| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_358051
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_50291 |
2 |
2326 bp |
MLOC_50291.1 |
Available |
Available |
LOC_Os10g38030.1, FRAME:-2, EVALUE:1e-170, 13110.m03467 protein per1-like family protein, putative, expressed |
| MLOC_50290 |
3 |
1324 bp |
MLOC_50290.1 |
Available |
Available |
LOC_Os03g02680.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13103.m00235 protein cyclin-dependent kinase A-1, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_50291
CDS Structure of MLOC_50290
Contig Sequence (11671 bp)
>contig_358051 11671 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTTCGTAAACCATCCATTATCCGAAGTTATCCCCCCCCCGCCGCTGCCGCTCTCCCCCG
CCTCTCCTCCCCGTGATCCGCCTCCCTTCCCCCGCTCCCTCCTCTCCCCCTCTCATCCAC
CCATTTCCCACGCCCGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCCCGCCGGAGCATTGGACGCCCGCC
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GCCATCCGCGAGATCTCGCTCCTCAAGGAGATGCAGCACCGCAACATCGTCAAGTGCGTC
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GGATTACTTTAGAGGTACCGTGTACCTACATTGCTATGGTAAGATTAGACTTCGATTAGT
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GGTAGGTTTGTTACTATAAATGATTGGCAGTGTGGCACCACTACTATCACCTCAGTGCTG
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TGCACACATAACTGGCACTATGTCCTTCAACTAACACTTCTGACAGCCATGGCCTATGGT
CTTTGGATCAAAGTAGTTGGTGCATTTCTTGACATATTATTTTCTGATTAGTATTACCTG
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TATTCTTCTGTTTTTGTTCCTTCTTTCAAGCATATTCATGTCTGACTCAGAGATACGCTT
GTCTGTATTGCGTGCGCACTAGTTCGTTGTTGAACTTGTTGCACTGAATGTCTATATGCG
CATGTGATGTTTGGGCATGTATGTATGTTTGCTTTAGAGTTACACTGTACCTACATTGTT
GTGGTAAGATTAGATTTATTCTTGAACTAGCTATATTTCTGTTCTAACAGATGTTAAAAT
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CTCCTCAAATTTGATGTACTGTACAACATTCATTGCTCTACGGTAACTCCTGCAAGCTGT
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GTTGCTGTCTTTGTGTAACTACTTACTGCACACAGAACTGGCACTGTGTTCTTCAACTTT
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TAGAATGAGTGCAAGCGCTACACCCTATTTTGCTGTTATTGCACCTTCATTCGAGCATAT
TCATGTTTGACTCAGAAAATGCATTAACTTATTCTGGTTGCATCTTGGTATGCGAGTATG
TGACTGTTTTCTTCTTTGTCCAGTCATACCTCTATCAGATACTCCGTGGCGTTGCTTATT
GTCATTCTCATAGAGTTCTTCATCGAGATTTGAAACCTCAGAATTTATTGATAGACCGGC
GTACTAATGCACTGAAGCTTGCAGACTTTGGTTTAGCAAGGGCATTTGGAATTCCTGTCC
GTACATTTACTCATGAGGTACTTTTCTTCCATGACTCATTTTCAAGGGCCATGAAAACTG
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CTAGTATGTACATTTTTGCATCTAAACAAGCTCATACTTCTTCTATCTATCCAACTTCAT
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ACAGAGCTCCAGAAATCCTTCTTGGAGCGAGGCAGTATTCCACACCAGTTGACGTGTGGT
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AGATTGATGAATTATTTAAGATCTTCAGGTTTGGTTATTGCCCTGGTACTCAATTTCTCA
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CTCAGGGTGCTTGGCACTCCAAATGAACAAACCTGGCCAGGTGTGAGCTCCTTGCCTGAC
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TTAGACATTTGTGGTAAGTAGGCGTTTATGATGTGCTATATATCATGTTACTAATATTCC
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TGGCCTCGACCTTCTCTCTGTAAGTTAACCAGATAGCCGTCTACGATCATGGACTTGGCA
TGATGTAATCTAACTGTATCATCCTCTTGTTTCTTTGCAGAAAATGCTTCGGTTCGAGCC
AAATAAGAGGATCACGGCCAGGCAGGCTCTTGAGCACGAGTACTTCAAGGATATGGAGAT
GGTACAGTGAGCTGGCTGTGTGGTAGTGACTGGCATATGTATGAGCTGAGCTGCTCGTTT
CATTCCTTTTGCGAGACAAGCCTTCCCCTTTTCGGCATTTTTGTCTGTCAACTGAATATT
TCAGATCTGGTGTGTTTGAGGTGTGCTCAGGATTTGCTGCTAAATAGATTACCATCTTGG
TCTCTATTTGTTCAAAGTAAATATTGTCATGCGTTCATCTTTCAATGAGGCATCCATTCT
TTTGCTCCTCTCTTTTTAGTTTGCTTGTTTGCTCAACCCTTTGATTTGTAGAATTTAAAA
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ACAGGGAAAATCTTTGAGGATTCTAGTCCTCCATAATTCATATGAAATTCCTTTAAATCC
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ATTTACAGTGATCTAAATGCTCTTTTATTTCTTTACAGAGGATGTCGTTCAGTACTAAGG
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GAGACCGTTTATCTAAACGGTCTTATATCGGTTCCAATGTGATCTAAATGATCTTATATT
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AGAAAATTCAAAAAAATCTGAAATTTTGGGATATGAAACCCGTTGCATACACGTGTTCAA
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AGAATTTTTTTTGAATGTAACGTATGTTGGACCGTAATTTGTACGCCGCGGATACAAGGG
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GGGGTGTGTGGCACCCGAGAGCTGCAATGCATTTTTCACGGAGGGAGTACCATCTTAATC
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GTGCAGCTAAAAGAGATGAACACAAACCTATCACACACTCAATTGGCTTTTAAATGAGAG
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CAGCCCACACCGTCCACAGGAGGAGCTGAGCCACGCTAATAACAGTGCAAACCTTCATGT
TGAGGCCTGCAGATTCAGAAGATCAGGGCAGTGAAGTCTTTAATTTCCAGCACTACCACC
ATGAAGCACCGATCTCAGAATTTGAACAGTGCATCTAGTTTCTCTCTACGGTCATGGAGA
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AAAATGTGGGTCGTCACAAAAGCCAGAATTGGAGCTGCAACCATCACCCTTGAAGCTTCG
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GCTGATGACAGGTACAGCTTTTCTGTCCAAGCAGTATCACTGTAATAGAGATGGCCAAGC
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TGCCATAATCCGGTGTATTCATAGTATGTCGCGTGGGTTTCTGGCCTAAGAGGCAGCTTG
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AGATGAGAAACAAAGTGTAAGTGATAAAGAGTAACATGGAGGTACAGCTACCTGAAACAC
AGAAGCCCGTTTGAGGGGCCATTTGCCATGATACTTGACGGGCCCCAGCCCAAGCTCTTC
CCTTTCCTGTTCTCTTTCCATCATACAATGGTATCGGCATTCGCTGTTGCAGTTCCACTC
CTTCCACTGCAAGTACAATGGCTCGTGCGCGTACCATGATTTGTCAGCAGGCTGATCTTC
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AGGAGCTTTCGCCCGACCGTCGTCGCTGCCATCTCTCTCAATTACTGAATTCGAAATCTG
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AAAACTAGTTGGAGCTGCAGTTCCCCAGAAACCACAGTAGCATCGATGTTAATCAACGAG
TCAACAGTGCTGCGAGTACTAATAGTCTAGTAGAAAGAAGAATAGGAGAGCTGGGTGCTA
GTAGTAGCACGGAGCTCCCACCCCATTACCTGTCCGCGAGAAGGAGACTGTTGTAGTACC
GTAGGCAATCGGCGGCATCAGAGACGAGCGACCGACCAAGCAAGCCAGCCACACCACACG
CAAGGAGCAGGAACCGCCCCAACTACCAACCAACGAGGAAACAAATCTCGGGGAGGAAGT
CTGACCTGTAGAGCGGATCGGCGTCGCCGTCGTCCGCCGCAGCCAAGGCCGTGGCCACGA
GTCCGAGAAGCAGAAGCATCAGCAGCAGCAGAAGCAGCGGAGGCCCTCCCCTCCTGCGGA
ACCCCATCTCCGCCTCCCCTCGGCGCGGCTCCGAATCAGGCGGGCGGAGCAGCAAGCAGC
AGGAGGAAGCAGCTACAGGGATAGGGAGAGCGGGGCGGGGCGGAGATCCATGAATCCACG
GGAGGCGGAGCCGGGGAGGGGATGGGGGTGATTGGTTGGTTGGCTGGTTGATTGACTCGC
GAGGCGCTGTGCTCCGCGTGTGTGGGGGGGAGCGAATCGACACGGAGGACGATTAGACGG
AAGAGGCGAGCGAGCGATGGCAACAGGTTTTGTTCGGGATATTTGCTTGAGTTCCGTCCG
CTGGCCTTTGTCTTTGTGGATGGATGGACGGACGGACGGACGTGCGTGCGCCGTGGTGTG
TCAGGATTTGTTGCTGGCGGTGATTGGGGCCGCCCACGAGACCGGCGAGCGCAAGATAAA
CAAACGCGCTGACAAGCGCGGATCGAGGGGATCCCGGGCACGCCGCGCCTCGTGTTCTGC
TGTGATTCCACTTCCACATGCCCCGTCCTTCGGGCTCTAGTTGTACTCCATCTTAAAATT
AATTAACTTAGAAAAACCAAAAACAAATGTTTGCCCCAGCTTGTCCCCTCGGCAACAACG
TTAGGATATGCCCATAATCCAGTGCCTAGAACCAGTTCTTTTTCGTGCATGTTCACCGAT
AATCATCATACGAGTCCTATGATCAGAGGTTGGACCATGTCACCGCAACCATGCACACGT
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CTCCACACTGCCAGGGGTGACATGCGCCCTAGGCCACATGGCCCTCTGTTCACCGCCTTT
AATTTTCTTTGCTTTGTTCCCGCCACAACAAATTATGTTCCGAGAAGATCCAACCCTGTC
GGAGGGGGATCCATCACCGAAGACTTTTTCATCAGCCTTGATGCATACATTATCATGTGT
GAGTAGTTCCTTTAGGACCTTAGGTCCATAGCAGTAGCTAGATGACATTCTCTCTCTTGT
TCTTCAATACCACGTTTTCATGAGCTAGCTTGCATGATCAGGATTTTTCTAATGTAATCG
GTGGTGTGTTTGTTGGGATATGATGAATTGTCGCTTTATGATCAGATTGTTTAGTGAAAA
GGTTGATATGATTATGTATTTGCTTACTACCAAACAAGCTTATGTGGATCTTAATGATGT
TCTTTTAGCCTCTTTAATTGAGCAAAATAAGGATACTGTTGGTGTTAATTTTGCTTCAAG
GAATAGTTTAACAACATTGCATATAGGGGTAATTTTGGGAACAATCCTAGGCCATATCCA
AATAATTCTGCAAATGCTTAAGGTATTTTAATGGAAATTCCTACAATAATATTGGTAACA
TAACTACTGATCTTGAACATGTCACTAAATATTTCATTGATTTTCAAATAGCTTTTAATG
TTATGATAGGAGAATAATTTGGAAAACTACATTCTATTGGTAGAACTGTTGATAGTCTCG
AGCATGCGGCTGATATGCTTAAAATAAAATGTCTCCCACCTAATAAATATGAAATTACTG
AACATTTAAAAGAAATCCAAGTGTATATTGACTATAATACTAAGATGATTGTTATGCTTA
GAGCTAGACATGAAAGAGAAGAGAGAAGGTGAAATCCACTCTATTAGTAATGATGAGGAC
CTTAAAACTCTAGGTGTGTCACGTGATGACCCACAAGTATAGGGNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGAGGAGCAGAAGGCTCTGATAGATGGATTTCA
GCAAGCGAATAACTGCAAGCACTGAAAGTAG
