Map Locations of contig_274396 (9543 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_274396

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_44252 5 1057 bp MLOC_44252.1 Available Available LOC_Os01g59550.1, FRAME:-1, EVALUE:2e-44, 13101.m06331 protein senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed
MLOC_44253 3 605 bp AK369415 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_44252






CDS Structure of MLOC_44253






Contig Sequence (9543 bp)

>contig_274396 9543 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTATTTCGGGTTTTCCAGACTAGAATTCGAACCCTAACCCGAAAATCGAATAGTCAAGA
AATGAGAACCGAACCCTTACCCGATGTCGGGTAATTCGGTTCAGTTCGGGTTCGGGTAAC
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CTGCTGTCATACTGATCCAACAGCCTCTTGTCCACAATATCCTGGATACTGCCTTTGGCA
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TTTAATAAAAGAAAATAAATTGTATTAATTCATTCCTCTACTACCCGTCCTGGGCTTGGT
TTGTTGGCCGTTGAACTTTAGAACATGGCTTACTAAGGAGTTTAGTGTAATACTAAATCA
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ATTTCTATTACTTTAATGAGGACACTGACAATGTCCAATGGAGTTGAGAATCTTCAGGGG
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ATATTTGTCATATGTGTGCAGTATGTACATCGATGATCGATCTTACCATCCTCGGAGGCA
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TGGAAGATCGGGAGAAGGCGGACACTCTTGGAGTCGACATTGTTCTTTTCCATGGTAAGC
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TTGAAGTAGTCGTTGCCCGGGAGAATCTCCACTTGACTGCTAGTGTTCAGGTTGATCAAG
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TGGCGTTGTCCGTAGCAACGGTGAGCACCTCCTTCCATTCCGTGAGTGTTGGATTCCCAT
CTGTCAGGTTCATCGTATCCCAGAAATTGACGCCAATATGGAGCCCAAACAGAAATGGCG
ACCCGTCCAGGGTCCTGTTCAACCCGTCGTAGTTGCCGTAATTAAACACGGCCCTCAACA
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TTCTCAAGGTTTTTGATTGCTCACTAGGCGCATCAGCCATGAGCTTCGCTGAAATCTTGT
AGCTCAATCCACCCTCGACAAATCCGTCATCGGAATGGTACTGTATTCCTGTTATGCTGT
CGTTGTAGGTGCCACTGTTTCCACAATCGATGCTTATGAACCCTGCACAAGGAGGATTCG
TATTAGTTCTATGTTTTTTCAAGTTTAAGATCTATTCCAAGATCATGGCTGATGTGACTA
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CCGTCCTACCTGCAGCCCGGTCCTTTTAACGCACGCACGTTGATCGATCTCTGTTTGAAC
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CATAGACCGGGGGTAATTCCTCTTTTTGAATTTTTTTGACTTACCTTACTATATTTTCAC
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TGGTCATGTGGTGCGTGTGCCTATGGACCCAAGGATCACATAGCCGCCTCCCTCATTTTC
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TGATGTAATAAATAATAAAAAAAACCTTAAAAACAAACAATTAAAGAAAAAAAAGATTAA
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CAATAAATAAGACCGTATATAATACTCACTCCGTTTCAAAATAAGTGACTCAAAAATGAC
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CGGTTCTGGGTTCTGGCTGACAGTGACGATGAGGAGGAGGCCCTCGCCACCGACGGTGAG
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TTCTCGGAGGAGGAGGTCGCCGAGATCGTAGACGAACTGGTTCCGACGAATGATCGGCAA
GGACTGCAGGATGCGGACAGGATCGAGGTCGCCAGGAGGGTTGCCCGTCAAAGAACATCG
GCGTCGTCTGTGCGGCCGTGGCAGGGTCCTCTTCCTAAGGTCAGTTTGCCGAAACTTACT
TTGTCAGATTTTTTGTCCACGTCGTGGAAGATAGTCACAAACAAGAAACAAAGAAAGAGA
GCTGCTGTGTTGACGGAGACGGCGAGGCCGCCGGCGAGGCCGATCCCATCGGCATATTCA
AATTCGTTGAAACCGTCGTTGGGCCTAGTAACGTCAGAACAAAAAACGCAGGGGCTGGAC
TTAAGTCATACTGGGTATATGGCCCAGTTAAGAGTCTAGGCTTTTTGCAATAATAACAAT
CAC