Map Locations of contig_37380 (9467 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_37380

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_52219 6 1468 bp MLOC_52219.1 Available Available LOC_Os03g38950.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-143, 13103.m04228 protein chloroplast post-illumination chlorophyll fluorescence increase protein, putative, expressed
MLOC_52218 1 490 bp MLOC_52218.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_52219






CDS Structure of MLOC_52218






Contig Sequence (9467 bp)

>contig_37380 9467 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGAATCAACAAATTTGGTTGAATACTCTATCCTCGAAAATTGTTGTGATCCCATAAGC
TTTTGGATCATCACATGCATGTCTACTATGTATGAACCCATTAAAATATTTTAACTAGCC
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GAGATACTGAATGGAGATTTAATCCAGATTGGTTTGATAAATAGATCGCTTGCTCGAGTA
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CAAAAATTATTCATTGAAATTGGATTAAGCATAAAGCAGGTTAGAGGCCAATGCTATGAT
GGCGCTAGTAACATGCGCGGTGATTTTAATGGTTTGAAAGAAAAGATTATGCAAGAGAAT
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TCAAAGAGCCGGTGACACACGTTGGGGCTCACACTACATGACTCTTTCAAGTCTAGTGAA
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AGCTGGGTTTTATCCAGATGACTTTGATTCAAGAAAAATGGATGATCTTGGTCCTGAACT
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TGTACAGACTACATATACCATGCTGCGGCACCCGTATCCTGATGGTGTAGATGGGGGGGC
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GGTTAAAGCCCCCTGCATACAGGTCAAGCACCTCATCGGTCAGCTACATAGTACCAATCA
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CTGGGTTGTAGAATATCTTCAGGCCCTCTCCCTGCCACACACACACACACACACACACAC
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TCCAGTACACCGGCGACTTCCCCAGCTCGAACTCCGCCCACGTCGGAAGCTTGCACCTGA
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TAGGAGCGCAGGACAGAGGGGGTAACTAGCAAAGCTTACTCCTTGGTTTGAGGCACGGTG
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GAGAGCGCGCGTGTGTGGTGGGGAGGTGGCGACGACTGCGCGGATGACGATGATGCTGCC
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CTTCTTTGCTCGCCGAACCTCATCTTTTTTCTGCTCGCTGAACTCTTGCAAAATCTGAAA
ATGATGAAGACTGAAGAGATAGTTTTCTGCGGACAGGAACGAACGAACAGTCTTCTTTGA
GTACGTGTCAAAGTAAGCGCCGCCTGGAATTGGTGGCTCCACCGTCACTTTTGTGATTGT
TCACACCATGCTACTTCTACGTAATTATTAATGCTCACTCAGATAAAACATTTTTTCAAG
TCTCAGCCGACCAAAGCTTTTCTTTTCTCTTTTACGACTAGGGCAAAATGTTTCTCCATC
TATCTCGATGATAAGCGTGTGGATTCACCTCTCTTTGAGGACCGCTCTTGATACCGGTGA
TGGGGAGGGTGCGTGGACTCGGGCTAATAGATAGGTTAGGCTTTTTGTATTCAAAAAGGT
GGAGCTCCGGTCCTCCTCAAATTGGTTCGCCGAAACGGATTTGACACAACTTTGGCTTAG
ATTTCTGTCATCTCATCGAGGCAACAAGATTAGAGTTTTTCAACATGGGTACTTGATGAC
GAGAGTACCAAGTTCTTCAGATCGATTCAACGGTTCAACAACAACGAGTGCAACTCCTAG
AAGTGGTCCTTACGGACAGTGGCGGAGCTTCATGGGACAACCTGGGTCATGCCCCCCCCC
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CTCAAGCTCCATCATTGCTTACGGGCACATGCATAAGGACTTCCTGGTTATCACCAACAA
GGCCAGGTCGGCTCCATTATGGGAGCGAAAACGCCGGCGCGTCGGCGGCTTGCTCAAGCG
ACATGAGTTATCATTCAATAGTCCAGGGACCTTAGTGTATTTATGATGAAACTTATATAA
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TTGTATTTTCTTCCATTTATGTTATTGTCTGCTTTTTTAACCATGCAGAAGAGCCGCATA
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TTAAACAACATGACATGAGCGAACAATTTTTTCTTGTTACATCAATTCCCACTCCCACGC
TTAATTACCTGGTCCTTGCAGGGAAGAGACCGAAGGGAGTTGGACCTCTTAATTCCCCTT
CCTTTTCCCATCTCAACTCCCATGTCCCTGAGACAATCGAAGGAATTTAACTCCCATATA
CCTTAAACTCCCATTCCCCATCTACAACTCCCCCCAAACAAACACGTTGTTAGTCCAAGC
GACCCAAAAACAACAAACACGAGGAACAAGGCAATAAAAAACAAATACAACCATAGTCAA
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TCATGACCTCCCCAATGGCAATAAATTTGATGTCAAAAATGCAGATCATCCTCTCCCTCG
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GCTCCATTTGTCTATCTTTGTTCTTCCTTAATTTTGAATCATGTATGAAACCTATTGCTA
AGGAGTATCCCACGGACATCACCATGTCAAGTGCCCCATCATCAAGAGCACGTGTCTCTC
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GATGGTATACTACTTGACACTCCTACCTTGTTCACCTTTAGGTCTATGTTGGATGTCACA
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ATTCTTGTCTTTTTTGCCCCTCGCTTACCCCTTCATGCCTAGGACTACATATATATCTCC
CCCAGCTTAGACATAGCAATAGTGAAGACAATAATAGACATTGATAGATCTTAGCTCATC
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TTACCTATGTGTATCTTGTATTGAATTAATGTGTGTTGATTTGTGTTATGCTTTCCTTGT
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GCACCCCTAGTGGCTTGCCCCATATGATTTGATATCATGAGAAAAGTTTCCATCAAGTGA
ACCGCCCCCTCCATTTTCTAGTCTTAATTTGATTTTTCTTGCCCAAATTCAAAAATACCC
CCATACAAAATACTCCTACCCAATTTCTTGTAATTTGTTGGATTTCATGCGAATTTGTCG
GTTTTGATCCATGGATCCATTGCAAAATCATTTGATCTACCTTCCTTGGCCCTTGGACAT
TTTTTCTTTTCCCTTCATTTCCCTTCAAAATCGTGTTTTTCAGCCACCCTCGTGCCCATG
GGCATCTGTTGATATCCCATATGGATACCCCATGCCGATGAGGCTCATGGACCCTGTGCC
CATGTGCCCCAGGAGCATCTGACATTCATTCATCGTTTTGGCCATAACTTTCAATCTCAT
ATTCTGATTTGAGTATCCTTGGGCTTGTTCTGAAGATATTGATGTGGTATTGATCATCGC
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TTGGGCACCGCCTACATCAACAACCATAAAGTACATCATCCATGCTATGTCATCAACAAC
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CCTTGGTTAGCCATTCTATTCTTTGTGACATCCTTGATAATATTGAGCATCTTGTGTGCA
GACTATGGGCATAACGGTTGGATTTGGGAAGGCCTATAAAAGGGGGTCTTCTTCGTTAAT
GGATCTTATCTTTTGAGCTAGTGTTCTTTCCCCATTGTTGACATTCT