| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_353527
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_50053 |
2 |
1134 bp |
AK355131 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_50053
Contig Sequence (4777 bp)
>contig_353527 4777 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAATTACTACTACGTTCCCCAACACGCTTTTCTTGTCCGCTTCGCCAGGACATGCGCGTC
TGACCATCGCACGCGGATCTCTCTTGGGATTGGGGCTCCGAGATCCTCTCCGTGAGCACC
TGGCCCCGCGGCTCCCTGAGGATTTTTTTTGCATAGGTTACGTCCGCTCATAACGCACCA
GGATCTCCTACAGCTTCTCCTGGATCTCCTACATCAGATGTGCATGTTATCACACCTCCG
CGTACACGGCTGCAACAGGGAGTTATCAATCGTATCAACTATAAAAATGTTTCTAAGTTT
GGTTTGGCATGTTTATCTCGTGAACCTAAGAATTTAAGTGAAGCTTTTAGTGACACTCAG
TGGAAACAAGCAATGGAAGAGGAGTATTCATCCCTTCAAAATAATAAAACGTGGCATCTG
GTTCCCCGGCAAGGAGGTAAAAATTTGATTGACTGCAAATGGGTTTATAGAATTAAAAGG
AATCAGATGGCACTCTTGATCGTTATAAAGAAAGGCTAGTTGCAAAAGGATTTAAACAAC
GCTATGGCATTGACTATGAGGACACCTTCAGTCCAGTTGTTAAAGCTGCATCTATTCGCC
TTGTGTTATCCATTCTTGTTTCCAAGGGATGGAGTATGAGACAGCTAGACATGCAAAATG
CCTTTCTTCATGGTGTTTTGGAAGAGGGAGTGTATATGAAACAACCTCCCAGGTTTGAAG
ATAAAAATGCACCCTTTCATGTTTGTAAGCTTGAAAAGTCTTTATATGGGTTTAAGCAAG
CTCCGAGAGCATGGTGCTCTCGATTAAGTACAAAGTTGCACATACTAGGGTTTGTCCCAT
CAAAGTCTGATACTTCATTATTCACTTACAACAAGTTCAAAACTCTTATCTTTGTTCTCA
TATATGTTGATGATATTATTGTGACAAGTTCATCAAATGAGGCAATAACAGGACTGTTGA
AAGATTTAAGTTTAGAGTTTGCTCTAAAGTATTTAGGGGGCTTGCATTTCTTTTTGCGCA
TTGAAGTTAAGAAAACCAGGGATGGTCTTCAATTGTCAGAGGGAAAATATGTTAATGATC
TGTTAAGCAGAGTTGGTATGAAAGATTGCAAGCCATCATCGACACCTTTATCCAGCTCTG
AATCATTAACCTTGGTTGAAGGAGAACTGCTTAATCAGGAAGATAGTACCAGTTACAGAA
GTATAGTTGGTGCACTTCACTACTTAACTTTGACTCGACCTCATATTTCCTTTGGAGCGA
ATAAAGTCTATCAGTTTCTGCATGCACCCACTACTCCCATTGGAGAGCAGCAAAACGTAT
TCTGAGGTATGTGAAGAGTACAATGAATCTTGGTTTGAGTTTTAGCATATCTTTTTCAAC
TCACATTAGTGCCTTCTCTGATGTGGATTGGGCTGGTTGCCTTGATGATAGAGGATCAAC
TGATGGGTTTGTTGTCTTCTATGGACCAAATTTAATTTCATGGTATGCAAAGAAACAAGC
AACAGTTTCCATGTCAAGTACAGAAGCAGAATACAAGGCGTTAGCAAATGCAACAGCTGA
AGTCATTTGGGTCTAGTGTGTGTTAAAGGAACTTGGTGTTCCACAAGATCAACCTCTTTG
TCTTTGATGTGATAATCTTAGTGCAACTTACTTATCTGCTAATCAAGTGTTTCATGCAAG
AACTAAACACATTGAGATAGACTTTTACTTTGTGAGAGAATAAGTTGCAAACAAACAACT
AGAGATCAGATTTATTCCCTGCTTGCAGGTGGATTTACAAAAGCATTGCCAGTCAGAAGC
TTGAAAAAGTTTAAACGTAATCTCAATTGTGTCAAACATAACATATGTGTGCATGTTGGT
TTGTAACGTGTGCCCTCTCCTTTCTTCTTATACAAGTCATAGAGATAGATAGATAGATAG
AGTCATTTTAAGTTTCTACCATTTCTTTTGTTTCTATCTTCTGTAAACCAACCTACTATG
TATCGTACGAGGAATCTCCCCTCTCAATCAATCAATATATACCGTGCGGGCTCTTCTATT
AGAGAGTTGAGACGCTTTATTCAATCTTACATGTCACCGTTGTCATTGCGAAATGTTCAA
TTGCCCGCAGTGACCCTGTTGTGATCGAAAACTGATTTGCCCCTCTTAATCATCAGGCGA
ATCTTTTGCCTTCGTTTTTAAAAAAGAAAACTGATTTGCATGAGGTTGGGGAAGCAGCAA
GAGCCCCACGCGGTGATCCAGGCTTTGTGCATGATCTTTTTACCCGACGGTCGTGTCGTA
CTTGGTGGTAAACGAAAATATGTTTCCAGCAATAACAACGTTTCTTATTCTCTTATCATC
TCTGTACAAACAGCACATTGAGTTCGTTCTTCTTGGTCTTCCATTGAAACGCACAAGTCA
GACGAGGCGATCCTAGATTCAAATTCTCTTATCATCTCGGCGGCTTCCATTCAAACGAGT
TTTAAATAACTGCTCAACACACTTCATAGACCTGCACAACACACTTATAATAGATCCAAA
TTAAGAATAGGGAGTACATAACTGCTAAGTACAGTACATATGATATTCCCAAAAAAAAAA
CAGTACAGTACATATGAAACACATAGCCAGCTCATTGCAAGGCTCTACAACAGAGAGGTA
ACCACCTGATCGGAAGATTTTACGTGATGAAACTTCCAGCACCGCAAGGCACACAGAAAG
AAACGTCTTAGTTTGCCTTCGGAACATGCACGTTATGCGACAACGTCTCAAGAAACAATG
GCGACGTCTCAAGATTTGCTTCATCACAAGAAGCGGCGCCAAAATCATCGAGATGGCGAC
CAAAGGCCGGTTGAACCAAGTCAAGTCAGGAAGGAACCCATTTAGGTAACTAGGTCAGTA
ATATTTCACCCTTCACCCCAGACAAGCTTGAAGATATTTCTGCTAGCCCCTGCGTTCACC
ATCTTGCTCTTCATGTTCAGCATCTTCTCTTGGGCAGGGCTATCGCCATCCTTATAACAT
TACAGCAACAAGTTTTAGTCCAAACACCATGTTATAAACCATCTAGCTACAATAGAAGCA
ATATTAGTACCCTTTCCCTTTGGCTGGGCATTCTCACCACTGAGTTCAACAAAGTGCTGC
AAGTATATTAATTTAAAAGAATACAGCTAGCTAACCATGATGAACATCGTAGAGACTTAA
ATTTAAAGGGGAAAGGAGGACTACTCACAAGCATGGAGTATGCCCGAGCAAGTGAGACAA
GTGTCGGGTAGAGCTCTATAACTGCAATTGCGGTTTCTTCTGTCACCTGTGGTACCTGCA
TTGCACGAGAAATTGATGGAATAAATCTTGCACCAAATTAGGCCACCAAATGAATTAGCA
GTAGCAGCACTTATTTGGTGAAGGTGGCTTTTATTGAGCAGATACCTGCATAAGTTGAAG
GGCGAATATGTCGCTCACAGTTAACTTCTTGGGGTCACAACACTTCTTCACAAACTCGTC
ATAAGTTAAGCAAACTCGACTAGTGTTAGCACCGATTGAGAATTTCATGCTGTAGTAATC
AATTATCGAAAGTGTCAGGTGGCCGTATGTCCTTTCAGTATCAGAATACCCGGTGGTTCT
TTGAACATCAAATCCTTCAAGAATCTCACTTGTGAAGCAGCTGAAATTTAAAGACATGGA
ACAGTTTAAAGGCTGTACACCTTATTACCCCAGGTATCTAACTGACCACTAGATGTATTA
TTATCAACGAGGAGAGCACTAAAAGTTTTAACAGAAGTCTATGCAGGGATAATTTGATCC
CAAGGTTACATGAGCAGTATACATACGCTGTTTTGATGCTCTCTGATGCGCCTAAAGGGT
TTGGATCACCTTCAACCAGATATATCAGCTTTCTTAGTCCACATTTCTACAAGATACAAG
AAACGGAAGCATCACATGATATTGTTGCTAAATGCACAAAATATGCTACTCCCTCCATCC
AAATATAATGGGACTAATACATTTTTTAAGGTAGACAACGAATTAGAGCAATAATATATG
GCATGCATATTGCACAAAAAATACCACCAAATTCGTATGTGAAAGGAGTTTCTAATGATA
TAATTTTCATATCATACATCTTATATATTGTTAATAATATTATCAATGGTTAAAGGCAAC
CTCGAAAAACGTATTTAGGCCCTATATATTTGGATGGAGGGAGTAGCCTAAATTAGTAAG
AGCAACTCCAACCGGGCCACCAATTTCGTCCACGCACGTCTGTTTGGGTCACTGCGGACA
AAAAACACGGCCCGACGCGCCGGCCCAAACGGATGCGTGTTTGTTTTTTGTCCGCCCGCG
ACCCATTCTAGGCTCAAATTTGGGACGGATTTGCGTCGGCGCGGACACGGGACAGACGCC
CGTGTCACCCACCCTTCTCTTCCCCTGGCCCGCCAGTCAGTGACACGTAAGCCATTCTCC
TCTTTCCCTTCCCCTCCAACGCTCCCGCCCGCCCCGCCTCCCACTCCTGCAGCCGACTTC
CGCCATTGCCGCCAACCAACCGCCTATAGACTCATCCTCCCGGCAGCCTCATCTCCCGCC
GCCGCCCAGTTCTGCTACTTTGTCTCGGTGGGGCGTGAGGCTCCTCACCGGCCGGATTCT
TCCAGGACGCCCACAAGTTGTTCGACGCTTTGCCCGCAAGGTACAAATGGACTCCGACGA
TGAGTTTTGTTTACAACATTCTTTGTGATTTGGATGATTCTTATTCCGACGATGAGGAGA
TCATGGCAGCCGCGTTGGTCGTCCATGACCACCTTAG
