Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_275042 (7243 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_275042

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_44617 2 2029 bp MLOC_44617.2 Available Available LOC_Os03g22740.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m02743 protein nucleolar protein NOP5-1, putative





CDS Structure of MLOC_44617






Contig Sequence (7243 bp)

>contig_275042 7243 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGACTCCTCCGATACAGGTAAGGCAAGAATAATACCCA
GCGCAGCCGCCTCGGCGGCCTCCCTTCTCGCGGTGTATCGGCGGCGTGGTAGGTGTGCTG
ACGCGTTCGTGCCGGGGTTGGGGTTCTTTGCCGGCAGGTCAGGAGGAGGAGATGTTGGTG
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GAATTCGTGATAAACTTTGATAAATTCATACTGCAGGAGTGGTTTACCTAGATTATCGTT
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CCTCTCCTCTGTAGCTCACAAGCTGATTGGTCAACATCGGTCGGTGTTTATTAAAGGTTG
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TTTTCTCCGAGACGTTCTTTTGGCTAAGAGTTTTGACGGAGTTTACGTGTATCGTTTGAT
GCAGTTGGTTTGTGGTGGCCACACGACCGTCTCGATTAATGGGGCTGTGGGCCCTTATTT
CTAGAATGGTCCCGGTCTCATACAAGGCGGTCCTATCTCCCCCTTCTCTTCATCTTTTTT
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TCATGCTAAGATCTCTCATTTGCAGTATGCCAATGACATAATTATTTTGATTGAGAAAAA
TGATATGTGCATTGCCAATCTTAAATTTCTAATACTCCACTTTTCTTTGAGGTTATCTCT
GTGTTAAAATCAACTTCTCTAAAAGTGAAGTTATTGTCATGCTTCGGAGGTGGAGCTATG
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GGATCCGTATCTCTCCTTTCAAACTTTAATCTAAGAATTTTGTTTACTCTGTTCTCAAGG
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GCTGTCTATTATGCTAGCTAATACTCTAACCGTAGGTGCCTATCCAGCCCATGATGTGCG
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CCTTTCTCTCTCCCCCACGTCATTTATTTCCTGACGTGGCTTTCATTACAGACAGTTGAC
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CTACTTTCTACTTTAACTTTTTCAGTTTTTTTACATCGGACCACATCTTTTCTCTTCAAG
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GCAACAACCAGGGTTCCCTTCCTTTTCTCCTTTTGCTCGTGCTTTTCACGGCCAAGCAGC
GGCCTCTTCTGCAGGCGACTCTGACAAGCTGCGAAGCTATCGT