Map Locations of contig_37836 (11067 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_37836

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_52837 1 468 bp AK252545.1 Available Available None
MLOC_52838 1 292 bp MLOC_52838.1 Available Available None
MLOC_52836 5 2798 bp MLOC_52836.1 Available Available LOC_Os11g18880.1, FRAME:+2, EVALUE:5e-174, 13111.m01904 protein UBX domain-containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_52837






CDS Structure of MLOC_52838






CDS Structure of MLOC_52836






Contig Sequence (11067 bp)

>contig_37836 11067 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGACGGAGGGAGTAATTCTTAAAATCAAGGAGATAGAAAATTCTTCCAAGCAACGACAA
ACATTTATACCACAAGCTGGAAACTTCCAACCATATAAATCGGCAAATATGGGGGCAAAA
AAGGGATCAACTTACCCAGGAGCCAATGGATGAGAATCCAATATGCAAATGCATACATCG
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CCACAAATAAACAGGTAACGGAAAAAACGGATGCTTGATGAATTCATCCAGTTATGGCCC
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AGAAAGGACTCGCGAGCGCGGTGGCGGCAGCAACCGACAAACGGGAAGGCGGAGGAAGGG
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CCACCCCCCGATCCCCCACGCGACCGTCCGCCGCGTCGTCGACGGCGGCGGCGCACGGAG
AGGTAGATATCACCGTTTGCTGCCCGGCCGTCCGCTCATTCTCGGCTGGAGGCTCCGGGC
CGTCGGGCCGGAGGTGGGAGCAGAGCACGGCGAGGCGCCTCGGCGGGGACATTTGGGAGT
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CAGCCTCATCCTCCTCTCCCCGTCTCCCGTAGCCTCATCGGGTTTGTCTAAAAAAAAGAA
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AGCCGCCTGCTCGTCGGCTACTCCGCCGCCCCGCTCCCCCCTCCCTCCGGATCCACCTTC
CCCTGTAAGTCTTACCCCAATTTCTCCGGTGACGGATTAGGCTCAGCTATCTTTGCAAAA
GCTTTCAGCGATCCGTTCTTGGTGGTAGGGCGTAGTTCGATTCCGATAGTCGACTAGATT
AACCGCGAAACTGCGACAACTGACATGCGATTCTGATGAGTTGTGATGTGCTTGACGCGC
CTACCTTCCGCGTGTAGTGTACAGGCACAGGGTCGGTCGTTGGAGTTCCACCCTGTCACC
GAGCGATCTTTCTACTAGCACCGTCTGACTATATATTTCTTGGTAAGAGCCGGTTGACCA
GTGTCAGTGTTTCACTGAATTCTTGAGCTGTCTTTCTGGTCCGGGTTTAGTTGCTGGCTC
TCTCTGTGCTTTGCCTCGATTAGATTACTGCACATATTTGACCTGGCTTGCGCATACTTT
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CATTCAACAAGGGTGGAAATGAACAGTTAGGAGGCATAGACAGCAGGGAACACAATTCAG
CCCTTTTTCTTGCCCCTTGTAATAAATCTAGCGATTTTGGCTCGTGTTTGGTTACTGGAA
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ACCAACTAGTGAATTGCCCTATGCAAAGTAACATAATTGTGGAAGATCTTATAGTTCCTA
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TTCCCTATCTCTAAGTGACAATTGGTAACGAAAATTTCCTTATTAATTAATGTGTCCAAC
TCTCATTTCTTAATCTGTTCTTGGCATTGTTCCAAATATCCCCCGATATGTCGATAAATC
GGCCAATTTGTCGCTTACCGGTGTGTGACCGTTAAGATAAATCGACCGATAAGTTGACCG
ATATGCCGATAAATCAGCCGTTACGCCGATAAATCGGGCGATTTACCCCTTATCGTAGGT
CGACCGATAAGTTCCCGATAAGCTATATCCCCAACATTGTTTCTTGGTGTTTAGACATGA
TCCCGTGTCCATGTCTTCATTCTCTTTCTTCTTCTCTAGCTGTAGATGGAAATCACAATT
AATTCCTTGACGTACAAGGGTTCGATTCCAGATGCAATTAATCAATCAAGAAGGGAGAAA
AAACTCTTTGTAATTTACATATCAGGTGAGTTTGTTGTTAGATTCAACATTTTGTAGCTA
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TGCATAAGGAAAATATACTATCCAATACAATCCTGTCTGGACTGATATTCTACTATGAGA
GTTTGTCCAGTCTATTGACAGCACATCTATTGTTTCATTTCAGGTCAAGATGAAACCTCA
AGTAATTTGGAACAGTCTACATTGGTTGATGAACATGTGGGTTCCCTTAAACTTCCTTCC
TTGTACAGAAGTTCATTTTCTATTTTGGTAGTTACATATTGAAGGGGCAAATTGCTTAAT
GCATCCACTTATGTTTGTATTCGCAGGTGGCTGCAGTGATAAGCAGATGTTGTGTGTTCT
TGCAACTAAAACAGGGCGATGTTGATACGCTTCAATTTTCAGCTATCTGTATCCTTGCAC
ACACATATTTGCTATGATACTGTGATGATGATTGCTCTGGATCAGTTGCTAGATTGACAG
CACGCTATTGATTTGAAGCTCTAGTATCAATTACTTGACAACGTTCATCTATAAGCCTTA
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TAGTGGTTTGATAGAAAAACATAAAATAATTTATCACAAACTGAAGTAGTTGTTCAAAAT
TTCCATGGCGACAACAGAGAAATGGTTTGCTGTCATAAATTTATGTTGGTATCATATTTT
GTATCACCACAAACAAAATTCGCGTAAAGACTAGTCCTTATGTGGGATGGATCTTCATGT
TGCCCTCTTGGGGCACCGTCCTTGTTTTGCCCAAAATGACTAAGCTTCAGTTACTCTGTA
TGATTCCGTAACTCAATCATTATATGCAGTCGGACTAACCCAGTGGTATTACCACACTTT
GGTGGCATAGGCCTTTGGCACTTTGTTAGTGAGGTTTGAAGAAATGAATCATCCATTTTT
TTGGGTCTCATATGATCTTCTAATTGATTACTGGACATATATCATACAATCCATGTATGG
TTGTCGAGATGTATCCATGTCAAATGATCCAAATCCAATGGAACCTTTCCTATCCCAATC
CTACATAGTATCTAATTTACGTTGATACATATGTTTTAGCTAGACTCATATGGTTTTGAG
ATCACAATTTTCTGTTTATGACCCTACCAACATCATACAGTAGCATGGATTTCGAGTCGC
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GAGTCACGACTGGTCGCAACTGCAGGCTCGACTTTTTCCGAGTCGCTACCCCAAAGCGAC
TCGGATGAGTCGCGACTCGAAAACCATGTACAGTAGTACAATCCCATGATGCTGGTGTTG
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TTGTTTATTTACTGCTATAGTTATAATGTCGGTGCTATACATCTATATACCTGTCTTCGT
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ATAATGCATCTCATCTTAACAACCATGGAACGGGTCCTGCAACTAATGAAGAATCTGTTT
GTTTATTCATGTCTATAATCACAATGTTCTAATTTGTTTGTGCAGTTTCATCCTTGACTT
TTTGTCAATCAGATCCACAGAAGTCTGTCCCAAGTATATCTGTCATCGGACTGAATGGTG
CTATGCTATGGAATCATGGTACGAATACAACTATGCTTCCAGTTTTCTTTGTGGAAACTA
TCTTTTGTTAAGTGACAGTTTGGACCAGTGCTTAATTGGCTCTTTTGGCAGAGGGGTATA
TTAGCCCAGAAGATCTTAAGGAAAGCATTGAGAAAGCTTGGGCTGCCCTTCATCTGCAGG
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TGTTTTGAGTTGCATTCATTTCTATATTTGCATTTTCTTATCACTTTGTGTAGCAGAGTT
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AGTTATAATTGCAACTATATGATATAAGCAAATTACTTACTCCCTCCATCTACTAATACA
AGACCACTTCATATTTTTATGTCTAGCTTTGACCATAAAATGTGAGTCATATGTCATAAA
AAGTATGCCATTGGAGGCACATTTGAAAGAACTTTTCAATAATCTATTTTTTATGAATTA
TGTCCCATATTTTGTTGACCAAAATTACAAGTCCAAGCTTGACACGAAAAACGAAGTGGC
CTTGTATATAAAAATGAAGGAAGTACTTGAAGAACTATAGTTGGTATTGTCCTGTGTCAA
ATCTTGGGCTATCGATTCAAAGACCAGGTTACAAGATTATTACTAGAAGTTGCAACAAAT
TGATCGTATGTAACCTAGAAATGCATTTGTACTGAAGTGTTCTGACACATTGCATGATAT
GGGGGCTGTAGTAGGCTCGTACGGGCCATAGCAAACTCTTAAATGTGCTAAAGCTGCACA
AAGGGATAAGCTGCTGTATAGCATAATGCGCTATATAAACACTATTTGGTACCAACAGAT
AGAACTATATTGGTGAGGGTATAAATAGCTGCCTCTTCTTGTCTCTTTTGTTTTGGTCAA
ATAATTGTCGAGTTCGTAAGTTTAATTAAATGCTGCCACATGCCAAATGATATGACTTTA
TAATCATATCACTACATGTAAAAATGGGTGGTACAAATCTGGAGTGTTATTAATGTTCAT
GTGCATGTTTCAGAGAAAGTATATAAATCAATGTAAGAAAATAGGCAACTCTTTTATTAA
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AGTGATAAAGTGTCAAAGTATATTCTTGTGTTGTTTTATTTTTTTTACATATGTACTGTT
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TAAGAGTGGTTTTCCTCCATAGGAAATCTTGTAATTTTGTTAGCTGTTACTGTATGATCC
GTGTTGGGTTATTCTTCACACTTTCGCACTAGTGCTATAGATTTGCTAAATACGAGCTAC
TTTTGTTCCTTCTAGGAGACAGCGGCCACCCTGTTAACTGCATCACTTGCTTCAAGAATG
GCTGAACCTGCAAATACTGCTTCTTCAACCATGCCTGCTCAAGAAGGTTCATCTACTTCA
GAAAATCATTCCAATTCATCAGGTCAATCCTCAGAATCTTCTGCAGTCCGTGGATTTGCT
AATTCTACTAATTTGGTAGCACAACCACCTAGTAGCACAAGCCAAGCTGTAAGTTTTTCT
CTCCATAATCTGTTACCTTTCAGTTGAATGAAAGTTCTGTTTGGTGTAGTGCATGAGAAA
GAGAAGGAATGACTCACCGCTTGCATATGCACCAGGAACTTCTCAAGACAAGTGAAATCC
CCAAATCAGATTCAGCTTCATGCAACATAGCTGTTGAGGAAAAGCTAGATTCAGCATGCC
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AGACAGTTAGTACGCCCAAACCAAAAAGTAAGAATAAAGTTGATGGGAGTAGCACTAAAG
ATCCTTCCAAGCCAGCTTCTAGCATACCAACTAGGAGTACTCAACAGTTGCCTGTGGAAC
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ATATTCAGCTGGCCATTCGTATGCCTGATGGACCTAGCCTGCAGATTAAACTGACAAAAG
AAGATGTTTTAAGGAAGGTGAAGACTTTTGTGGATGAAAACCAAGGTAGTGGGATTGGAT
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CACCTTGCACCTATGGACATATTTATAATATAAAGCTTTGTTTTATCCTGCATCTTGACC
AGAGACCAATCCCATTCAGTTCTCTACTTCAAGGGACTTACACACAGTCTTCAGTTTTTG
CATGGACGAGGCCTTGTTCTTTATTATTAGTCGTTAGTTAGCTGCAAATGAGTAATAATT
TGCCTCCTGGATTGAAATCTATGATAAGTTTCTTTATACTTAAAAAGTGTGCTTGCATGT
TGCACAAAACGTGCTTCCTACATCCTACTACCAGTGGGGGAAATGATTTGTAGTGTGTCT
TTGCATTTTCTTTGAAATGATGATAAATGCTGTGTCTCGTTGATAGCTATGTGTAAATAC
CCAACAAAGAGAGTAAATAAACTAGTACAGAGAGAAGCTAGCATTAAATTCACAAGGCAC
ACTTCATAATAGGAAGAAAAATTGAAATGCTCGCATGCTTCATAAAGGGACATTTACATT
TGTGCCCTTAACTCGAACCCACTACTCAGATTTATCCCTAATTTTGAAGGGTGCTCAAAT
TTACCCCTTTGCCGTTAGTTCCCCTTATAGAAATGCCCTTTTGTGCCGTTACCGTCCAGT
CAAAGGGCTTTGACCGTTTATTAGACGTTTTCTGGACATTGTTGCCCCTGCCTAATTATC
TCGCTGACATACGGCACCCACTGAAAAATTTGAAGGAAAAAACTCTTTCTCTCACCCCTT
CTCTCTCAGTCACTTACATGTGAGCCCAACCAAAATAATAAAAATAAAAAACTTTCCCCC
TCATAACATCTCTCTCCCTGACATGTGGGCCATGGGACCCACTGTCAGGGTTAACAATGG
TCCACGCATGGCTGGCCATGAGCGGCTGCGCTCACCGGCCGCTGCGTTCGCTGGCGGCTT
GCTGTAGGGAGCCGGAATACAACGAGAGGAGGGGGGAGGCACGCGGTGTAGCTGCGCGAG
AGGTGCCAGATACGCTGGGCACAACAGGGTAGGCGGGCGCGCGCACGGCCTATCTAGCCG
AGGTCGGTCATGGTGACCGGCTTTGGGCCGGGGGCACTGGGCATGGTATAGGGCGGGGGA
AAATGGGAGTGGAGCTACGCGCACGTGGGGAAGGATGTGATGGTCGCGACCATGTCGGCA
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TCGAGGTGGCACATGCTGGAGGATTCGTGGAACGATGGGGAGAACGGCAGAAGCTTCGGG
ATGACTCCCCGGATCTGAAGAAATAGACTAGAGTCCTGTGCCCGCAAGGAGAGGAAATCA
GGGCGCGGTGGTGCAGTGTCAGAGGCGAGGAAGACGAGAAGGGCGCGGCTAATTTGGGGA
GTTTTCCGACAATTAATTCTACAGGAAAACTAATAGAGCAGAAGCAAAGCTAATGGGCAA
GCCTTTGAGGCGCAGGGTTGCATTGGCCACAAAAACGACGGAGGTGGCGGTTGCCGGAGT
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TCATGAGGTCATCCCGGAGCTAAGAGAACGGAAGGGGAACCGGAACTCATCAGTGCAGGT
CCAATCGGGTGCGACGGTCGGCGGTCAGAGTTGGAGAAGATGGCCACAACACGTCTGGTT
GAGGACGAAACATCCTTCTAAATTAGGTGAAGAGCCTCGGCGGTGAGATAGTTGTCAGAG
TATTTTGACTGGATGGAAACAACACGGAAGGGCATTTTTATAAAGGTTCGTAACGATGGC
AGAGGCGCAAATTTGAGCATGCTTCGAAATTAGGAGCAAATCTGAGTAGTGGGTTCGAGT
TAGGGGCACAGATGTAAAATGTCCCCTTTATAAATGGTACGGAGTTGGTAAGACTTAAGA
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GACGTGCAGCGCAAATTTTGCTGTGGCTTGGAGGATTTTGCTCCTCCAGTTATAAGCCCA
CACACAATCTTCTCACCAGTTGCCATATATTTGATGTCTTTGCGTCATATCTGTGCATGC
AAATGGCCTCAGAGAAATCCGCGTGATATCTGCTATCCACTCCCCGCATGCAGCCCACCT
GTATCTCGCATCAAGCCCACGTGCTGCATGGCACATGCAAGCGTACACAGGCCAATGTGA
AGCAGCCTTGATGTAGTCCATTCGCGCTGGCGTGTAGCCATGAGTCACTCCTAACTCTTC
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TTTCTGTTGTTTAATCTACCATGGCTAATTTCAATCGTAACCACTGATAAACTGGGATGA
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AAGAGGAAGAACCTCGCTGTGGAAGAGAAAAGACGGAGAAGGCGAAGGGATAGGAAAGGC
AAGGAGTTATTGTGGTATGGAAAAGGAAAGAAAAAGGATATGTCACAGTCGAAGGAGTTA
CTGTGGTATGGAAAAGGAAAAAAAATCATGTCTTGCTTATAGGAGCATAGTGATTCTTGG
TGAAAATATACTATCACCATTTGCATGTGAAATATCTAAATATTTTGTACATCATTTTGA
AGATCTACGCGAGTGTCTTTTTGGCTTAAATTATACACCACAGGTTGGCTTGAAGTTTTG
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GTATGAATGATAGTATGAATTATGGATTTTATTTGGTCCATAAGATGTCCTTGTATGCTT
GAACTATTTCTTGCTGTTAGTTCATATAAGTAATCTTTTCATAGACTTCAAAATAAAATT
CTGCATGTGAATGCCCCTCTTGAGGTTAATTTAACTTCCTGGGCATTTGACTGTAATGAT
GTAAACTTGAATAAGGTGTTTCGGGTATGGTCCCATTGTGTTTTACTTGTGTGGTGAGAT
TGCATCACACTTTTGTTTTCAAACATCCATATTGTGATTTTATACAAGACTTTCTATTTG
GAAGCTCATTACTTCATTGTACTAACTTTGCATCATACTGTTGAATTGTTGGATCTAACT
GATCGTCAAATTCTTGTTCAGATATGGAAACCACATTGTATGAGCTGGGTATTGAAACCC
GCCAGGCCCTTGTCGTCGTTCCGTCTGTTAAAGTGGCAAGGCACCAATCGTCATTGCCAT
CCAGCGATCTGGATCGTACTGGGAATTCAGACAAGTCGGGTGGTTGGGGTTTTCTGGGGG
CAGCGTTATCATATGTGAATCCATTGTCCTACTTGAGAGGAAATCCCACCCCATCAAATC
TTGATCAACTGGGAAATGAGGGCTCGCAGCAGTACAGTATGTTTTCTTATTTAGATTCTT
CTGCTGATATTTCCTTGTTGGTCTGTTATTTTGAGTGATCGTGATTGCAGAGTAGTGTTT
TTGAAAAGACACACTTCTGATCTGTGAAATTATGTTTACTTCTCTGGCAGAACCAAGCTC
TGAATCCCAACCTCTTCGTGGTGATGGAAGTCAACAACCAGCTACTCATAGCTCTGGAAA
TACCTTGAGAAGGCGGCCCCGACAGTTCGGTGGCAACATTCACACTCTAAACAGTGAAGA
ACAAGATCCATCTGATAATAGAAACGTCTTCTGGAATGGGAATTCTACAGAGTTTGGAGG
CGATGAAAAGAAATAGGGGGTGACGGGACTGTTGGAGTTAAATATGTTGGGAAATAAATA
TGTTGGGAACAACTGAGGTGTTGAACAACAGTGTTTATACATATGCTGGGAACAAACCGA
GGTGTTAAATTATAGCCCTTATACATAAGTATTAATATGGCATGTGCAATCCTAGAAATT
ACTTTGTTCACCCCAGGAATGACCTTTTTCACACATATGAATGAGGGTAATTTTTCTTTC
CACGTGAGCGTATATAATTTGATGTAGTATCTCATCCTTGGAGTACAACCTTTAAGAGCT
TTTACTAGTTATTTCTTTGTAGATTATTATGGCTGTAAATTTTCATATATTTAGGCCTCT
TTTGGTTCAAAAGAATAGTGGAGCAAACACATAGGAAAATAGAGGAGATTTTTCTTGGTT
TCAGTTTCAGAGGAAAAATGCAGGAATTTTACAATTCACTTGGACCTCTTTACTAATTTC
CTACACACGGGATTAAGATCATTAGTGGCATATAATGACATGCTAATAATACCTTTCCAT
GTGGTTTTATTTTGAATTTCTCAAGAACTCATGGTTTTATTATGATTTGACTATTGTAGT
AATGGGAGGGAGAGAGGAGTACCTCCA