Map Locations of contig_274789 (5700 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_274789

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_44475 3 1470 bp None Available Available LOC_Os04g01230.2, FRAME:+3, EVALUE:2e-61, 13104.m00027 protein phosphoglycerate mutase, putative, expressed
MLOC_44476 1 388 bp None Available Available None
MLOC_44477 1 854 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_44475






CDS Structure of MLOC_44476






CDS Structure of MLOC_44477






Contig Sequence (5700 bp)

>contig_274789 5700 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATCAATATAAGGCAAAGCTTTTGCCTCGTTTCAAAAATAAAATAAAATGAATAAATACAA
TTAAAACAGGAGCAACCATTTTTTTACATATATAGTGGTGTTAGTGCCTTATTTACATTA
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TAAAATCATAGAAGTCATAATATCTAGATTTTCCTCATTAAATCCTTCTTAGTTCTCAAT
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GTCTATATATAATTATACAGTTTGGTTTATGAACATGTATGCTACATTCGATATTGACGT
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AATTCCTATTTTTTCCATGCTTTTGCCTTTTTAGAGAACGAATTCCAAACACATGAAACT
TTACGGGGGTTATTTTTTGACATAAAGATACCCTAGAAGCTTCGGGAGGCGACCAGATGA
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TAGTCCCTCGCGAGCCCTCCTGACCTAATTGCACTTCCGCTATGTTTGGATGTCGACTTT
GAGGTGTTTAATTCGGTATTGGCATTTTCCACTCTCGAATACCAACATTTGGGTGGTCAT
AGGTATTTAACCGTGGCACTGAATCACAATATTGGTCGTACCCTGGGAACACTTCGCACC
CTCTTCCCAAATACTTCGCTCTCGCGCTTGGTTTTGGGCTGATCCCCTCCATTCCATACC
CCTTCGGCCCTTCCCCTCTCCTGAACAGTCCAGTGGGGGAAACGGACTCACGAGACGAGG
GGAGAAGCGACGGCAAGCGGCGGTGCACGTGAGCCCTGGCCTCGCCCCTGCTCCCCCAAC
CTCGCCTTTCCGGCCAGCAACTGCCTTGGCCTTGGCCCTCTCGACCTTTCCCCTATAGTG
GCAGCACAGGTGAGCCCCGGCACACCATGGAACCTGCCCCATCACCGATCTCCTCCTCTT
CCGCATCTGACCCATCCGGCCATCTTCCTCGCCCATTCCCCTTCCCCTTCCCCAACCCGG
CCTCACCCACCCCGTCTCCTCCCTTCCCGCCTCTGCCCCATCCTTTCCCGCCCCGTCCAT
GTCTGATCCCAATCCCACCCCATCCACGTCCGATCCTAATCATGTAGTAGGAGCATGTCA
CTTCCCTATACATCATGGTGGCAGCAGCTCGCCTCTGTTTTAAGCAAATCTGCAATCCTA
ATTCCTCCCATGATGGATTGTTAGATGCTAAGTATTTCTTCCCAATTTGCAGGTTCACTA
GTGGAATCAGGGAATTTCCATCAGTCGGTTCTTTGTCGTCTGCTGGCTGATGGCAAAGAT
CCTCTTTGTCGTCAGCTGCCAAAGAACGGGCGGCAAAGTAATGGTTGTTGGCAAATATCC
TATTTGCCATTAGCCATCTCTTTGTCGTCTACTAGCTAACGGTAGAGAAGGTGTAGGCAG
ACGACAAAGGGTTGGCTATTGGCAAAGAACTTATTTGCCATGAGCCAGACCTTTGTCGTC
TGCCAGCGGACGATAAAGAAGGTGAAGGCAGACGGCAAAGGGGACGGCCGGTGCCAACCC
TAACGGCCGGCACCAAACCCACCCCACCCCGCCCCACCTACCCCATTATCATCTGCCTCC
ACACCTTTGTCATCCACCTGCATACGGCAAAGGGGACGACCCCATAACGGCCACTTGTGC
GCCCGCTATCTCTCTCCCACTCTCTCCACCCCAACCCACCCGCCTCTCTCTCTCGCCCCT