Map Locations of contig_315309 (6921 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_315309

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_47961 6 2555 bp MLOC_47961.2 Available Available LOC_Os03g61560.1, FRAME:-3, EVALUE:4e-59, 13103.m06778 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_47961






Contig Sequence (6921 bp)

>contig_315309 6921 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCCATGAAAGAAACAAGTAAGATACTCTTCTAAAAAACTATTGCCCATGTTGGTTATAA
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TTACCAAGACCTGAAGGTATACTTATGCAACCTAATACATCAGAAATCATATAGGCAGAT
TTTCATACTGGAAACCCAATCATTGCTACTAAAATGGTAAACATAGATGAATGGCCCTAA
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CTTACTGCATAACATGAATGGCAGTACATGTTGAATTAGTCACAAATCAGCCCCATATTA
CCGGTGTGACCATCTAATAGATGTATCTCTAATATGTGAATGTGTATATGCATGACAAAA
GATGTATCCACATAAACATAGGCTCACACATGATGGAAATTTTGTGATTCTCCAACAATT
CTGTATATAAATATCAAGCAAGAAAGATGTGCTCTTTAGGAAGCTGAAGTTTGCCATGTC
ATCCGTAGAAGGATTATACATATATACTTGCGACTTGAGAAAGGTCATTTATTTCGATAC
CATATGTGGAAACAACTGAAACATTAGGCAAACACCAAACACATGGTACATCTACAACCG
CAAGTGTACTTATCTACATCTTACTTTCAAGTTTCAAGTACCATTAGTCAAACAAACAAT
TTAAAGCTTTGTCAGATCACAAATATTGACTCGAACGCATCTATTTCTTCCAATTTCGGT
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GTAGACTAGACACTAATGCTCTAACCTACTCGTGAGTTCTTTGCTAGATGTGAGCCACAT
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GTTGCAACTCGTATTTTGCAAGATCCTTCACCCTGGAATCTGGAGATTCCAAATATGCAG
CCACCACCCTGGAGCTGCAGCAACCAACAAGTTCAAAGGAATATCAGCACATGATTCCTT
TGTTTTTCCTTCAAAATAGCACATAAGCAGTGCAGTGTGCTATGTAAATTGCAACCAACA
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ACATCGTATGGGTTTCAACACTAGACTACCCCTAATTGTTTGGGACTGAAAGGCTTTTTT
GTTGTTGTTGCATTTGCATGGTTCACAAATTTGATGGAACAGATTAAAGAACTGACATAT
CGATGATGAGTCATTTTGAGGTACCTGAATCCTTCTGCATATAACTTGCATTTCCCTTTG
AGGGCTTTTTTCCAGAGGGTAGCAGCAAATGCAGGACAATCAAGTATAATTCTTCTGATT
AAGTGGCTAGGGTAGTCATCAAAGGCGTGCTCATCAACATAATCTGTCCTCGGGCGCGCT
GCGTCACAAGCTATAGCATTGTGAAGTACGTGGATCCTGTCAGTGACTCCCTCCAAGAAG
TTATTTTTTCCACCTACAGCTACCTTGGAAAATGGCAATTCAGAACCTCCATAAGCGAAA
CAGCAGTACCTCTTGTAAAGCAAAAAATGTGCAATCCTGACGCTCTTCCATAGTTGATTA
CTCATTTGTATTAACCGTAGACCATAGACAAAGGAGGTTACCTCATATAGTACATCTTTG
CCAAAGTTTGTTCGAAGTAACTCTCCAACATTTTCAATGCAAGTCTCAATGAGAACCTGC
AAAGGAAAAAAGGACACCTGCATTATTGCTGGGATTAGGGGTTACATGACTGAAAGCATA
GTTATGTTGGTATCAGGGGTGTTACGTGACTGATGGGAGCTTAGTAATGTTGCGACTAGG
TATTCTTTGACAAATGGTCACCCTTAAATGATAGTATATATTACACTGCTATGAGAATAA
ATGTAGATCTCTTGAGGGGAGAAGTACATTTTTCCAAGAGAAATGCCATTTAATAAATAA
ATCAAAAGTTAAATACATGTTTTGAGTATCACCTCATAAAGCTCGCTTCTCACCAACAGT
TCCTGCCGCCATTTAATCGGGTCCTTCTTGCTATCAGATGCAACCAGTGTGTCTTCTGAA
CCCCCATATGCTTTGGCAGCCACATCATCCAACTCACTATCCAAGTTAACCTGAAACAAA
CAAACAAAAACAAATTTCAGG