Map Locations of contig_37701 (10335 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_37701

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_52678 3 2008 bp MLOC_52678.1 Available Available LOC_Os04g40940.1, FRAME:-2, EVALUE:4e-89, 13104.m04005 protein mitotic spindle checkpoint protein MAD2, putative, expressed
MLOC_52677 1 564 bp AK353943 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_52678






CDS Structure of MLOC_52677






Contig Sequence (10335 bp)

>contig_37701 10335 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCTTCACAAATCTAAGATGTTTTGGATATTTTAATATGGACTAAAA
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GGCGCTTTGCCTTCTTCGCTCTCTCTCGCCGGCTGTGGGTGCGGCGGGTCGGGGGAAGAA
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ATCTTACCTGCCTAACTAATCCTATTGCCTCTCTGATTTTTATGGGTGTGGCCCCCTCCC
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TTTTTATTTGAACAAATACCTACTTATGGGTATATGATCCATGTAAGCTTTGGCAAATAC
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TCATAATTTTCTCTCGATGGTTTGATTCATAATTGGCAACATTACAATAAAGAACCAGGG
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TTGAATGGTCTTGTTGACAACTTTAGTTCTTCGTGGAGGTCTAATAGGGCATTACAACTT
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CAAGTTCTTTCTGCTCGTTTTCCATGGCCTTCTTGACAACTTCAAGGTATTCAGTTGCTC
TCGCGGTTCCTCCTTACGTGCTTCAAGCTCTTCATGCTGCTCGCCCACGGCCTTGTTGAC
AACTTCATGGTCTTCCTGCTTCTATGATAGGGCTTATTTGCCAGCTTCAAGTCTTTATGT
TGCTTGACCAGGGCCTTATTGACATCTTCAAGGTCTTCCTGCTGCTCTAGCAGGACCTCC
TTGTCAACTTCACGCTCTTCATGCTACTGTGCCAGGGCCTCCTTTCCATTTTTTGCCTCT
TCATGCACCCATGCTAGGGCCTCCTTGCGAGGTTCACGTGTTCAACCTCTTCATGCTGAT
ATGTTATGCCCCCCTTGATAGCTTCAGGCTCTTCATGTTGATGTTCCAGGACCTCCTTGA
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GCATATTGATAGGTCCAATTTCTTCATGATGGCCTTCTAGAGTTGCATGCATCTCACCAT
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TCATTTGTGATCTTTTCACATCTACTGTAAAACGATGATGACAGTTAAACATGTAAGTAC
TTGATATTGTATAAATAAATTAAGCTAGTAATATTTATATTGTCAACATAATTTACTCCA
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GTGCATATTAGTAGGTTCAATCTTGGGGTGCCCTCACGTTGTGACAAGAGGATAGCGAGG
CACATATTGTATTGTTGCTGCTAAGGATAAAATGACGGGGTCTGAACATATTATTTCATC
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TACCATGGATGCATGTTGGATAGTGGTCGATTGGTGGAGTAATAGTAGTAGGTGTCGGTA
AGTTTAATGGTATAGTTATCACGGAAATAATGCCTATGTATTGATCATGCCATGAATAAC
AACATAATTATTTGCTTTTCCACCAATTGTCCAACAGTAATTTGTGAACCCACCGCTACT
ATGCTCATGAGAGAGATGCCACTAGTGAGAACTATGGCCCCTGGATCCATTCACCTATTA
TATATTCCAAAAACATATAAAAGTTGTTGCTGCAATTTTTTATTCTTTTATTTATATTTA
TCTACACTATAACGAGTACAAGGGCTTGACAACGCTCTTGCGTGCGTTGGGTGCAAGTAT
TTGCTCTTGTGTGTGTGCAGATACTATTGATTATTTATTTGCGTCGTTTTCTATTGATTC
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GCTGTATTTATAAAGGGAAACGTTTCCCTTCGGCGCGCTGGCGGAACCAACGCGCCGGTC
GCTCGCTCGCTCGCG