Map Locations of contig_37962 (10642 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_37962

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_52988 2 2728 bp AK371168 Available Available None





CDS Structure of MLOC_52988






Contig Sequence (10642 bp)

>contig_37962 10642 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCTGACGCCTAGGCGACGCCTCGGGGACGCCTTAAAAACAATGGCTACCACTGAGCGTC
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TGTTCATAGTTTGTACCACCTGGAATTTATTCTACTGTCCAAGTAGAGCTCTTGGGCTTT
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TTTTTTTCTTCTATTTGGAGCTGAAGCTAGAATTAGGTAGACTGGCTGGATGCAAATCTA
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GCTTCTGTACATCCGGGCATACTCTTTCGACGTTCTTTTGGCATCACTGAATAAAATAAT
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AGCAGCTAGCAAGCAGCCAAGCATAGCATCCAGCAGCTTAATGGAAATCAGATCTGAATA
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GGGCTGATGATGTGTCAGAGGTATCCACAATGTATCATGCAAGTATTGAGAATTAAAAAA
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TGAGATAACAACTGGATGATGAGCTTTTGAACAAAAAAATTACGAACTTGGTCCATGGGT
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ACCTCCAGGATATTGATGCTGTGTCTGCACGTTTTCAGGCAAGTAGTTGTTTTTAGCATG
TAGTCTAAATATGTTCACGTGATGAGTGTTTTCTTCTGATCTTACAGAGGAGAGATGTTT
ATGGAGCTTGGGAACAATACCTTGGCTTGGAGCATACTGACACAACACCCAAAAGGTCAT
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GATATGTTTTTGAATTTTGTCGGTGAAACATGCATATTTAAACAAAATCGGATTTAGTAA
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TAAAAAACATGCATACGTGAGTAAATGGTTCTTGTGCTATGGCAATAAATGGTATTTTTT
AGTCTATTCCATTTTGCTATTTTCTCCCAAGTATTGTTGTATTTCGTGTTACACAAGCAT
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TGTGCCTGGTTCCAGTTTTTGGTATCCATTGAGAAGGTAGGCACTAGGCAGTAACTGCAG
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AGGCAAGACGGGTGGAGCTTATCTGCCCAGCACCCGGGCGACTGGTGGAGCTTATCTGCC
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GACGTCGACAACTTCTTCGACAATATGGCCAACGACGACGTCAACGCCAATCTCGTGTTC
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TGCTCATCATTTTAGATGCTACTTGCATAGTATAATCGCATGTCTCGTCTTATAATTACT
ATGGTGGTCATGATTTATCTTTATTTTTGCTAGTAAAATCACTTGGTAAATCGTTCATAT
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TGAGGCCTCTTATGTTCGAGGGTGTGCACTATAAGAGATGGCGTGTGAGGGCTGTTCTAT
GGTTTCAAACCATGAGCTACTATGACGTTACTTTTGGCAAACCTAAAGGAATTCTTGATC
CACAACAGGAAGTCGCTTTTCAGAAAATTGATACCTTGTTTAAGGCTGCTCTCTTGAGTA
TTCTTTGTGAGAACATCGTTGATGCTTATGCGTCAATTGACAATGGAAAAGATATGTAGA
GCGCGCTCAAGGCTAAGTTTGGAGTCACGGAACAATTCTATGATTACGGGATGACTGGTG
AGCATTCTGTGGTTGAACAAGCTCACGAGATAGAGTCATTTGCTAGAAAACCTGAGCACT
TCAATTGTATGTTATCGGAGAAGTTTGTTGCCGCAGGTATTATTACTAAGCTTCCTCCTT
CATGGAGGAACTTTGCTACCTCTCTAAAGCATAAGAGGCAGGAGTTTTTCATTTTGAATC
TCATTGGTACTCTTGATGTGGAAGAAAAGGCAAGAGCAAAAGACATACGTGCTCGATGCA
TGGAAGGAGGTTCTAGTGCCATTCTAGTGCACAAGAAAAACTTTCAGCCCCACAAGTTCA
ATAACAAGGGCAAGTTTGATGGTAAGGGAAAGTTTGATGGGAAGAAGAAGGCTTCGCAGC
ACACCAACTTCAAGAAGAAGACTGACAAAAAGAAAGGTGTTTGTCATGTCTGCGGAGATC
CTGATCATTGGACANNNAGTTGCCCTAACCGTTATGACAAGCGTCAACACGGGAAAGGCG
ACAAGATTGCTAATGTTATCATTGGTGACGCTGAGATGCAGGATGTTGGGTATGATATAC
TTCCCACTATTCTCTCAGTATGTCGTTCTCCTGATTGGTTGATTAATACGGGTGTTAATG
TGTGACAACCCGAGACCGACGCTCTAGAAGATTCCCCTCTTTTTTGTTGTCGCCGTGTTA
TTATTTGTTTGCTGCATGCATCATCGCATCATTCACATCATCTGCATTGCATCGGTACTC
GTTGCCGCCAGTTTTCAAAACT