Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_274259 (6718 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_274259

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_44147 2 5227 bp MLOC_44147.1 Available Available LOC_Os05g07050.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13105.m00763 protein pre-mRNA-processing-splicing factor 8, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_44147






Contig Sequence (6718 bp)

>contig_274259 6718 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCTACGGCGACAAGCGCAAGTTCGGCTTCGTCGAGGCGCAGAAGGAGGACATGCCCCCC
GAGCACGTCCGCAAAATCATCAGGTACGGAACCTCCAGATCCGCGCCTCCGGGCCTGCCT
CTGCTGCCCGCGGCTAGGTTTCGGGGCCTTTGGCGCTCACCCCGCGCTCTTACGCTTGAT
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TATGACTCAGGAGGCATTCAGCAACACAAAAGATGGAGTATGGAACTTGCAGAATGAGCA
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CACTCGGCCTTTGGCAACTGGTTCCCTGGGTCAAAGCCCCTCCTCCAGCAAGCAATGAAC
AAGATCATGAAGGTAATAACCATGCTAACTGTAACAAATCTAACTCTATGGCATTATCTG
TGTTGTTAAATTTTTTGTCTTATTTAATAAACGACATGCTTGTTTATTTTTTCTTTTGAC
AGTCAAATCCTGCTCTGTATGTGCTGAGAGAGAGAATAAGAAAGGGTCTTCAGCTGTATT
CATCTGAACCCACCGAGCCATATCTGTCTTCACAGAACTATGGAGAGATATTCAGCAA