Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_367934 (4958 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_367934

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_50953 4 1785 bp MLOC_50953.3 Available Available LOC_Os08g08840.2, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13108.m00927 protein phosphate/phosphate translocator, putative, expressed
MLOC_50954 1 142 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_50953






CDS Structure of MLOC_50954






Contig Sequence (4958 bp)

>contig_367934 4958 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTGGCCGGCCGAAAGTTTGGGCCGGCGCGCCGGCGGAGAACACTGGCCTACATAAAAACT
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CTTCTGATTGTCCTTCCCTTGTATCTATTGAAATAAAACTTTCTTCTACTGGACTTAGCA
TTTAATATCACCACTCCAGTTTGTGCATACAATTATGTGGCCTCTCCTATGGCCATAGAG
GTGCAGAGATAGCCCAAATTATGAAACATGCTACTTTCTGATCCTTGCTGTTGTTGTAAT
TCGAAATTACGATTGGTTGCTTTGAGGGGCAGGTGGCATTTTATGAAAAACGTGACTAGA
TCATGAAGAGAAATCATCAAATGATTATGTCAATGCATGCTCAAAATACACTCAAGGTAG
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TGCGTTCTGATGTAGGCAAAGCAGTGAGGTTTGACTGTTGTTGAAGGTCAGGTTCATGGA
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GTTTCCTTTTATTTGTTAAATCACAAACTGAGCTCCAGTTATCACGAACTGTTGTTGTAT
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GTCCTGTGCTTAACAGTAAATTATTGAGAATTAAGAACTTTGTGTATTTCGGATGGCATG
CTTTCTCTTATGTTTCCAGCTTCTTGTTTGTTGTTTGCCAGGAGCCCTGTAGTTGGAAAG
GTCTTGTTTATATCAATAAATTGTTTGAAGTTTTTTTAAAAAAAATCTCTGGTCACTTTT
GTAGTCACTTGCAAAAAAAATGATCATTATATAACTCTGTACGAATGGAAAGACTCTTCA
CGATGCGCGACGCGTAGCTTTGGTGCTCGCAGCCACTTCTGCCACAGTAGCTTCCGCCTA
GATCTTCCCCCGGGTTTCCTCTGCTGGTGTGTTATGCCACTTTTAATGCATTGATGCTAA
GATGAGGTGCTAAGCACATTAAATAGTTTAGTAACTAAAGTCTTCAATGCATAGTTAATT
AACTTAGGCCCTGTTTGAAACCATCCAGATTATATAAT