTTTTTGGTTAGTAGAGTTAGTTTAGGGGTTAGTCCAGGGTTAGAATCT
AACCTCTAACCGAGTTAGAGCACGATTGCAACTTGGAGCATGACAGCTGATTCTAAATTT
ATATTTGATATATTTACCTTTAAATAGGTAGGGTCGCCCCATCACAACTTTGAAGGTATT
CTTAACATCAGGTTATACTGCCAACATACTCTTCTTCCAGACATCACAAGCAATGCTAGA
AGTCTTGTTTGGAAGTATGATTATCTTTAGCCTTCAGGACGTGATTCATAGGATTTAAAA
GACACACGAATATAAAACCAAAATGTTAACGGTCAGACATCAGCTCAAATGGTATTTCTT
TTGGCCAATGTGTTGTGACTCGTTCAATTTTTTGAAATGGCACTTATCTGCATTCATTAG
GAAGAAAAAAATTGCTCAGTTCATTAGGAAAAACCAAACGAAAATCAGATTGTCCAATTA
ATTATGGAAAAACGGACGAAGACCGTTACAACCAATAAGTGGTACACATAAAAAAGCCTA
CGCACACCATTTCAAAGAGGGTCTCGATGAGACGGCACACAGGGATCATCGCCATTCCTA
CACTCTTAGCAAGCAACTTCGACTCCGTCATAGACGATCATCTATCCAACCCACAGTGTA
ACGGACACATGAAGCTACATGAAGATTTGTGACTCATTCAATTCATGTGTACCAATCTAA
AAGTAAGACAAGTGGCATCACCACTCGTCTGAACAAGTTGATGACACTGCATGGTTTGTT
CATGTTTGCGTGATGGCAAATTCTGTTTTTAGAACATACATTTTTCACTGGAAATTCTAT
TTTAGGTTGCAATTATTTATGTTGCATCATGGCAAGTCACTGAAAATGCATGTCAATTAC
TCTACTGCAGCATGAAAATTCCTGACAATCTTTCTGCTCTCATTGTAATTTTTCATTTAC
AACATGTACAATCTTTATACAATAGCATGCCAAATATGTTTGAGGGAACACTCCCAGATC
ACACCATTCAAACAGATGACTTCTCATAGGAAATGGTAGTTTGCTCAGGTGACATGACTG
TAGGAAACGTCAACGCAATATTAGGGTTTATAGAAAAAACTATATAAATATGATAGGGTC
ACATGTGCAAATCAGAAGATTATTGAAGCACATGAATATACATGACCGTGTATTTGAATA
TCCTCACGTACCCCTTCGTACGTGGCTCTCTGGAGACCAGACGCTAGGCTTCCATGCCTC
ACGTCGGCCCCGTCGCTGATCCCCCCTCCCCGGCCTTAGGGCCATGAAGGCACGGTGGAT
CATGGCCCTTGCCGACGGAGGGCTCCATTTCTAGTAGTCTTTTTAGTTTGATTAGGGTTT
GTGTCCTCATCAAGATGAGCCAGTGATGGTTCTCTGAAGATGGAAAAAAGTTCTTCTTGT
CTAGCCCAGGCTCGGAGGAGCATCTATAATTGTCGGAGGTCGTGTTGAGTTTTTCTCTAA
CGGATATCTCGAGATTCAATCGATGTTTGTGTCTATTGGATCTGGTCTTCGCTCGTCCGC
GATCATGTGTCTATATGTTGGATCCTTTCGATCTACGCTTTTTCCATCTACAACGGTTAC
TTTTCTGATGCGCTGGTTTTGTGGGGCCTTAACACGATGACTTATCGAATGTCTACTACA
GCAAGGTCCGTCCGGCTCCCGTGAGGAAGGGGCGATGACGACGGTACTCCTTCCGTTTGA
TGTAGTGTTTGTAGTAGCCGCTAAGTGGTCTGCGCACTTGGATGTAATTTTCGATGTTCT
TCGTACTGTCTTAGCAGTTGATGTATAGGTCGGAAGTTTCGTCAACAAAGAATTAAATAG
GAAAAAAGTAAGAAAGCCCACAGAAATGATCAGATTAAGGTTATATCAGATGCAAAGGTA
AAAAAGAGAAATGTAAAAAGAAAAAAGCAGGCCTGAGTGAATCGTAAATTTTCCCTGTTT
TCCCCTATGAAATTCAAACCAAATGATGCCAGTGCCTGACTGCCTCGGTGAACCATCGGA
CGAGAACCGAGCAATCCAGATTCTCATAACTCATTCATCTTGCTTATTACTCCCTCCGTT
CCAAAATATAAGACCTTTTAGATATTTCACTAAAAGACTATATACGAAACAAAATGAGTG
AATTTATACTCTAAAATATGTCTATGTACNNNNNNNNNTAGTTTATAGTACAATCTTTAA
AAGGTCTTATATTTAGGAATGGAGGGAGTATTTCACATGTTTCGCATCATTAAGCACGCT
ATTATGTCGACGTGTTTTGACCGTCACATGCTCTTATTTCATTTAATAAATCCACACATA
CGTATGATTTAGCAGCACGTTGTTCTGGTCGTTTTGCGCTCTTGCTTCCGCGGAGGAATC
AGAATCAAGTAGCTTGATCTGATCCCAAAAATTGGAATTGATGAGAAATGATGCCCTCGG
CAGATGAAGCTCCCCTGATGACACACCACACCCTACCCGCCAGTTCGTCCCTGGGTCGTC
CGGCACGGCCGAGCCACCGAACCTGCGCGCACGGTCCATCCCCTCCCTCCGCGAGATCAT
GGCTGGTCGTGGGCCGCCGCGAGAGGAGAGAGGTGGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTG
CGTGAATACGACGCCGCCCGCCAGAGCAACAGTAGGGGCGTCTGTTTCCATTTTTCTTTG
GCGGGGTTGGCTTCTGTTTTCGATTGCCTGGCTGTACGTAAGCGCGTAGGGCGATGCTGC
ATTTTTCGTTAAACAAAGCAAGCGAAGCTCTTGCGTTGCGTGCGTCGTAGGTGTCGCCGA
TCGGGAAATATAATGTATGTGTTGGCATGGCATGTGAGGGAGATCGGCCGGCCGCCCCTG
CCTCGCCTCCAACCGCCAATCGTTAAAGATCCATCTCATCAATCTCTCCCTTCCTCCCCC
GTTCCTAAATATAGGCAACTCCAACGGATCGACCAAACGAACAACAATTTTGTTTGTTTT
TTGGTTTGTTTGAATCGACCGCTTGCCCGGCGTCCGTCCTGTTTTACATATGGGTTGATA
GCGTGTTCAACGCGTCGACCCATATGTACCGACGTGGCCGGCTGGCTGTCCTATTTTGCA
TGATTTTCATAATTTGAATTAAATAACATAATTTAAACCGAAAATAGCATAGTTATTATA
AGCCGAATAAAAATAAAAATGTCTCATATAG