Map Locations of contig_368825 (3727 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_368825

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_51266 1 345 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_51266






Contig Sequence (3727 bp)

>contig_368825 3727 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTGCAGAATCACCTTCTTGGCCTCCTGCACCGATTTCCCCACCAACTCTGGCCACTCTGT
CTTCTGGTTTTGACGGTCACCAGCACCGATGTTCACTCCCTCCGGCTTCTTCTCCATGGA
ACTCATCCTTGTTACGCTTGCTTCCTTTGATCAAAACAAATAACCGAAACTGTCACACAA
AATCATCTTCACAAAACTATTATAAAAGAGTAGATCTAGCATGCGCATCCTAACCTGTTA
GACTGATTAGATTGCCTGTGTGACTGCGAGATGTTGATCTGTCATGTCATCAGCTTAATG
TGTATATATAGGAAATCAGGCTCGACTCCTTATAATGTGTCGTTGTGCACACAAAGTAAG
CTAACGATGTACTCCAGGCTAGCTTCACATGGATGGTGGTACCTTGAAAGAACATATCCC
ATTTTGCTTTATTTAGTCAGTATTATGTGCCTACACATCACCAGATAAAGTAATGCTTAT
CTATCTTTAGGAGAAAAGGATGAATGCAATCTTGCACAGAGCATCATCGAAGCTTGTCTT
ATCGTGGTGTACACTTCTAACAATACAAGAATCATCACATGCCCAGCCTTTTTTGGTAGG
AGAAGAACACGACACTCCATACAACTCAACAAAGCGGATAGAGAACATTTCTTGGCATAA
AGAACCAACTTTGTTGTTACTAGCCTCAGCATCATAACATTGAAGGCATACTAAGAAGTT
GTGCTCCACCAAACAGAATTTTGCACTCCACAATACATTTTTCTATTTCTTTCCCTTCAA
GTTTACACTACAACTTCCTTTCACATTAGTGTTCACCAAAATATATTCATATATAATAAT
TTATATGTTTTATTGTTCAAACATCAAGTGAATGTACCTTGAGTACTACTAACACCGTCC
CATAATATAAGAGCGTTTTTTTACACTAGTGTAGTGTAAAAACATGCTCTTATATTATGG
GTTGGTTGGTGTAGCTTCCAAAAATATTGATTTATAATATATTTTTTCTACATGGAAGAT
ACTACATTATAATGTTAAATGCATAGTTATGTAATATTTTGAAATATTAAAATATATCTA
ATTTTTGATATAATTAAAATTTAATATACATGTATTAATAAGGACTCTAATTTTTTTAAA
GTAGGTAATTATTTCAATTTGTACCTTGTATCCGAAATATATGTAAAAGAATATCAATTT
GTTTGGTTCCACAAATTCAAACGTTTATATTGTATTGGCTCTTAATTACTGAATCTATAA
CATGCTCTGGCAAATTTTAATGTGTGCTCCCTGCAAAAAGTTGAACTTCTAGTAGCCTTA
GTTAAATATCTTGCAACGTGTTTTTGCACACAAGACCAGATGGACCCGATATCGGGGGGA
GCGACTAGTTCTCAAGACCAGATGGACCCGATATCGGGGGGGCCGACTAGTTCTCACCCT
CAGTAAGATGGAGCTCCTATTTGACGCCCACAGGTGGAAAATAGTCGAGCCTTCTCAGAA
GGCAGGAGCAAATGTGCCAGTCCATTCTTCTGGTGAGCTGTTTTCTTGGTTTCTTGGGCT
TTTAGTTATTTGTTAGAAAAACAGCCTGTTATTTCTTTGGATCTTTGTCACAACAAATCA
TAGGAGGTACATTTTTAAAAGCCTATTAAAATATATAAACATATCTTTTACAAATTTGTT
TGGTGTGCATTTTATAAAAAGTTCAGTATATATTAAAAAACTTCACCATGTAAGAGAAAA
CTGTTAAATACCCATTAAAGAAATTTACTACAAAAATGTTTATAACGTATCAAGAAAATA
GTTTTATATATATTAGAAAACTGTTGGATGTGTATTAAAATGTTGGATGTATACAACAAA
AATTGGTCATATATTGGAAAATAAATATGTTCATATTGGAAAACAACCAGCGAAGGAAGG
ACAGTTAGGGTGACAAATATAGTAAAAACGTAGTTGTATTTCGTTTTATTTTTACTTCTG
TTTTCTTATACTTTTTAGATATTATAAATACATATATTTGAAATATGAATTTATTACATA
ATTTTAAAAACTTACCACAAATTTAAAATTTCCATTTAGTGTAAAAAAGTGTAGTGTAAC
TTCTACAAAATATTGATAATGTTCATTGAAAATGTTTGTGATATTGAAATAATTTTTACA
CATAAATTTATTATTGTGAACTTCCTATAAAATGCTTATACAATATAAAAAATTGTTTGT
GTAATTCAAAAATGTTTAATGAATATGCGAGCTGATCATTACATTGGACACGGTTAAATA
TAGCAACCATGTGCAATAGATTGTAACAATACAAACGATTTGAGTAAAGGATGTGTGGGT
TATGTTCGTCTTAATGTAAACGCTCCATAGGGAAATAATCATGAATGGTCAAATCACAAA
CATTGCTGTAATTACCTACAGAGATAAAGGAATTGTGCGCACACATTTAGCTTTATAAAA
TTGTGGGCGATTGTGCCCTCAATCGCACGTGATTGGCTAGAAGGCAAACATGAGCGTGGG
TGTTTGTTATCACAGACGTGTTTCCGTTGGATAGCAATGAAACCCCCAACTATTAGCTAA
ATACTTTACATTAGTTGGGGTCTGAACTACTTTACTTTAGCCATTGAAATACTTTACTTT
AGCCAGTCCACGTGATCCCACGGTTCCTGAAAACTGTGTGCAATTGGGGTCTGAACTGTG
TGCATAGCCCCATTGTGTACTAGTGTATCCAGTCGTCCCCTCAACTATTAGCTAAATACT
TTATATTTTGACTAAGTACTCCCTCCGTCTCGATACATTAGGCATCTTAGGTCCTGTTTG
ATTAAGAAGTCCTAGAATTTTTTTTAGTCTTAACTAAAAAGTCCCTAGCAGTCCGTACAT
GTTTGGTTCGAGGGCCTTAACATGGACTAGGGGTTATTAAATGACATGCTAAAAGACCAT
ATTACCCCTAGTAATGGACTAGAGGTTATGAAATGACATGCTAAAAGTAAGGACATTGTT
GGAAAAATACCCAAAAAGTCCCAAAAAAGACCCTCCTTCACGGACTTCTTCCTTTAGTAC
CAAAAGCCTACTTTTAGTCCCTAAAAGTCCCTCATGTTTGGTTTAGATGGGACTAAGGGA
CTTTTTTTAGTCCCTACACCAAAAAGTTCCTGTAAACAAACACCCTCTTAAAAAGTGCAC
TGCAACCTAAGCACGTAGAGACTGGATAGGAAAAGAAATGAAATTACAGAGGAAGCCAAT
CACACTTTTCCTTTTTCAACTAAAACATGCTATTATTTAGGAGACCTCTTCAAATCTAAA
TAGCGTGCTGTATAAATTGCAATCATTGGTCCTTCAATTAATAGATGGAGTCTAATTAAT
ATGCATGCAACTAGTATTAATTACTACTAGTCGTAAACCCGTGCATGCGCACGAGTATCA
TGAAATATTCATTGTTGACCGTATTAATAGATAATTTATAATATTATTAGAACAACAAAA
TGTTAACATTGTTGAAGCGACTTTGAATAATTATTTGTCTTCTCATAAAATCAACATTAT
AACATAAAGAAGACTTTATGAGTGAGACTTACTACTATGTAAGACATAAATGCACCAGCG
AGAGAAGTCCTTGTGAACTCCATCGTGCTATTAGTCAGAAAGCAAGGGAAATGAAAAAAA
ATTGACAAATAAATATGAATCCTAGTGAAAATCATAAATATATTAATAATATTAACAAAA
ATTAATA