Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_355534 (2187 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_355534

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_50159 2 674 bp MLOC_50159.2 Available Available None
MLOC_50158 2 892 bp MLOC_50158.2 Available Available None





CDS Structure of MLOC_50159






CDS Structure of MLOC_50158






Contig Sequence (2187 bp)

>contig_355534 2187 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATATATATATGTATATATATATTACAACCGGCCACGACTCCAAATAAAGCCCAACGCAC
TTAGTCTCTTATCGAGCCCGACCCAAGTTGGCTTTACGATTAATCTAGGTCATTCCATGT
CCCATTCTCCCCTATTCTACTCGATCCTATATGCTCCCACGCCGGCTGCCGCCCGCCGCC
CCTCGACCGATCTACACCCCGAAGCGTCGCCACACACCCTCCCCTGCTATCCACTATCCT
GGAACGCCGCCCCACACCAGATCCATGCGACCCTTTATCCCGGTGCGCCGCCCCTCGTCA
ACACTCCCCTACAACCCTGCTTTTGTGGTGCGCCATTCCTCGTCACTGCTCCCCTACAAC
CAACTGCGTCTATTACTTCTACACGGGGTCATGCGGCTATGGGGAGAGTTGCCGCTACAA
CCACCCTCGCGGTCAAGCCGTCGTGGTGAGCCGGACAACTCCTCTTCTCCCAATTTTATT
ACTCCATCTTGCTTTGCTTGACTTATGACTTCCAGTCCCTGATGATGACCAACAGGTTGA
ATTAGAGCTGGTTGGTGTGAAGGGGAGATTCCAGCTGAAGCCTCTTGTTGTGACTGAATT
GATTCAGGTATGGCTTAGGAGCCTGTCCAAGAAAATGGAAGTGAAAGTTGTGCAGTCGTT
GGTCGTCGTTGGTTATGTGATTGACTGATTGTATAGTAAAGCTTGTTGTCTTAGTCTCGT
GGTTGACGTTGATGATTCAAATTCCCACCTTCTGCTTACGTGCCAAGGTTTAGGCCTGAT
CGGTCACTCTGTCATACGGTCATATTTCTGTTGGGAAAATCTTGTTTTTACTACAGTATT
ACAACTCAACTAGGTAGTCATGCTCACTTGTTCCAGTGAGTTGTAGAAGTGAAAACATTC
GCGACTATTGTACGATGTTTGTTAGTTGTTACGCAATGGGCTCTCTTCTTTCTAATCAAA
TATGCTTGGTGGACTAATCTGTCGCATTGCCCTGCCTCCACCCATGGTGTAAGCACTAGG
TCTACTAAATTGCATGCATAACAGTAGCCTAATTCACTTGGATGTGTGATGCTTGAGTTT
GTGTGCCAATGCCTACATGTGTGCAGGTCCACGATTAGTTTAATATCAGCATGGTGGCTA
TTTCCTTATACTTAGCAGTTTATATAATTATATACATACATATAGTCAGCCGGTGTGATG
CATGTGCGAAAGCAAAAGCTCTTAGCATAAAAATTATGATGATCCTTAAAGTTTAGATTT
TTTTTCTGTATATTTCTTAATATTTTGAGGTACATCTCAAATTATAATTATTTATGCAAT
TTATAAAAATGTTGTCACTACGTATCAGAGAAAACATATGTTGTTCTATTGTATTTGCAG
CACACAAATTATTGCGGTTTCTTTTGAGTTACAAAGAAAACAAATGTTTACTTGAGCTAA
TTAGTACTATGTACCAGTGCAGGTATGTGGCATGCAAGCAGAGCAAAGGATGAACTTAAT
AATTACCAAATCTACCTCATTTGATCTGATAAGGTCAGTGTCTTCATAGTTTGTTTCGTT
AAATGTGAAAATATATGGGCCATCAGGCATACTTAGTGTTTTCTATGATCATATTGACAC
TTTAAAACTTAGATCTAATTTATTGCAATTTCTAATGACATATGAATCTTTTTGCCTATG
GTCTATAATTCTAAGAAATTGCTCACCAAACATTTTCAGTGTCTTCTCCTAACTACATCA
GACCAACACCACCGTCATGAGAATGAGTGTGCCAATTAGAAGCTGGTGGACATTGTCTTG
GCTTAACTCATGAATAACAATGTTTTGAGGCTTTAAGAATGCTTCCGTTGAGGAAGGACA
AATACATCAATAATTATATGTGGTGGTGATAATTTAATAGGTCATGTAGAAGGTTAGCCA
AAATAATTTTATGGCTTCGTTAATTAAGATCCTAGCCAGCGCTGGCAACACACAGGCATG
CATGTTAACCCGTCGTGGCAAGAATACAAATTGCTTGCCAACCTCTCAATTAACCATCCT
TCTAGCCTTACCTAGCACTCGTGGAAGAATTATTTGTTCCATGCAGAAGTATTTATGGAA
AGAAGTTTGCACATGTCGATTTCATCTCTCTTCTTTCTCCTACAACTTCGCATTTTATCC
CATTATTGTGCTAGAGTTTTCTACCAT