Map Locations of contig_37832 (3650 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_37832

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_52831 2 1229 bp AK358112 Available Available None





CDS Structure of MLOC_52831






Contig Sequence (3650 bp)

>contig_37832 3650 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACGGCAAGGAGGTCTGGGTCTTCGACATCGACGAGACCACCCTCTCCAACCTCCCCTAC
TACGCCAAGCACGGCTTCGGGTACGTACTAAGTACTCGACTTGTATATACATACACATTA
TGCTATGCATGCTTGACTAATTATTGCAGGTGCGTTTGAGCAGGGACTACTTGCACTAAT
CTTTCGTCCACACAAAGTAACTGATCAAGTGCAAATCTGACTAGACCTGGTTGCTAAAAT
GAGCTCACCGACCCGGCCAGCTAAAAAGAAGCACCAGCTAAAAAGCATAGTAACACATTG
AAACCATAAAGACAAATCTCTATCTAATAATTAATAAATGGGAGAAAACTAATGAAACTA
CAAGTGCAAACAGAAAGGCATATATATGTTGGGCATCATATGCGAAACATTTCTTGGCAC
TGGAGTCTGGTCGAAGCTATTCCTTTGCGAAGCTTTTCACACGTGTGTAATACCTAATCA
TGTTTGATCCCGAAAAGTTTCAGATTATTTTTTACTCTTTTTGAATTTTCTAAAAAAATA
ATCAATTCGGGTGCAATGGGACCTGAGACCCATTGGCTATTTCTGCAAAATGCTTCTATC
TTCTTGATGTGACACTATAAATTAATAAAAACATCTTTTGTTGAGAGAGAAAAAGCATGT
GAAAACTAGCTGCCATGGTTGAGTCTGTCATTAATCTATCTGCATATGCACACACGCGCG
CGCAGGGCTACACCGTTCAACTCAACAAGCTTCAGGGCGTACGCACGGGAGGGAAGCGCG
CCGGCGCTCCCGGAGACGAAGCGGCTGTACAACAAGCTTCTCTCGGTCGGCATCAAGCCG
GTGATCCTCACCGGACGGAGGGAGAACCTGAGGGCCTCCACCACCACCAACCTCCGCAGC
CAAGGCTACTCCAGGTGGATGAAACTGCTTCTGAAGCAGCAAGACTTCAGGGGTTCCTCA
GTGACCTTCAAGTCCGGCGAGAGGCAGAAGCTGCAGGATGCCGGTTACATCATTGTGGGC
AACATCGGTGACCAGTGGAGCGACATCCTTGGTGCTCCCGAGGGCGCCCGCACCTTTAAG
CTTCCCGACCCCATGTACTACATCGGCTAGTTTCATCGCTCGTCATCCATGAATAAGCTC
CATGCTCTTTAATAATTGTATGCATGCTTTGTCTGTAATCCTTCCCCTGTTGTTGCTTGG
TCATTTTCCTTTGTTGAGAACTTGAGATCAATTACTTGTATTAATAAATGTGTCCCACGG
AAGGTGCATGTTGTTTAATCAATGGATCCCTCGTCCACAGTTTTTCTTTTTCTCCTTATT
ATTGCGAGAAATCCATATAGGCTACGGTTGTTTGATGTATTGTTCATCTTAACTTGGATC
ATATTTATATGTACTATCGGTTTTTTGAGTGAAAATTCATGTGTAGCGTACGATGTAACT
AATATTACAGATAAATATAGTGTCATTATTGTGAAACGGCCCTTTGATTAACCCCTGTAC
TGACGGGCACATTCGCCCGTTGGTAGAGGGGTCGCTCCTGACAGACATCAGATGTCTGTC
GTTAGATAGGCCACCAGGCCTACGAACCCATGCAGATAATGGGTTGTTTCCACTAACGGG
CTGCACTTAAACGCCCTTGAGCAGAGATGGGCGCTCGGCATACTTGCAACCCCATTAGAA
AAGCCCCACTGGGGGAGCTCCTATTTGGGACTGTAGGCGCCCGTTTGGAATATGTTCTAG
AACTAAAATAATTATGGATTTATTAAGAAATTTTCGTGGATTTAAAAAGTTCACAAAACC
CGCAAAAGAAAGCTAAGAAAAAAGGTCAATGAATTTAAAAAACATATCATCAAATTTTAA
AAAATTTCATTGAATTTCCAAAAAGTTCATTGAAATAAAAAAGTTCACAACTCTTTAAAA
ATTTCATTAATTTTAAAGAAAGGTTCATCAATTTTCAGTAAAACAATATAAATTTAAAAA
ATGTTCATCGGAATTTGAAAAAAAATCAGTGAACTGAAAAACATATTCACAAATCTTTAA
AAACTTCATATATTTCTTTAAAAAGTTTAATCAATTTGAAAAATGTTCATTAATTTTTGT
AAAAAGTTTATTGTTATTCAAAAAAGTTCATAGAATTTTCAAAAAAAAGTTTGTCAAGCG
GCGTCTAGATGGGCTGGCCCATTTATAAACATTGCAGGCGCCAGTTAACAAAATGCAGGT
TAACTGGTGCCGGCAGCGTCAGATAGGAAATGCCCACCGCTGGAGCTTCTTTGTGGCTAA
TAAAAAAAACTTCAATTTGTTTCATACCATAAGAAACAATTTTCTTACAATATGAAACGC
ACACACCATGTTTTTCTTACCAAAGGGCAAGTTATTAGGAATTATATGGAGTGCAGCGTT
TTGGAGGAAGAGCTATATGGAGATCTTTATTTGAAAAATTCAAAAAACATATTATTAAGC
TTCAAAAATTCTGGAACAAATCATACATGTGCATATGGACGTGTTTTACATGTGTGTAAA
GTCTGACAATAAAATACATTATGGCTTAGGCTGCACAAAAAAGACAAATTCGTGCATTTT
TATAGTGAACAATGCATGTACTGTTTGTCATTTGAAAATCACGATTTTGTCTTTTTTGTG
TATGTCTCTCCATAAGGTATATCATTTTCAAATTTTACACACATTTATTACACATTTCAT
GAATGCATATGAATTTTTTAGATTTTTTTGAAACTTTAAAAGCGATTTTCAATTTTTCGA
ATTAAAGAGATCCATGGAGCTCGGCGTCCATTTAGCATTTTTGGGGTTATGGTGTTACAG
AAGCGGAAAATATAATATATCTTGTGAAAGAGACAATGAAGTAGGTTAATTTAATGCTAG
AGAGTGACATGTGGGACCAACAATTATTTTACTAATTATTGCTCACTAGAATACCACATC
AACATTGACTTGTCAAATGAGTGGAAGGGGTAATTGAACATGCTTTGCGTTCGATAGTTG
GAGGGTATAGTTTAACATGTTTCATAGTTTGGGATTGTACGTAGATTAAACTAGCCTTAG
ACTTTAGGATTGAAATATGCACTTTTTTTTAAACCATGAACTAATTTGTTTAATTTAGAA
TATAATTAAATTTTAGGAAAAATATTTTGAAATATATGAAAGGGAAAAGTGACAAAAAAC
TGGCTATTAGGTTGCCACATTGTGGGTCATCATAGGCGAGCTACAGGAGGAGCGCCCGCC
ATCGAACATGCGTTAATAGAGAGGCAACCAAGGCATAAGATCTCATATAGGAGACCTCCT
CCCCAACGCCTGTAGTGCTAATCAGTGCCCTAGCGCTCGCGTGTAAGCCTATTAATGACC
CACAAGTATAGATGATTAATCGTAGTTCTTTCAATAATTAAGAGTGTTGAATCCAACGAG
GAGCAGAAGGAAATGACAAGTATTTTTCACCAAGGAATTTTGGGCAAGTCATGTAACTAA
TAGTGATAAATAGTTTTATAACAAGATAATTCATAATAAGTGACAAGTAACAATTGTAGC
AAAGGTGCAGCGAGGTAGCAAAATCCTTTTTATAGCAAAGGACGGGCCTGAAAGTTCTCT
TATATAAAGCAAGCGCTCCCGAGAACACATGTGAATTTCTGTCTAGTCAT