Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_276411 (2639 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_276411

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_45128 3 2124 bp MLOC_45128.1 Available Available None
MLOC_45127 1 551 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_45128






CDS Structure of MLOC_45127






Contig Sequence (2639 bp)

>contig_276411 2639 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTAGCATTGCTCTTGCAATAGAGGCATACATATTCTATTGATTCTTTCATTCAACGCTC
GATGATAATTTTCACAATTAACGTCATTTTTTCAAACAGTGCTCGATGATCCTTTTCATA
GTAAACGTGATGCGTCCGTTTAAAGAATAATACTTTTCATAATTAATGTGATTCTTCCTT
TAAAGAAAGATACTTTTCATAATTAATGTAATTCTTCCATGTTTCATGATCCTTTTCATA
AATAATGTGACCCTTTCATTTAAAATATATACTTTTCATAATTAACGTGATCTTCTCGTA
CAATGCACTGTAATCTTTTTCATAAATTAATGTCCAGCTAAATAACATGTGTAATTAATT
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ATATTTTTTGGACATTAATGGTTGCGTGCAAAATGAACGAAATGGCTACGAACTCATTTT
TAGTAGTAGAGATATGCTGATTGTGCGATCGATCTCAAATTTATTTCGTTGTCGTGAAAC
TAATATGATCTACATATCAATTACCCTGCTCCACTGCCAAAAAAAAAACTAAAATATTAA
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GGCGCCCCGGCGGCCGTAAACAAATACCCAACATGAGAGGCGGCGGCTTGGTTTACGCGG
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ATCAACATGATAGTTTACAAAAGGGTCTTATATTATGGAACGGAGGGGCAGTTCTCAGCC
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GGAACAAGGAGCTCCTACCTAGAGGATCGTGCCGCCGGAGCAGCTACTATGGTCAACACG
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GTGAGGAAACTATAATAGATTTATGGATGTGCCATACCTTTACTGATAATACTGTCTTTT
GTCCCTAATTTGAGCCATTTCTTTGTTTTTTCTTCTATATCCATGCATGATGACTTACCT
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CCTTTTGCTTATAACAAAAATGACACTTTCATTTTGTCTTAACTAGGTAACTATCGGTGC
GTTACAACAGAATATAAATATTCTAGTATGTATTTTTAACATGGTACAAATGCATACGCT
CATACTTAAGCACATACACTCACCGCTATGAACGCAGACACGCATAACCTATCTATGTGG
ACACCTTTAAGAAATTGAGCCAGCGTATAGTCGCCATGGACGCCTTTGTAGTCGACATAA
ACTTCTTCTCCCACCAAACGCACATTATCGAAAAACCTGAAATAAATTCAAGAAAATGCG
ACCACAAAAGGGACTTGAGCCTTGGTGGGTTCGTTCCACAACAAGAAATCTAACCATCTG
AGTTACGTTAAGTTTGCAATATTCTAGTATGCTAGACTGTGATTTATGCTTCCATATTAA
TGCAATTTTAAGAATTTATTGGTTTACCATAGAAAACATATTTTTATTTGACAAGTCAAT
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TGGTATTGATTTCGTACATATTTAAACAAACCTCTCAGAGAAAATATCTTAACTACCTCG
TAATTGCGCACCCGTAATATGTGACGTGGTACACCTTTGCTACTTGTTATCAAAGCTCAA
GTCGTACACAGTTCTTGCAACATACCTATTGTGTGGCCTTGCATTAGTTTCCTTGTGAAT
CAATTTATATTGACGAGTACTCTGTGCCGACACGCTGGTCCAAAACTTTTTGCCGGCCGT
CTGGCAGCCGCACGATCCGAACGTCCGTAACCGTACGATTAATTTTGCAAGGCGTCTTCT
TCTTCTCACACGGCGCCTGCTTGCTAGTCGCCCCCGCATGACCTCCCACTTGCAGCTCCC
GTCGCGCCGCTCGTTGGCTCACTGTTGCTGCACGCCGTCCCTCTTCCCAGCGTCTTCCTC
CTTCCTTTCTCCCTCCTGCAACGCTGGACATCCAGCAAAGACCATCCATGATTGAAGCAT
CTCCGCAACCGCTCCAGTAATGCCAACCATGGTTGTAGCATCTCCTGATCGTGGATGAAG
CTCCCTCGTTCGTCGTTGAAGCTTTTTTTTGGTCGCTTGCAGCTTTCATCAACGTTCGG