Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_283419 (4366 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_283419

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_45945 4 995 bp MLOC_45945.3 Available Available LOC_Os04g24520.1, FRAME:-3, EVALUE:2e-16, 13104.m02295 protein ribosomal protein L51, putative, expressed
MLOC_45943 1 185 bp None Available Available None
MLOC_45944 1 213 bp MLOC_45944.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_45945






CDS Structure of MLOC_45943






CDS Structure of MLOC_45944






Contig Sequence (4366 bp)

>contig_283419 4366 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCTCGTGGCACCTGGGGTGTCCCCCCCCCCCCCGCGTGATCTCGCATTTTCGGGGCAG
ATCCCCCCCTACGGGGAGAATGACATGGGGGCCCAAGCCCCCTTAACAATAAAGAAAATT
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CTCATCTGAGTTCCTCCGCCTCTAGATCTGTCGGTATGTAATGGTGCCGTTGCCCTGCTC
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TAAAAAACGATCCGCTCCAGCCACTCCGCTCCCCCGGAGCTGGAAATAAGGAGCGACAGA
ATGTGAGCTCCGTAGAAATGCACTGCATGCCGCTCCGCTCAACTCAACGACGGAGCTGGG
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ACCAACGTCCCTACCCACCCGAGGTATGCTGCAGATGCAAGGCCTGTCTTAATTTTAACA
GAAATGATCCTGTCTTAGTTTTAACAGAAATGATCCATGCTGCTTCTAGCTAGCTAGTAG
TTGCCGTGACCTTTTGATGTTGCGTCAGAGTGAGTGAGCAACTTGGACTGTAGTTAGTGA
CAACAACTATGGTTTTGCCTCTAATAGCTAACAGACACTCTCTACCATTACTTAGAAATG
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GCAGGTTGATGTTGAAAACTTATAAAGCTCAAAAGACCGGAAGATACTGGCATAATGCAG
CCGGGGTATGCTAGATCATCATCCCAGCATCGTGTCCATGAAGAGAAATTTGAGGTGTCC
ACGTCGCACATACCACAAGTGTGGGCGTATAGCCTGTAGCAAGTTCTTGTGGACGTGAAT
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GATCCCACTTGCAGCCTGAGCTGCGTGATACACGTGGTGAGGGCAGCATTTGGGCAACAT
CAAAATTCTTTTCCACACCGACACATAAAGATGAAAATTCCTCCCATCTCACGTGCTCAA
AAATTTCGAGATGAACAATAGAGATCTCTGCAGAACCGTACAACCTCGCATGGATATCTG
GACATGTCCTAAGTCCCCGCTTGCAATATCTCGCAAGATAACAAGATCTGGTAGTTCCAA
TAGAAACATTTCACACTGCAAAGATGCAAGGGTTCCGAAGATCGATAGACCGGGGCAGAC
CCTCCGGGTAACGATGGATATCTCAGGTTTCTGGCAAAGATGGGATCGTGGGCTGCTTAC
CATAGCACGCCCAGAGCTGAGGCTCGACGCCGGAGCACTCGCGGATGAGTACGGGGAGGG
TGGGGTTGCGGGTCTTGATGTCACCATAGTTCTTCTTCATGAACTCCCTGCGAATCAGAT
CCCAAATCCAACACCACGACATGAGCGACGAATCAATTGCTGAGAGAAAAATGGGGAAAG
AGAAGCGGGTGCATGGGTCCTACCGGTTGGGTCCGCTTGCACGCGAGGACTGGTAGAAGA
GGAAACGGATCTCCTTCACGTTCCGGGATAGGCTCGCTCGCCATCATCGCACGCATACAT
CGGACCGGAGCGGCAGCAGCGACAAAGATGTCGGGACCCCGATCCT