Map Locations of contig_38069 (8715 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_38069

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_53117 4 2168 bp MLOC_53117.1 Available Available LOC_Os05g24560.1, FRAME:-3, EVALUE:3e-147, 13105.m02511 protein NC domain-containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_53117






Contig Sequence (8715 bp)

>contig_38069 8715 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTACGTCTCAGTGCTCGGGAGCTTCTGTCGTGTGGAATGTGTGAGTTACAAAGGGTGCG
AACCCTTGTGCCAGAGGGAGGGGTGGCTTATATAGAGTACGCTGCCCCTCATGAATATCC
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CATCTAAGAATCTTATGTTGGATTTGTAGATCGGTGGGTCATTCAACAGCTGCATTTGTT
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GACATGCCAGCCTATTTGACGAGTTGAGATAAAGGAATTCAATACCTGGTGAACAGTATG
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GTAGCTCCAGCGAGCCTCCTGGCGTTGCCATTTTAGCAAGCTCCCCTTCCCCTGGTAGCT
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CGCTTGTCACAATTGCCAGACCACTAGCACTAGTTGTCAGGAAACGCAGCGGCGAAGAAG
CCACCGCACTGAATGCAGCCGTCAGGGATGCCAGCTGCCCACTGCGTCCAACGCTATAAG
CAGTCTCGACGAGCAGCTCCGTCTTGCAGTATATCGCGAAGTCTTCACAGTTGTTCTTAA
ACAGGCTATACATACCAAAGCCATTGTTGAGGAGGTGTTTGGCACGGTGGACAACAAGCT
GAGCAGCGTCAGAGGGTGCCATAGTGCACGTTCCTCCACGTGCTTTGGCGAGGAAGAAAG
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CATGTGTACAAGCAAACAAGTCAAGAGGGCATCACAAACAAGTATTGCAGTAAGGAGCGT
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AGGAAGATACCAATCTATACGATGCTTTCAAAGCCCACTAGTCTAACAACAGAAAAGGCT
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TCGCGGCAGCCAGACCTGAGTACTCGCCTCACTGGGATCCTTGATGCCACATCCAACATC
GCAGAGGAGATCCCACCCAAAACGTCTCTCACGCCAGACATAGCAGACGACCATGATTAC
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TGCTTCCAGTGGCGCTGGTGCTGCTGGCTTAAAGGAAAGGTGGCCAATCGTGCTGCGCTG
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AATAGTTGCAAGATCATGGTTATTGGGAACAGCTCTCCTCATCAGTCGACGAAAATCTTC
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AAGACATGTATTGTTGCAGGGCGTCTTCAAGGTGACCCCGGAGAACCAGGCGTGAGATTA
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GCGGCCGTTGCTCCCGCGACTCTCTTTCTCTCTCGGGTCGGGACTGCTCGTGTTTCCTTG
TCTAGCACATCACCTTTTCGTTCACTGTTAAGTATTTTTCCCAAAAATAATCAGGGCTAC
GCGTCGGATCGTCTCGAAGCTGTTAGATCCAGCGTTCAATATTGCCTTCATCATTGTAAC
AAGGGATGTGTTGCAGATTTTTTTTGCGACGAAGCTTGACGTGGCACAAAATATTTACAA
TTCGTTTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTGCAATATGAGTATGGTTGTGAAAGTTAATTTGCA
ACACACATGATGTTAGGGAATTTTAAATGAAAACATAAAGGACAAGCGCCGTGCGATCCG
TCACTCAAGGTAAGCTTTTTCAAAAACAATTTTGTTTTTTACTTTTACAAAGGTAATTTT
AGTTGTACAACATGACTTTGCTAAAATACATTTAATCATGAGTTTTACCTCAGTAAAAAG
GGTCTATGTGTTAAGGTTGTGTAATATTTAAACAATCTTGCAAGCCGTATGATTTTACCG
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CGCAACCCCGAGCGATAAAAGATATTCTCTTTTCCCGTTCGGGTTTGCGGCCTCTGTTAC
GCGCGTTGCCTATTTTGGTCCTTAAACCGTAATACCACACAAAACAATTGACCAGGATTT
TGATAAATAAAACACAAATTCCTTAATTTTAAACACAATTTTGACGACATTTGAACATAG
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ATTGCCTCTTCCAGCTAGCCTCTTCCTCTCCAAGATCTTCACCCTTGCTATGACATGTCA
TTCTTTGGTAAGCCCATCCATTGTTGGGTAACGTAGCATAAATTCAAAAAAATTCATACG
CATATTCAGATCTTC