Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_376412 (1765 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_376412

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_52592 1 447 bp MLOC_52592.1 Available Available LOC_Os01g71300.3, FRAME:+2, EVALUE:1e-19, 13101.m07765 protein S-formylglutathione hydrolase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_52592






Contig Sequence (1765 bp)

>contig_376412 1765 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCGAGGTGGGTGGATCCCTTCCAGAGGACGCCAGAGGGCCAGCTGGGAC
CCCACAAGCCACGAGGGCACGACCTAGGGGGCGCCCTGTTGGCTTCTGCCCAGCTGGTGG
CCCCTCTCGGGTATATTTTTGGCCCAGAAATTCTTAAATATTTCAGAAAAATTCTCCGTA
AAGTTTCAGNNNNTTTGGAGCAAGTTGATTTTTCTGTCTCTTTCTTGGTTTTCCGGTCCA
GAATTACAGTTTTCACATATTTCCCCTTATTGATGTACCTTGCATATTCAGAGAAAAAGA
GGATAAGAATTGTATGATAATGAGAAATAATGGACAAGATCAATATTAATTCATAATATA
AAAAAACATATCATAAATGCTCTAACAATGGATTCACACAAAAGTTAAATACATAGCAAA
TCGCAAGGACGATCTAACTTCTAGACTGACCATTGAAAAAAAAAATCAGAAACAAACATC
ATTACAAACAGGTAGCAAATTAGATTGGGCAAATATACACGTGTCAACCAAGCAAAACCC
AACGCCTAGCATTGCAGACGCACAGTAGAAGCGATACCTTAGCCGGTTTAATATTTGTAA
TAATTCTCATCTTAAAGAAAAAAATTAATTAGGTAAATTAACCGTTTCGCTATGTAATCA
AATATTTTGATTATGTTGAATTGCTGGACAACTTCATGACCTGGTGAATTCATGCGAGAG
TAGCCATAAATTTGTATTAATATATGTTGTGATAACAAGTAAGGCAAATCATTTGGGTGC
TTAATGTCGAAGTCACCTATGACACTTACACAACAACGGGCACACATTGCTTCGTCGACG
GTCAGAAATCGACGCGTAGTGCCTACCTAATATTCACAACTTTGGGCCTTAGATACAGGA
GCAGTACAACGGGGCTTAAAAGAAACAATTCATATTTGTCACTTTGTTGACAAGGCGTAG
ACATTTCACATAGAGCGACTATGAATGGGTTGCTGCAATTATGTCTATATGGAATCCGGT
TTTTGAACCTTCTATAAGATGTCTCTTTATTTCTATTTGTCTTTATTCCATTATTTTATT
TATATATGTTTTTTACCCTTTTATCTTTTCTTATTTTTTTAAATGTCGAAAAAATTGTTT
AAGATTCTTAAAATATTGGAAAATTTTAAAAAAATTCACAATTTAAATAATTTTCTAAAA
GATTACATTTTTATAAAATGAAGTAAAAAATATGGAAAATGTCCACAAACGTTCTAAAAA
CATATTTTTTATTTTCTTATATTTTTAATAAAAATGTTCATATGAGATTAAAAAATGGTT
GCAGTTCTATATATGGGTTTTCTCATTTTTATTTAATTAAATTTCGTGTTTTTTGGTACC
CAAAAGAAAAAATCCAAAGAAAAACAGAAAAAAAAAATCTAAAATACAAACGTGAACGAT
ACATAGGAGGTCCCACTTACAAGAGGCCACCGGGTGACCATAGAGTTTGGTATGTGATCC
ATCCCCTTCTAAAATCTTCACTCTCCCATCTCCAGTCCACTCTCCACCCACCACCACCAC
CACTCCCCCACACCCGGCCGGCGATCGCGCGATGGCGGCGGCCGCACCCCCTCCCGCGGC
GGCGCTGGAGCAGCTGAGCAAGACCAAGATGTTCGGCGGCCACAACCTCCGCTTCCGCCA
CCAGAGCGCCGCCCTCGGCTGCCCCATGACCTTCTCCCTCTTCCTCCCCGCGTCGCCGGC
CTCCAAGCTCCCCGTGCGTGCCCTA