| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
No map location |  |
Predicted Genes from contig_37015
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_51664 |
1 |
222 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_51664
Contig Sequence (12839 bp)
>contig_37015 12839 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAACCTTTTGGTGTTTCTATGATTAAATAGATAATTATTTACCTATAAATGATTTTTGGA
AAAAATAAATGCAGCTGCCCTTGAAATTTAATTTTCTTTTTCACGAGAGTTCGATAAAAG
CTTTTGACACCCAATCATTTGGTCAATTGTACATTAAATATGGCCTACTATGTCAAAAAA
TGATTTGGTCTAATTTTGCAACAACTTTATATGGTTGGTCCTTAAAAAACTCATTTTGGG
CACTCGTAAAATGGAAAAGGAATTTTCCATCCAAAGAAAATGAAAAAATTCCTTAATCAA
CATTATTTGCCATTATAATATTCACCCTTTTGCACAATATTTGAACATTTGAACAAACTA
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GTAGCTCATTTGTGAGAACACTTTTTAAAATAATTGCCATATTACAAGTTGATTATTTTA
TCTCGTAACTTTTTCACATATAATGACATAATGTGAAGGTTTTCCATTTTTTTTATTTTT
TAAAAATTTTATGCCCATTTCAAAATGCTGTCAAAAAGGCACGTATGACCGTTCCTTGCA
TGTGGTTGAATCTTGGAAACCTTTTGGTGTTTGTCTGATTAAATAGAGACTTATTTACCT
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CCCGCTTCCAACTGACTCGATGAAAATTTGTCTTTTTCATGAGAGGTGGATAAAATCTTT
TGACACCCAATCAATTGATCAATTGTACATTAAATGTGGCCTAATATTTTTTCTAAATGA
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TTAGCTAAAACATCGTTCTCCCGGATTGATGACATGGCAGGGCAGCCAGCTCCACTCTAG
CTGATCTGAGTCGTCAAAGCCAACGAATGCAACGTCTCTCAAAGGATCCCAACGCTGTGC
GCCCACCCTTCACTTTCTAAACGCAAAAAAGAAAATAACACAAACCCTGCCCTCGTCCCA
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CTCTTTCCCGGGACACATCTTCGCCGCCAGAGATGCCAGGCAATTCCTAGGTGCTACTCG
TAATCGTCGGAGCTCACCATCCACCAACAACATGAATCCCCAGGTGCTGCTCGCTGTGCT
AGCCGTCCTCGGCGTCCTCGCCGCAGCTCTGCCCCGAGCCCACATCCAAGGTGAGGTCGG
TATCCTCCATCCTTTCTTCATCTCCTCGTCGAGTAAGTCAGTGTAGGTAGTAGCCGTCGT
ATTGACTTTTGTTGGCTTCTTCCTGCAGGCGCGACGTTGTGATGCGACAAGTGCGGCATC
TGCACCAGGTCCTTCTCGCCGCAGTGCAGATGCATGGACGCCTCGCCGATCGGTTGCATC
CCGTTATGCAAGTCGTGTGCTACGTCCATCGTCAACGACCACGACATCTTCTAGTGCAAG
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GTTGTTCGTCCCAATAATGCTGATTAACTTGTGCTTTTCCACTTTCTTTTTTCAGTATTT
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TGATTCGATCTAGTGTTGTAGGAAGCCTCCACAGACGAATGAAAGGAGCGGAGGACAAGC
AGCCCCTGACGCCCAGTGCTCCTCGAGGCCCAAGGACCAGAAACGGAAGCAACATCTTCT
TTCATTCAACACAAGGACAAGCAGCGGGTGCGACAACAATAGATGCAGCCATGTGTTTTG
GTTATACTCTGTGGCTAGTTATATTGCACTCAGCAGCATATTTGGTTGTATGAACATGAT
GTTAAGACCGTGAGAGGCTAATTTTGTCTATCATTTGAAGAATCTAGTTTGTTTCATTTG
AAATATTTATCATTTGTGTACTATGAAAATGTGAGAAAAAGAAGTTGATGAGTTGGACCA
AAAAGGCCAAAGTCCAAAAAGTCAATGAAGTGAGAAAAGGTCATGATTGATTGTAAAAAG
GTTGAGGCCCCCAAAGGAAATGGACTGTAAAAGGCTTAAGCCCAAAAAGGAAACGCCACA
TCCCACAAAACAAAGAAGGCTAAAATGTTGGGCCTAGCTCATTTAGTTGACGAAAATTAA
TATGAAAAAATATAAATAGGCTGAATTGTTGGGCTCGGCCCATGTAGAACATCAAACTGG
ACCGGGTTGATTCTTATCAATGACCAATCCAATTGGTCGTAACTTTGCCACATCAGCTTG
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TAGTTCATTGGAGACGGACAACTTTTGACCAACCCATTTCGGTCGTAAAAAGGTAAAAAA
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TTGTAGTGAAAGTCGTGGGCAAGGGAGCATTAGGTGCCATTTGCTTCATAAGCATCAGCA
TATTTGTCATATTAGGCTCAGGTGCTTGGAAAATGCACTTGGTGGCTTCATCATAGGCAA
TAGACGCGGATGAAAGTCTTCCCTAGATGCAACAAGTGGAGTGGTGGCAAACAATTACAT
GACATGAGCCTTAATATGCTCACCGCGGATCATGAAGTTCATCGCCCATGTCTTGAGATC
TCTGCCGAAGCTTCATATGTGAAGGGTTCGATAAAAATGAAGAATGAGGTCTTCATTCGT
ATCTTCGTGATCAACAATGAAGGGCAACAATCCAACATCCCTAAGACAATAGAGGGCTTG
ACTAAAACTAGGAAGGTCACTCGCGGCTTCAAATCTGATATGCTTATGGGGAAAGATCAT
ATTCTGACCATAGAGGACACATGTGTAATAGGTGCATTGTCGATCACTACACAACCTAAG
AGACTAAATCTTCTAATGCTTGTAAGGATCCCGATAAGATGCGAGGAATGTGTTTTTAGT
CCGGAGCTCTTGACACCGAAGACAAGGGGACACGCTGGTCCTTGTCATTGAAGACTTGGC
ACCCTTCTACCTTGGCAAATGATGAATATTGAATTCGTACTACGGACCCATTCTTGGTGG
AGGAACTAGCCCAGGCCATTTGGTTGGAACCATGTCTCATCCCAGTTGCGACCCATGACA
ATATTTTTAGAATTTTCATCAGTCGATGGCATGGCAGGAAAAGGAGGGCCATCATGAGAT
GGGGCATTGGCCTCGACCTTTGTAATTGTGGCGGGTTGGGGTTCTGGAGGGGCCACATCG
ATGTTAGCGGCATGTCTTTGGCTGCTTTGGATTTGTTCTGTAGTTATTGAGGAGCAACAT
CTTCAGTCCTCGGAATCTACTCGACTAATGCAGTTGGATCATTGAAGATATAATTATCCT
TGTTACTTTGTGAATCCTTTTGAGGGGAACACATGTTCAGGAGATTCAACCTCCAGGTCT
ACAAATGTAGACTGAGGCGATTCTATCACATGAGTTGAAATGGGAGCACACAGAGTGCAA
GGCATGACTTCATGCATCGGGGTGTTGGGGTGATTTGTGTTCAAGAACTCATCATGAACA
TTTGGTGTAGTAGGAGACCAATGTACACTTGTTCACTGACAGTTGGTAGTGGTAATGGTA
CCAAAGGTGCATCAAGTTGAGGAAGTGCTTCAAGTTCTTTTTCAAACACTATCTTTAGTA
GGAGCAATGTCTTCAGTTGTGGTGGGTTCATCAGCTGGAATATCTTCATTTTTGGAGTCT
GTGTGTGCTGGAGATATGCCCTAGAGGCAATCATGTATGATGATATTTCCTGTGTGTTTA
TGAATAAAGATGGTCCTTGGACATTATCAATGATGTGTATCAACAAGTATCTGACTTGTT
TGTGAGACTATGCATTGTATAATGACTGTCCTAAAGAGTCCCTAATCGAAAGGGGTGTGT
GGACGCGCAGCCAATCATACTAGCATATGATATGGGGGATGGTCCAGTCTGACTGACCAT
GTACCATTGTATGCTAGTCGTATAATATGGATTCAGAAAGATCTTGTCAGATTCAACGTA
GTCGGATCCGAGTTGAGATAAGGTCTGAGTTGGACACACCCAACTATGAGACCTAGTGAT
AGGTCAACTTTGAGTCTATAGTACACCATACGTTCTTCGTCCTAAGACCTAAGCTGGCGC
ATGTACTCGAGATGGTAACCTACATGCTTTGAGGCGACCCAAAGGTAGGTTTCGGGTTTG
TCCAGACCCATGCTGCAAGACATGGTTGAGCAAGATAGGATTGGCCCCTCCGACCAGGAG
AGATATACTCCGGGCCCCTTGGGTTATCTGACCTCGATAAGCATGGTCGTGCGATGAGGA
TTATGAGACAAGTAGACATGTTGGTAGGATTCATCAAAACGAGAAAGAGGTCATGCTGCA
ATACGGATGACCATGTCGCCTTGAGGACGACTATATATATGACGTGTCAAAGGGAACAGA
AGTGTGAAGTACAGGTTCGCCCAACTAGCTTCACCGGACACTTGGAGTCGGCACACTTTT
CTAGAGGACACTACAGACTAGCCGAGATGGAAGTGTTCTGACTCGCGACCAAGTGAACGA
GAACCTAAGGGGTTGTGCACCTCAAGAAAGGAACTTTTGGGCTTTAGGATCTGTGTGAGG
CCCAAGAGTTGAGCCCAACCTGTATGTGGGATCTAGTGACCGACTATTTGAGGGAGATCA
GACGAGGAGGAGATGGACCTCCCGAACGCACAACCCCAACTCAACGTCTGCATCACGACT
CTGCGCGTCTAGTGGTAGCGATATGTGCGTAGCAAAATTTTAGTTTGCATGTGATGCACC
TATGATATAACCCGGCACTTTGGTAGTACCCTCATGAAGAACAGCATGTCTATCAATATT
CTCAGACGCATGAGAAGCCATGGAGATAGGCATCACTAGCAGCGGCTCCTCTTGAGAATG
TGGAGTAGTAGAGGGAACTTGAGGGGTCTTGGGTACTTGGCTCGAGCTCGAAGACTTTTT
CTTCTGTGTCTTCAGCTTCTTGGTTGAATGGGCTTCAGGAGCATGCAAAAATTTGCACTT
TCTGGCATCAGCTTCAGCCTGTTTGTCTTCTTGCTGGACACAACAGAGGAAGGAGGAGGC
GTACATGAGCCAGAGAAGACAGTTGGGAAGATAATGTTTGGCGTTTCATGCCTTGTGGGT
GTAGACTGGCTCGAAGACATAGAAGCTTGCCTTTACCTCTCAATTATTCTTGGGTGAGTA
GACTTCTTTTTCTCTAGTAGCATCCCGACGCTTCAAACTCACGTTTCAAGTAAGCCATCA
ACTTCTAATTTCCTTAGAATTTCTTAACATTGAGCTTGTGAAAATTCTTTTTGAAGAGTG
CCTTCTCATGGCGAACCTTTCGTGCATTTGATCTGCCTCCCGAGAAACATATAGTTCCTC
ATTCACCAGCGCTTGGAAGGTGACACTTAACCCAATGGGATGTTGTAGGGCGTCAATGGA
TAGTGAGGGATCGACAAACCATTTATCGATGAATGGTTGAGGATATCTACATCAAATAAA
GGCAATTCTTCAAGACGTTTGGCCTCTCCATCATTTAGCTGGATGAGCTTCACAAGAGCC
TCATCATCGAACTCCTCATCTTTAAGCTCAATCATGTTATCACCATCCATCAAAGTGATG
GATGGCGTCGTGCCATGAGTAAAAATGAGTTTTGTCTTCATCCTCCTTATGGTGCATGAT
TCATCCACAGTTTCATCTAGTTCAACTGGCCTTGATTGCGAAGCATGTGGTGTTTTGGCG
ATTGGTTTTGAAACCTTTGGTTCCTTAGGCTTCGAAGCCTCCGTATTCTTTGGTGGCTAT
GGAGTAGGAGACAAAGGAAGTTATGCATCCTCATCAGAGGCTTCTAAAGTAACAGGACAT
CGCAAGATGCTGGATGGGTCTGGATGTTTTGGCATGGGTGGCCTGACCATGCATGGGTAC
AAGCAAATCTTGATGGATTCAACCTTTGTCTTCAGGTGGAGATTCTTGTATACAATATCG
GTCCATGGAGAATGTTTTGCTTTCTTTTGATCATATTTAGTAATGACAAAGTGGTAGTAG
AACCATCGTCTGACCAATTTCTTCGCATCGATTGGATCTAGTCTTGTGTTGAGTGTAATT
CTCTTCAGGATCAGACTTGTATCTCTCATATAGAGCAGGTGGGAGGTCTTTTGCAATGTT
TTCATGTATTTGTAGGCCACCTTTCTTAGGTGCTTTATCTTTGGCCATTGTCCTCAGCTT
AGACAAAGGCTTCACAGAAGTATGTAGGTGTGAACTGGCTCCAGGTGAGTCCAGGTGTAT
CTGAAAGTAGTCTGCAAATGAATTGAGACTATGAGATCTAAGAGATTCTACCACATAATG
TACATGTGAAAGACTTAAAAATGTGAGGGGAATAGAATAGGTCATATGCATTCTCAGAAT
ATTATCAAGACAAAAACGTAGTCCGAAGATAATGACCTCATTCACCGAAGTCATCCACTT
TTGTTGAAGATAAGGTGGTTTCATACTTGTGAAAATTCAAAAAATTGCACAAGTGAGGAA
TCAAATTATATTTTCAACGTAAGTGAAAGTATTGAGAAAATAGAGATCGATGTTTGAGTT
CTATCAAAGAGGAAGTGGAAAAAACGACATCCAAAAATATTTGCTAATTTTTCACATCAA
ACGAGCGGTAAAAATCAGCGATTTATTTGCTACGATGATGAACACGAAGAACTGCTCGAC
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CGCCGGCAGCGAGGCCGATATAATCACGACCGACATGAGTACGGCGACGAAGAAGTCACG
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GGGTGGAAGTGGGACAGGACGACAATTTTGGACAGGTATGCCCCTCACCCTTCGTCTTAG
TGGGACATATGGCAAGCATGCACCATGTCTGACAACTCACTAGCCCTTAATTGTAGCAAC
GAGCGCGGGAAGTGTTGTTGTAAGGGCGTTAAAAAGGACAAGCTTGAATTTTAAATGTTT
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GATGAAACTCAAGAATATTTATATGAAATATGCAAATGAAAAATGTTCAAGTATGAATAC
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AAGCAATGTCTTCAAGAGGGGGTGGTGGCGTTACCCATCGTATAAGAATATTTGACCCAA
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CATCAATATGGATAAGCATTATGATGTGTGTTCATTCACTGGACATTTGAGGATTCTAAG
ATATTTAGCTCACACCACAAGTTGCAAAACCTCTTCTCATCCAAAGGCCCGATCAAGATA
TCAGCCAATTGCTCTTCTGTCTTCACATGCTCGATGACAACGTCTCCCTTCAACACAAGA
TAACGAAGGAAACGATGGCGTATATGAATGTGCTTTGTCTTGGATTGTTGTATAGGGTTG
TGGGCGATATTGATGGCACTCTCATTGTCATAGTAGAGTGGTACTTTCTTATTGTTGGTG
TCGTAGTCCTTGAGGGTTTGCTTCATCCAGAGAAGCTCTGTACAACAGACACCAGGAGCA
ATGTATTCGGCTTCAGTAGAGGAGAGTGAGACGCAGTTCTTCTTCTTTGAATACTAACAT
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CAAGCATAATTGGAATTTGAGTAGCCAATGAGATCAAAATCAGAGCCCTTTGGGTACCAT
AATCCTAGCATTGGGGTGTGAGCCTGATATCGAAGTATTGTCTTCACATCGAGGTGATGT
GATTCCTTTGGCGTGGCTTGGAATCAGGCACACATGCAAACACTAAGCCTAGATTCACAC
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GTGCGGAGGTAGCCGTTTGTCGGCATTGGTGTATTGTAAAAGTCCTCACTTTTTACTGAA
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TTGGGCATCAATCGAGCAGAGTTTGCTGCAGTTTTTGGTGGCTGTTTCATGTATTACAAT
TTTGCCTTTTCTAAAACCACATGTATCTTATAATCTGATTTATCTTCTTTGTATGAGCAG
TAGTTTTCTGAGATTCCAGGTAAGGGACGGTGGTGGTGCCCCTGTAGGAGCAGGAACAAA
GTGCAACGACAACGTGAGCTCGGGTGTGTCGGGTGGCAAGCTGAGTTTCAAGTGTGAGCC
CGGCAGCTGCTTGTTAGTGTGGTCGGTGGTGTACTTGTCAACTACCATATTTGGTCTTCC
TGCATTGCATGATGCGTGTGTGGTTCCTGATGGTAACCTTTTAGCTAAAGAGGTTATTTT
GGTACTGATGAATCAATGGTATTTCAGTTGGTGGTTGTTGTGCTTATGTATTGGAGCCTA
AGTAGATATGGGAATATAATTTATGCTGGGAGAAACCTGGGAGTTATAATAGAGCAGCAT
GGCAACTAAGGTGATAATGACCCCTTATGTTTTTCTTCTCCTCTTATTATAAGATACAAT
TTGGCTCTTTGTTTTTATTAGAAAAAAACATGAAATTGGTTGCTCTAATAACCAGCTCTA
TCAACCAGAAAAACATGAAATCCATATACTAATGTTGCTAGCTGCTATACTGTTATGATG
TTGCTTGCCTGATTCACGAGTGCTTCTTAGATTTAATAAGAATAAGAAAAATACCATGCA
TTTAATTCGTTGGACAAGTAGCACTACTAGTATTTGCATGTTTCCAGCAACCATTTATAT
ATAAAAAAAGCTTCAGTTTCGGACTGTTGATTTAGCAACACCAAACCAATGAATCACCTT
CATCACAGTGGTTTAAATCAAGCCATATTGTGATTATGCTAGCTATTGTACTTACTGGGA
AGAAAGTTGCTTTTTGGCGTGGTGAAGTCCCCTGTTTCTGAGATTTGTTGTGTGTTAGAT
TCTCGAGTTAGATCCTTACGAATCTATGGCTGGATTAAGTTGGAATGCAACTTTAAGATT
GAAAATGTGCTATAGATTGGGTCTTGTTTAAACTGAACATGAGAATTCTACTGTGTTATT
ATATCCTCGCACTGCAGTACTAGTATTAGAATTATGCTGACTGAATAATATCTCGAATAG
AACATGAGTTACGCTGCATTATTTGGTCCCTAAATTAATATAGAAGAAAGAAGGACTTGA
ATTTATGCTAGTACTGATGAATATTTCTTCTACATATCTTATAGGAAAATTAGTTGGATC
ATTAATTCAGTTTTCTACCTGATTGTAGTTTTCGTTCATTCCGTTTTCTACCTGATTGTA
GTTTTCATTAATTTTAAAATGTGTTTGTGATTGCAGATGCCATATTTCTAGCTGAAGGAG
AACAACTAGACTCTTAATGGTTACATGGATGAAAAATAGGATGTCAGATTCGATATGTGA
CCGACCAGGAACCTGTTTACCTGGATCCATCATTGTCTAATGTTTGATGTTGTGTACATC
TTATTCTTATTTTTTGCACAGGTGAAGTACAAACGAAAGTGTGAAGCTATGAAGCGTATT
AACCAAGAGTGGCATATGTATTGTAATAGTAGGTAGTAGTAGGCATATCTGGGTTGTGGT
GTAGTGTAAAGATTATAGTAGACAAATTTACTGTTGGTTTGGGCGAATTTCATTTGCTCC
CTAGTCTATCTGAAATATTGATTATGAATGTGATTTGAATACCTTGGCCACTTGACAAGG
GTGACCAAGTTATGATATTTATTTGACAAAATGTGAAATTTCTGACGTGTGGGACTAGTT
TTGAGATCAGCATGACATGTGGGACGAGTACAAAAATAAAATGGCCAAAAAAGAAAATCA
ATAGAAAGTAAAAGGCCACAAATCAAAATTAAAAAGGCTAAAATGTTGGGCATGTCCCAT
GTAGCTAACCAAAATTAATAGAAAAAATATGTAAAAAGGCTGAATTGTTGGGCTCGACCC
ATGTAAAACACCGAATTGGACCGGGCTGAATCTTATCAACGACCAATCTAATTGGTCGTA
ACTTTGCCACGTCAGATTGCCACGTTGGTTCCGACATGGCCTCGCAAACAACCAACGACC
AAAATGATTGGTCGTAGAACAAACAACCTTTTGTTTGGTCGTAAAATTCTATGACGATTC
CAGAAGAAATGTCGTTATAGTTCATTAGGGACCGTCAGCTTTTGATTTTGTTTTTGGTAG
TAAAAAGGTCACAAATGGAAACCAACGACCATTCGGTGACAAATATTGAAGGTCGTAAGT
TAGCATATTTCTTGTAGTGGATGGGTTAGTATGATAAATATAGATCATTCACTTAGGTAA
TGCCAAGACAAGATTCATAATTGTTATCACGTAATACCTACTATATTTTCATAATCTAGA
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GTGAAAAACAGAACAATCTCTAAAGATCTGCACAAATACCATACTTCCGTGTCTCTAAAA
ATTGTGAAAGATTAGGAAAAGTCACAGTTTTTACTTATGAAAACTTTGTAAAAAGTTTAG
AAGTTTTTGAGAGTCAAGTAAAATCAGCGAAATTCTGCATCGAATGTAAAAGTCCACACT
ATCCCAAAGCATTTACTTGTCATTTTATTGAAATATAACACAAAAAACATGACTAATACA
GTAGCTTAATCATGTGAACACAAAAAAACATAAAGGATAAATATTGGGTTGTCTCCTAAC
AAGCGCTTTTCTTTAATGCCTTTTAGCTAGGCAAGATGATTTGAGTGATACTTGTATAAA
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TAACCACTTCCTATGCATAGGGATTTTGTGAGAAACGACTTAAGGGAGCAAGAATCCACT
TGCATAGGAAGGCAAAGCAAGCATGACTTCAAAACTTTGAACACATCGGGATGAAACTTG
ATATTATTGCAATTCATACAAGCATATGTTCCTCCCTCATAATAATTTTCAGTAGAATCA
CGAAGGACTTAAAAAATATAACTATTACATAAAGCATTATTTTAATGATGCACTAGTACG
TCCATTTTGCATCATGTTTTNNNNNNNATATTTATCACTTCTTTGGTTGTTATTTCACT
