| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_276725
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_45201 |
3 |
2599 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os07g29360.1, FRAME:+3, EVALUE:7e-37, 13107.m02945 protein tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed |
CDS Structure of MLOC_45201
Contig Sequence (2634 bp)
>contig_276725 2634 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCAGATGAATTAAGTTGCTAATTCATTCTTGCAGTACCA
AAACTGTGCACGGAAGTTCTTCTACAACACAGATGCAACTACACTCCTATACCTTTCCCG
AACACATTATGAAGCTGAGCAATGGCAAGACTGCCGGAAATCTTTGCTGAGAGCTATACA
TTTGGCTCCATCAAATTATTTATTACGGTTTAATGTTGGCGTTTCAATGCAGAAGTTTTC
TGCTTCTACTCTACAGAAGACGAAACGAACAGTTGATGAGGTCAGTACCGATACTTTTCT
TTGCCTGGTCTCTGATTCTTTGGTTTATGAAGTAAGAAAAAAAAGGTAATACCACCCAAA
TCTCCCTGGTTTTGGTATATACCATGTGTCTCATTTCAATATCCTGCAAACTCCACATTT
CTCTCCCTTATCCAGCTTTTCGTGGCGATCCACCATCCCTGTGCTTGTTTGTTTAGGGAG
AAGTCGTTTTTGGTTTGAAGGCTCATGGTGATACTGCTCCTTTTGGAGTGATAATTGGAC
TTATCAATTTTTGTGGAGAAGAATCCTGAGGCTGCATTCTCTTGTCCTTGATAATCTGGT
CTCGGTCCATGATATGCTTACCACCCAAGACCCTTTGGATCTATTCCACCTCCCTTTGTC
CAGCCAGGCTTTTGTTGAATTCCATGAGTTCAGAAATTTCCTGGCCAGCTTGCATCTTTT
CCTGTATGCTGCCAATTCTTGGTCCTTTTCATGGGGTTAACTTTCCAATCTTCAAAAATC
TACAAGGCTCATTTTCAGCACCTCCAAGCTCCATCCTCCGCCTCTTGGCATGGAATTCCA
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AGGACATGCTTCAACATCACCAGTTTAATCCCCCTGGGGGCTCCATTTGCTCTCTCTGCC
AATCTAACTCCTTTATAACTCGTGATCACCTCTTCTGGCTTTGTAGCTTCTCCTCATGCT
GGCACTGTCCCGGACTTTGCTTTGATATCCTTATTTCATCCATGGAGGAGATTGTTTCCC
AGGCGAAACTTATGATCAGCAAGCCTTTCCTTGAGGTTCTTGTGTTTGCAGCGTGGAATA
TCTGGAAGCAGAGAAATGCTAAAGTACCTGACAGCATTACTCTTGGTACGTCCTCTTGGT
TTTCTAACTTCAAGAGGGGTCTCTTCTTTCTTACAGAATGAAGGATTAGCTTGCTGCCTC
TCTCAGACTCTGGCTGGATTGGCTTGATTCTAGCCCGAGCCCTTCTCTCTAGTTTCCCCT
TTGTACACCCCCTTCTCTAGTCCTATTATTAATAAAATTTACTGTCGGAGCCTCCAGATG
CCACCACTACCAAAACCTATATGAATCATCAGCACATCTCCCTCTATTTGTTTGGTTGGG
AGGCAGTATTCCACCCTGGATAAGCTCACTAAACTTGAAGGAATATCCCCAAGAAATGTT
TGACAGGCTCATCTCACCCATTTGACCAAATAAGCTCTCATCCATGCACAATTAATCATG
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TTCACACTTATGCTTAGTTTCCGGTTGTTGAATCATGTTGTCAACTTGTTCCTCAGTAAT
TTGTTGTGAGATAAATAGGCACATAAATAGGAAAACGCTGGTTAGCCAACCATAAAGATA
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TAGTGTTAACGTCTGCTGATTAGCGCATGATTACTGTTATTAATGAAAGTTAATGCCATA
TTTATTTAATTAATAACGTCCATCCATCCCAAACAAAATGCTGCACAATCTCATCCATCA
AACATGTGTCCCGACATGGAGTGTTTGTATTCCATCCTGAATTTTCAGGTTGTCCCATCC
CATTCAACCTGACCATGTCTAAACGCTACCTTGTGTGAACCACATGAGCCTGGTGTTGCA
TATCTAACTCACGGAGATTTAAGTAGCATCCGGTAAAAGTTGCCTGTTAAGATTTATACC
AAACTTTTCCATGCTAAAAGCTACGGCAGATAAGACTACTGCAATGTCTTGGCAATATAA
ATTGAATAGTCTCATCTACAGACATATTGGAGCATAGATCTGACCCTTATATGCTGAAAG
ATGGTATTATGAATTACAGGCTTACAGCTCTATTATGGGGAATAAAAGCCTCGTGGTACA
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ATGATCTACTCCCTCCTTTCCGGTTTATANNNNNNNAATCTGAAATCTCATCAACCAAGG
TAAATTGTGAGTGGATGACACTAGTTTTAACTAGCCAATGAAATATTTCTCACATATTCA
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TGGGACTCAAAGCACTTTAATCTGAAATTTTTGAGATGGGCCCTATAAACCGGA