| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
 |
 |
Predicted Genes from contig_37721
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_52697 |
3 |
2266 bp |
AK354074 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_52697
Contig Sequence (5188 bp)
>contig_37721 5188 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCGTCGCGACGGCGACGCACGAAGCCGCCGCGCCGTCACCGCCGAGGGAGAAGCCACA
CGCGGTCCTAGCAACCACGAAGCAAACTGCGTGAACCGCATACAGGAGAAGGGATAGGGG
TGGAGGAAGCCGACAAGTTACAGCAACCAGCTAGCAAAGGGGTAGGTGACGAAGCGGGGA
GGCGGTCCAATTGGCAGACCTGACGGCCGCCGACCACTTGGGCGGCGGGATCCCCCTACC
GCAGCTGAGGAATTCGTGGCCCCCTCCGATCCTAGCCTGATCTGCCCATGGTACTGTTCC
GGATCGTATACTTGTTTGGACTAATTTTGCTTTCCTAGTTAGTACTATTAGCTTAGGTGC
CGTGCGCTTTGCTTCAAGTGCCTGCGGATCGAATCATATTTTGCTAGGGTTCCAAGTTTT
GGATTGGTCCCAAAGCGTTGGATGAGTTCTGGAGGATTCGGGCATCCAAATTGATAGGTT
TACTAGCCTCGTGTTTTTCCCTTTTTTTTTGGTAACATGATGTGCCATTGCCCACAGAAG
ACTTACAAGTATTGAGCTTACCTTGGCCCTATTTTTAGTCTTTGTTAACTTGCTTAGTGA
GCCACTTCCAAGGAGCTTGTGTTCACGAAAATCTGTGATAGCTGGTATTCTTAGGTGGTG
AATTATTTGTACTGCAGTCAGGGCGTTGCTATTCTTAGTTCACTTCATAGCCAAAAGGCC
ATTTCCCACCAACGACACATATGACATCAGTTATTACCCTAGCTGTCATTTGCAGCAAAG
TTTCTTCAGCAGATGTGATGGATGTGGAATAAAATACCCCCACCTCTCTGTTGATACATT
AGTGCGAAACAAGTTCTAATATTTTACCTTATATATGGCACTTCTCTATGTGTGCAATTG
ATGTTGTTGCTAGAAATGGAGCCATAATTTTCGTATGTCAATGCGCATTTTTGGGGTTAT
GTGTTTTTAGGTTCTATTGTCTCCGTAAAATGGACGATCGAGCTTTGAACTGATATGCGT
TAGCAAAGCTCTAACTAAAGTTGTTTAGGAATTCCTACATTTGAAGTGTCTCAACCAACC
GATGTGTGTTTGTATTTGTTTTACATGTAGTACCCTTGATATCAAAATATAGTTAGTCTG
CATAGTTAGAACCTGTCCCCAACGAAATAACCTGTTGAAGCACCTTTCCATAGCAGCTAT
GCTTTTAGGTAAAATGTTCGGTGCATGAAACTCAATATTGAGGTACTGAGTTCGAGGTCC
CGCTGGCACAGTTGTATGAGAAAATAGCAGGGTTCCAGTTTGAGTCCATGTTAGAACCAT
GATTTTTAGGGAAATATAATTGTATGCTCAGTTCTGATGACTACATTAATTTGGAGGAGC
CTAGACACTAGGGAGAGGGCTTAAGTATGTATATATTGCTCACTTTGCCTTAACAGCTTA
AGCTTTTTAGTGTACTGGTTGGTGCATGAATCTAATATTTAGCTAAATCCCCCCCACCAC
CCCCCGTGCGTGCGCCCGGAACTAGCGGGTAGTAGAACATATGATTTTCTTATCCATACT
CTCACTAAAGATGTATGTCAATTCAACAACATAGGTCACAATTCACTGTCATGATTGCGT
AAGGCAGAGTAGATTACCCATTAAATCTTCAGGTTACTCATAGTTCTGCTATGCCTTGAC
ATCTCTCTGATTACTGTATCATTTCTTTTTGCAGGGAACTCCAGCTAACATCATTGTTGG
TTCTCATGTTTGGGTGGAGGATCCAAATCTTGCATGGATAGATGGCGAGGTTGTCAGCAT
AAAAAACAATGAAGTTCATGTGCAGACATCAAATGGGAAAAAGGTAATCTTTTCAATTTC
TTGTGCATTCTGTACATCGTTATCTTGTTATGATTACAAGTTCATATTATGTAGATATTG
TTTTCTTAGTATATTCTTCTTAACCGCCCTGAATGGTATTAATTATCCTGCTCTATTTCA
ATCTAGAAAAGGGGTATTAGGCTGCAAAAGGAACTTCATGGCGCTGTTCACTATTTTACA
TATGCTATGGCTAGAGCTTTAGGTTTGATCTTTTTGACAGAAAGTGGATTGTGAAACATG
TTGCAATGCTTTTGCACAGGTTACTACAGACAGATCAAAAGTGTTCCCCAAGGATATGGA
AGCTCCACCAGGAGGAGTGGATGATATGACAAGATTATCATACTTACACGAGCCTGGTGT
TCTACAGAATCTTGCTACGCGTTATGAACTGAATGAAATATATGTGAGTTCATTATCTTT
TGAGTAAATGTTGTGCATTTCATCAATTGCATAACTTGCAATGCAAATGATAACCATTCC
TTTGCATTCACAGACTTACACTGGTAGCATTTTGATTGCGGTAAATCCGTTTCAAAGATT
ACCACATCTTTATGATACCCACATGATGGAGCAATACAAGGGTGCAGATTTTGGGGAGCT
GAGTCCTCACGTCTTTGCAATTGCTGACGTTGCTTATAGGTGAATTCCTGCTGTATAATA
TTCATATAGATGACCATTCATGGTCCAGTATCAGTACCCCTACATTACCCTTATGTGATT
TATTAATGTGGGAAACCAGGGAAATGATAAATGAAGGAAAAAACAACTCTATATTAGTTA
GTGGTGAAAGTGGTGCTGGCAAGACTGAAACAACAAAGATGCTTATGAGATATCTAGCAC
ACTTAGGTGGGCGATCTGGAGTAGAAGGGCGAACTGTAGAGCAACAAGTTCTAGAGGCAA
GGGCGTTCACCTCTTCTCCTTCTTTGCTTACAAATTGTAGCTTTCAAATGGAAAACATAT
GCATTGGTTGATTGCTTTATATCCAATAATATTTCAGTCAAATCCAGTTCTTGAAGCTTT
TGGTAATGCAAAAACTGTGAGGAATAATAACTCGAGGTAATGGTTTGCTTGATTCTTTTT
CCTTTTTCTTTTCCTTCAGTAGATTTGTTTCTTCCCTTTATTTAAATATCACTAGCTGAT
TGTTTGTCATTCTCATTTGTCTGTAATTCACGGTGAAGTCGCTTTGGCAAGTTTGTGGAG
ATCCAATTCGACAAGACTGGACGAATCTCGGGAGCTGCTATAAGAACTTACTTGCTGGAG
AGATCTCGCGTATGCCAAATAAATACTCCGGAAAGAAATTACCATTGCTTCTATTTTCTT
TGTGCTGCACCACCTGAGGTAGGTTTTCACATTGACTCACTGCTGCTATCTGATTATTTG
CCTTCTGGATATGGAATTTAATGTAGTCCAAAAGGTCCACTTCTTAATATAGATTTCTGT
AATTTGCAGGATACTCAAAGGTATAAGTTGGCTGATGCTAGATCTTTTCACTACCTCAAT
CAGTCAAGCTGTATTGAGGTCGAAGGAATTAATGACGCGGAAGAGTATTTAGCAACACGG
AGGGCCATGGACATAGTTGGAATCAATGAGGAAGAACAGGTCTGTTTCGTGTAATACTGA
AGCTATTAAGATACTTGTTTCAGGAATAAAGACCAACACCATTGTTAATTTATTTTACAG
GAAGCTATATTCCGGGTTGTAGCAGCTGTACTTCATATTGGAAATATAAATTTTGCCAAG
GGAAAAGAAGTTGATTCATCTGTGATTCAGGATGATAACTCGAGGTTTCACCTCAATACT
GCAGCAGAGCTATTGGAGTGAGTGAATTATCTCCCTTTAAAGAATGTTTTGCACCTTCTA
TTTTCTATATGTTCATTGTGACCATAAACCAAAATGCTGACTGCTAAGTTTCTTGCAGGT
GCAATTGCAATAATTTGGAGAAGGCACTGATAACACGAGAAATCGTCACTCCTGAAGAAA
TTATTACTAGAACACTTGATCCTGAGTCGGCACTTGCTAGCAGAGATGCATTAGCCAAAA
CAATATACTCCCGATTGTTTGATTGGTAATGATCCTCTGGCAGAAAACTCTAATTAGATT
TTTTTTAAACTTCTGAATCTTGACATTTTTCATTTTAACCGTGATCCTGTATGCACAGGA
TCGTGGAAAAAATTAATGTCTCCATTGGACAGGACCCAAACTCTAAACAACTGATTGGTG
TTCTTGATATCTATGGATTTGAGAGTTTCAAAATTAACAGGTTAGTGTTTTCCACTTTTT
TGAACTTTATGAACGATCCAATTCACAGAATGTGCTAAAACAAATGGTCCTCTGAACAGT
TTTGAACAGTTATGCATCAATTATACAAATGAAAAGCTGCAGCAACATTTTAATCAGGTA
CTTCATGAATTTCGACCATAGTTTTTACTCTATAGATATTTCTTGTCCATGATTTAATAT
GTGATGTTGTCTTGCAGCATGTGTTCAAAATGGAGCAAGAGGAATATACTAGGGAGGAGA
TAAACTGGAGTTACATAGAGTTTGTTGATAATCAAGATGTGCTAGACTTGATTGAGAAGG
TGCGTATTTCTTCATATTTTCCGTATTATGACAGGTCACACAAAATGCAAGGTAGTTATG
ATGTGACTTAGAAAGTCAAATAGAGACAGAAAGTTGAACTGTCTTGCTTATTTATGTTTT
CCCCTGTTAAGTTGGTGGATGCAGTGTCAATTAAAGAAAGGATAAAATTCTTCAAAAGCC
CTTCACATTCTGTAATTGTGGTTTGAGAGGTGATGGTTTGTTCTTAGGAGAATTGTTTCT
GATCCTGTCATTATCGGTTTATCACTGTAAATAATGAGAAGTCCTAATTTATGTGCGTAC
GGTAAATGACCAGCAGATAGCACTTGACGTTTTGCTTCTGCTTTGTGTGTCTTTTCACAA
ACATCACTTGAAATAGCTTAGTTTAGGCTGGAAGAGGAACTTTTGTTCCGTCATTTGGAA
ACCTTTTGGACTCCTCCATCTGGGAGTTCGCTAGCTTGTTCTACACAGCTCTTCGCAGAG
TCTAAGTTTCACTCCTTGATTCTAAAACTGGACAAAGTACACCTGTTAAATACGTGTTAA
ATGTTTTGTGCGAGTTACGATACAGCTTAACTTTTGAGTCATATGGTGTGTGGATAGGTG
TTAGAGTTGTGTCGAATATTATTGTACAAGGTAGGTTACAGTTGGACTTGTAGTCGTACG
GTGTGTAGACAAGGTAGGAGTCGTGTCCTATTAGGACACCTGTACCCTTATGCCTCTTAT
ATAATGAGAGGGTAGACACACGATGTAA