morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_364260
Source Contig contig_364260
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_364260 (7772 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
		No map location
Predicted Genes from contig_364260

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_50669	1	575 bp	MLOC_50669.1	Available	Available	None
MLOC_50668	5	2568 bp	MLOC_50668.4	Available	Available	LOC_Os03g52430.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-85, 13103.m05711 protein mitochondrial carrier protein, putative, expressed
CDS Structure of MLOC_50669

CDS Structure of MLOC_50668

Contig Sequence (7772 bp)

>contig_364260 7772 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTACCCTTTGTGGGTTGTAGTCTCCATCAACGTGGACGNNNNNNNNNNNNNNNTATCGGA
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CCACAGTGCTATCCAACCAAACTTAATTCAGTCACATTAATCTTCTCAATCTGGATATGC
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TTAGTATTGGAAGCAGCTAGCCAGCTACTACACAGGATACGCTCCCGATCTGCCTTGCTT
TTACAACTGGTACTCTGATAAGCATGCATCACATGAGAGTCCACATCTTTGACACATCTT
TAAATTATTAATCACACACATGACCAGTACGCAAAAGAATCATGTATTACATGGGTAATT
GGGTAAATAATATAAATATAAATATAAAGAGATCAGAGAACAATGCTCGAGAAACAAAAA
AGAACCGTCTAGTCTAAGAGCAGGAGAGATTTGCTTGTGGCCACAGAGGTACGAACATCA
CGAGCTCGTGACCACAGAACGGACATGGGCTGAGAGTGAGGATCTCCACTACCTGGCCAT
ATTGAAAGGATGAAGCCATGGAGATGGTGGAGAGCTAGGTGAGAAAGGGGCTGTGGATGT
TGAAGACGGTTGGATTAACAGCGGGTAGATATCGGCTGGCAGGTGTAAAGGTGTGGGAGT
TAATGCAAAGCATGTCCTCTCACCATGGCATGGATGCGTTGGTCCACCATGCAATGTATG
TTGTCTGTCCATGATGTGCCTCTTGAGGGGCCGCTGGAGAGCAGGGCAACTTCCATATTC
AAGACCAGCGTAGACATGTGCCATGGTAGAGACGGAGGAGACCAATATAAATATAGAATA
CAAGCCAAATACATCGGTTGGAGCGAATCTCGAGAGCATTGTTCGGTGCAGATATCAGGT
CCATATGCGCTTGGGAGCTGAATCTAGTTTCCATGCTAGTTTATGTCTATACTAGTTTCA
ATTCTATACTCGCCTGCCCCTTCGCGCGGCAG