| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location |  |
 |
Predicted Genes from contig_298833
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_46985 |
1 |
1525 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os05g08960.2, FRAME:+3, EVALUE:7e-34, 13105.m00994 protein ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_46985
Contig Sequence (2163 bp)
>contig_298833 2163 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGATATTTTAAACACTGCATACAACCACGAGCTTGTGGGGTAGTAGGGGAATCAGCCAG
TTAAACGTCTGCTCGCTGACCCACTGAGCAGGGATTAATCGGCTAGTTGACTGATTATTG
GCCGATATTTTAAACACTGCATACAACAACGAGCTTGTTGGCCTGGGTATTTGATACAAT
GACATGTGGAAATGTGGATTTAGTTTAGTTTTCCAATGTTAACAAGCAAAATTAGTGAAA
TGTCCACCTACTAAGATTTCTCTGGGTCTGTGGACAGATAGTTTGGCCTTGATGGTCTTA
TAGAACTAATGATCAGGTTTTTGATGATTTTTTGGCAGTTAGGCATTTTTTGCTGGTGTA
ATCAGTTATCCACCAATAAAAATCACAACCATATACCTTATACATCAGTTTCATTTCTGA
TCCCTCTCGTCTGAAGATATATCTTTCCAGTTTTTATTTTCTGAAATTTGTATCTTTTCA
GCTTTGATTGGCTGGATAAATTTAACCCGGTTACGGAGATACGAATCTCTACCTCTAGTC
AAGAGTTTTTGCTGAATATTCGCTTTCAACATTAGTGTCAAGAATTCTTCCGATTAACCA
GTTAACTTGTCGATTAATCCTTACTCCTTGGGTCACCGAGTAGCCGATTAACTGATAAAT
CGCCCAATTAACTGATTTAATGGCCGATTAACTTGCTGATTAGCCTATTAATCCCCTACT
CGCTAGCCAACCGAGCAGCTATCAGTTAACGATTTCCTCAACAATGATGTTTAGTTATGC
TTATGGAAGTTGTTCTATTTAAATTGTCTATATTAATTTACCTTTTGTACCTACATTCTG
TAACACTGCTGTCTTGCGTGGGTAACATTTTGACAAATCATCTGTTGTCAGACAGTAATC
CATACTTCCCTATGGTTAATAACTACGTGAAGAGCCACGTGGCACATATGATTAGCTTAC
TCTGATTTTGTATGGATGAACATCAGAAACCATGAAAGCTCTGCTTACTTCTATCATGAG
AAATCCTCTATGCGTGCATTGTTGTTATATGACATTTCTTGATTTTGCATGTTGAGTTTA
ATGTTTTGGTTTTGTAGTTTTTCAACTGCCTTAAATCATCTATTGCAAAAATTATGAATA
CATGTGAAAATTTCAGTTCCTATCATGGTCATCATCAATCCATTTGCATTGCCACACAGC
AATTCTTCATTATATAAGACAACCCAAAAGTCTCAAGTAGTTTGCGTTGCATATTTCCAT
TGCTGCAGTTGAATTAATGCTATTATACTTTATAATATGATGGCACTGGAAATTCTACTG
ACAGTTTATCGTCTCACATATATAGGCACATTCAAGCTTACCTTGCAGTTTACAGAAGAT
TACCCCAACAAGCCGCCAACTGTTCGTTTTGTCTCTAGGGTGTTTCACCCAAATAGTAAT
CTCTCCCACTATGTATTTGTACCCATCTCTCTGATTACATATGACTCAGATACCTTCTTT
CTTACTGTCTATCCATCTCTCTTATTCCATGTGACTGGATACCTTTCATATCTTACTGAG
TAATTGTCATTATTCTAAATTGATGTTCGGGAGAAGTGGTTTAACATCTTGCTACATCTC
TGCAGTTTATGCAGATGGGAGCATCTGCTTGGATATTCTACAGAACCAGTGGAGCCCTAT
ATATGACGTTGCTGCCATATTGACTTCTATTCAGGTACCATTTTGATCAGACTAGTCAAA
CTTCATGTGTGATTCCCATCATAGTTGCCAGTAATCAGGGTCGCCTAGGTCGAGGAACGG
GGTCGCGGGTCGCGGGTCGACACCCCTCAGGAACGTGGTTCGATGAGGGGTATACATCTT
AGGGACGCTAATTCGGGACATGGATCGCGATCCAAAGGATTTCGGGTCGATGACCGCGGT
ACGATACATCCCGATGAAGTTGGAGGGAAAGAAAGATCTGCAACGATGTATTTCCTTATA
TTGCGGAGGTGCGAAATCCCGCCTGATACTACTTCATATCAGTCGCCTCGTGCAACGAGC
GCTCCAGACCGGCATCCTCCGGAGCCTCCACCCCCGTCGAGAGGTGCCGGCCATCTCGCT
ATACGCCGATGATGTGATGCTGTTCTGTCACGCCACGACCAGCGAGGTCAGGGCCGTGAA
GGG
