Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_275576
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_44866 |
1 |
330 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_44866
Contig Sequence (7573 bp)
>contig_275576 7573 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGACCCCCCTGGAAGACGACAGAGGCCCCCAGATAGACGGCAAAGGCCCCCCCCCCATA
CGACAAAGTCCCCCCTCGCAGACGGCAAAGGCTCCGTTAGATAGCTAACAGAGTAGGTTC
CTGTCGGCTGCCGTCTAGCTTCTTTGTTGTATGCTTGTCATGGCATGCCGATGGCAAAAA
TCTTTGCGGTTTGCTGCAAGATGGAACACGGCAAAGAAGGTCTTTACCGATGCAAGCTAC
GGCGAAAATTTTGCCGTGCGTGGAATGGCCCTTTGTCATTCGCTATGACAGACGGCAAAT
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GTATAGCAACCTAACTCCAAGTTCCATAAAAAATTGGGAACAAATGTAAAATATATTTCT
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GTACTCCTTCCTTGTAGAAGAAATTTATGATCTGTTCAGAGGTTTACGGGAGACGAAACT
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CCGTCCTTACTCGATTATTTCCCAACAGATGATGACTTGCCAGATGAAGAGGTGTTCTCT
ACATCAATTGCTAGTTCATCATGGCAAATGTACTTTGATGGCGCATGTCGATGATGGGGG
GCACGTGCAGGGGTTGTCTTCATTACACCAAATGAAGGAATAATCTCGTACTCATTTACC
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TTGGCTCTGGATATGAGGTTAGATGCACGAACGGTGTATGGTGACTTTCAGTTAGTGATC
AACTAGCTAACGGAGATTTACATGGTAAAGAAAGAGAAATCAATGCCTTACTTCCAGCGA
CCCAAAAGGCTCATGTCCATGTTTGTTGATCTAAATATTCATTATCTTATAAGAAGCCAA
AATTGAAAAGTTGATTCCTTAGCAGGTTTAGCTGCTAGTATGTCATTAAGTGCACATCAA
ATGATGAATGTTCGTGTTGAATAATGCAGAATCCTGCCTATACTCGTCGAAGAGGAGGAG
ACGACGATGTCGCTTGCAATGACTTCAGATGTCTACGAGATTGAAATCGGCGATCAGAAG
AGCCCTTTTCTGGAATACTTAATCCACGGATATTTACCTCTAGACTCCGCAATAATATCT
AGAGTTCGGAAAAGGTCAGTCCACTATACATGTATAAATGACACCCTATATAGACGTTCT
TTCGACGACATCCTTCTTCGTTGCCTAGCAGGGAATGAAATTTGGGAGGCTTTAAATGAA
GTGCACGCCGGGTTGTGTGGGGCACATCAATCGGTCCCTAAGTTATATTATCAACTCCGA
CATCTTTGTTATTATTGGCCTACAATGTTCAAGGACGCCATGAAATTTGCAAAAAGATGA
GATGAGTGCCAAATACATGGTAATTTCATACATCAACCTCATGAATCGTTGGATCCCACA
AATATGGCATGGCCATTTGAAATGTGGGGGATTGATATAGTAGGACCTATTAATCCGCAA
TCATCAAAGGGCCACAAATTTATCCTGGCTGCCACTCACTGTTTCTCTAAATGGGCTAAG
ATTTATAAATGTTAGTTCCGAAAAGTGTGATCGATATGTATTGATACTAATTTAACTGCA
CAATATTAATATTAATATTGTTGTATTATTTATTACAACGAAGATCATATTGTAAGCATA
CTTTTACTATATAAATAGAAGTATTTTGGTAATTCTTTTAATTTGCATACGTACACGTCT
TGTCTATAATACCATTTATTGAGGGAAGCGAAAGTGTATAATCCTACCATGAAGCTCCAA
CCAAGAGTCTTTTTTAGAGCTCATAAACCCAAGAATCTATACTTGGGACTGTCTTCTCTA
TTGAAAAAATCGAAGAAGCCAGAGAATGTATTCTATTTGGGAACTTTCTTATTTTAATTT
TCGGATGAGTAAGATTCTTCCTTCTTTCATTTTTTGAATTGGACCCTTAATTTATTGTGT
GGGTGCCTAGTGAATGTGATCACAAAACATAGTACATGCGAAGTTATCTGATAACTGATT
CAACTTTGTTAGATTCAGTATTAGTATTGCCTGGGTGTGACCCAGATTTAGTTTGTACAA
AAACGTACACCTCTTTGTCCCTTTCTGGTTCTGGACTTCTTTTTACGGGAAGCTTCCACC
ATGTAATCTTGTTCCTTCTCTAAATCCATCATTGTCAATGTCTACAGTTTGTTATCCGTG
TTTCTCCTATCTTTTATATCTTCTTTTGCTAATAGGACTCTCGGATAGAATAAGTCATTT
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TTTTATTTCTCAGGCAACAAATATGCGTGAACATCTCTTTTCACACTTATTTTCTTGGGA
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TGACATCAAGAATACTGAACAACAAGCACTATGCACCCTCTATCTTAATCTACTTGACAA
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TGATGATATATATTACTATTTGCTTCAGTTTTTCAGCATGCTTTAATCCAATTGTTCTGG
AATCAAGATTAAATACTATTAAGTGATTTCTGATTTACATAAACTGTACTTTTCTTGTCC
TTCTTGTGCATATCTTTCACCCCATGCACATATGTGTTCAGTTTTTGATTTATTGTTCTG
ATTGTAATTACACACACTATCTTTCCAAATCCATGTCCGCGTAGCTTTTACCCCATCTAA
ACCACATTGTCTAGCAATACATGTCTTCATTTAATTATAAGCAAACTTGACATGTTACAT
GTTAATATACAACACCAAATCTGTTTATCTTACAACAGTTAGAGTTTTTTCCGAATATCA
CTTGAGTGCCTGGTTTCTTTTTTCATTTCCATGATCAATTTAATTAGAGTTGCACATGTG
AGTATACTATACATAAAAAAATCCTAGCTAGTTTGAGAAGATTTTAGCCGCTCCATAAAC
ACATACTAATTAATGTTAGTCATACTATTTATGTACATTTCATTTGCTGTCAATTCTTGC
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TATATGTTCATTCTTATTTTTTGCATACGTGAAGTGTGAATCCAAGTCCGAAGGTGTGAA
GCATATCAACAAAGAGTAGCATATTATGTATTGTAATTGTAGGCAGTAGTAGGCTTATTT
GGGCTGTAGTATAATGTAACGATTGTAATAGACTAATGTAGTGTTGGTTTGGACGAATTC
CATTTGCTCTTTG