| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |  |
Predicted Genes from contig_274135
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
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| MLOC_44076 |
1 |
1400 bp |
MLOC_44076.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g37700.1, FRAME:+3, EVALUE:9e-137, 13102.m04125 protein lecithin:cholesterol acyltransferase, putative, expressed |
| MLOC_44077 |
6 |
1227 bp |
MLOC_44077.3 |
Available |
Available |
LOC_Os03g22610.2, FRAME:-3, EVALUE:3e-119, 13103.m02725 protein peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial precursor protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_44076
CDS Structure of MLOC_44077
Contig Sequence (13308 bp)
>contig_274135 13308 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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AGGTGTCCAATATAGGCACAAGTGCAAAACCTGATTGCCATATCTATAGAGGAACCGAAT
TTGTTCTTTGAGTGGCCACCGGCAATGATGCAAAAAACAAGCAACCAAAACATGAACTAG
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AATTGACATTTTAGCTTTGTGTTAAGTCAATATTCTCTCAGAAACCAAGTTTTTATAAGA
AATACACACACACACACAATGCATTTATCTAATACTCTCTGTGTGTGTGTGTGTAATTGC
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TCTTTACTTTGCTCTTCAATATCTAAGCATTAGTTTACTTCATCATGTGGATGAAGCGGT
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GGCGATTGTTTCGCCATCTGTTGACCTTCTAGCGCTCCTCACATTTCTCATATGCCTCCT
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TATCAGTTGCCCCAACCTGGAGGTGCGGCTGACCGACGCCTATGTGTCGTCGCTGCCCCG
ATGCAGTGCATTCAAGGGGAAGGGATGGTTTTCGTTGTGGAACAACACATTCGACCTAGT
TCGGCGGGACTATGTGTCGTGCTTCGAGGAGCAAATGCGCCTTGTCTATGACCCCACCGT
TAGAGACTACCGAAACCCGCATGGCATCGAGGCACAAGTGCCAGACTTCGGCTCTGCCCA
CGGGTTCACCTCAAAAAACCTAGATGCGTAAGTACACACGATGATGATGTACAACTACTC
CATCCGTTGGCTTTCTACTACGTACGGATGTGTATATTGATCTTACACTGCACATTGCAT
ATATGGAACTCTTTACAATGCCTGAGGTTTTTGTCTATAGTGTATGTAGAGTTTGTGGAT
TTGAGGACTGATGTTTACATTGCATTCGTGGTCCAGGAGTCGCAAGGGATTTTGCATGAC
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TCCCTATGACCCACGGCACGCTCCGCCACTGCCGAGCCAGCCATCTCAAGTGTTCTTGGA
CTACTTTGCTCGTTTCAAGGATCTAGTGGAGCGCACAAGCAAGAAGAACAAAGACAAACC
GGTCATCCTTGTCGCGCATAGCTTTGGTGGTGTGGCCACCCTCAAGTTCATTAACTAGAC
TCCTATACCATGGAGGAAGAAATTCATCAAGCACCTAGTCCTCATATCGCCTGCACTTCC
GGGAGGCTTTATGGAGGCACTCACGAACCTCGCCTCAGGACCGAAACCCCTCGTTGTTCC
AACAATTCCGCGCTTGAGTTTGCGGCCAACGTGGAGAACCTTTGCGAGTGCCCTTTTATT
CCTCCCATCTTCCCTGGTTTTTGGTCACAAGCCGCTCGTGATCACCAAAAACAAGAACTA
CTCGGCGTATGACTACAAGGACTTCCTTCCGGCAATCGGTTTGAACACCGAGGTTGTGGA
ACGAGCGCTTTCGACAAAGCTGAGAGTTGATGCACCGATGGTGCCAACAACATACCTCAA
CAGCGTGAGCGTGCAAACGCCGAAGCAGGTGGTATACTAGGATGGTAACTTCGACGTGGC
TCCCAAGAACGTATATATATGGCGATGGAGACGGGGTTATGAATTTGGTTAGCGTTCTTG
CTCTCGTGAATGATTTGCGTAGACAACAACAGGCTGACATACACTTTAAGTTCGTCAAGA
TTGTTAATGCTACACACTCCGACATAGTTGTTCAGGAGCATTCGCTGAGGATGATCATGG
CTGAAATTATAGAAGCAAATCGCTGAATCGTCATCGTATGTTATTTATGTTTTCGTTTGT
ATTAAGGATTTCTAATCTCACTATGTGATTTGACATTGTTTTTAATTCAAAATCTGGACC
ACATCGGTCTCTGCACACCGATTGATGTAATTTCATACATTGTAGAATATTATTCTTTGG
GAAAGATGTCGATGTGGAATATTATCACCATATCGTAAATTTTTCCTAAAGGTAAGATTC
CCCTTCGAGGAGGGCTATTGAAATTGGGCACAGCTGCCCGTTGTAAACTGCATACTCGAT
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ACAGACTTATACAAATTCGACTTGGAACAAGTTTTGGTCAGTACAAATTTGGAGCCGCAA
TTAGTTGAAAACAGAGGGAGTACTGTGTTGTAACTGCAATTTACATTTGCTGGCATTAAT
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ATGAAGAGCCAAGTCTTAGCGTTGAAGTAGCACCTCTACCCAGGGGTAATTTTAGGCAAA
TATTAAAAACTTTCAAACATTAAAGACGATTAATTACCAGTCTATATAAAAGCCGGGCGT
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ATCTTGCAGCGCTACTCACCTTCCTCATCATCTGCCTCATCCATCGTTGCGGCGCAGGCG
GCTATGACGCCGAGTTCTACCACCCGGTAATCCTGATCCCTGGTTTCACTTGCCCCAACC
TGGAGGCGCGGCTCACCGACGCCTACGCGCCGTCGCTGCCCCGCTGCGGCGCCTTCAAGG
GGAAGGGGTGGTTCCCGCTGTGGAAAAACACGTCGGACCTGGTCCGGCAGGACTATGTGC
CATGCTTCGATGAGCAGATGCGCCTTGTCTATGATCCCACCCTCAACGACTACCGGAACC
TTCCCGGCGTCGAGACGCGCGTGCCGGACTTCGGCTCAGCCCACGGGTTCACCTCCAAGA
ACGATTCGTAAGTATACACACATCATGTCAAGTACTTCGTCCATTGGATTTGTACTACGT
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TGCATTTCGCGGTGTTCAGGAGCCGTACCCCAACTTGTCTGACAAGGGTGCGTGAAGAGC
TTGAGTTGCTTGGGTATCGTGACGGCAAGACCCTTTTCGGAGCTCCCTATGACCCACGGC
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AGGACCTGGTGGAGCGTGCAAGCGGGAAGAATCAAAACAAGCCGGTCATCCTCGTTGCGC
ACAGCTTTGGTGGCAAGGCCATCCTCGGGTTCGTCAACAGGACTCCGATGCCATGGAGGA
AGAAATTCATCAAGCACCTGGTCCTCATATCGCCCACACCTCCAGAAGGCTTCATGGGGG
TGCTCACGAACCTCGCCTCGGGACCGTCCTTCCTCGTCCCATCGGTTCCGCCACTGCTTC
TGCGGCCGATGTGGAGAACCTTTGCGAGCACACTTTTATCCCTCCCATCTCCTATGGCAT
TTGGTCACAGGCCAATCGTGATCACCAAACATAGGAACTACTCGGTGTATGACTACAAGG
ACTTCCTCACGACACTCGGTTTGAACACCCAGATTGTGCAACGAGTGCTTTCGATGAAGT
TGAGAATTGACCCACCAATGGTGCCGACGACGTATCTCAACGGTGTCGGCGTCAAAACGC
CAGAGCAGGTGGTGTACCGGGACGGTAACTTTGATGTGCCACCCGAGAAGGTATATGGCG
ATGGAGACGGGACCATGAATTTGTTTAGCGTGCTTGCGTTTGTGAAGGAGCTGAGTAGGC
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GAAAAGTCGTCATATGATATTGCGTCTTTTTCAGTATATTATGGACGTTCCAATATGATC
ATGTAATTGGGCATTGTTTTTAAAAGGGGGTTCATTCCAACCTCTGCATCAACTGATGTA
TCTTGACATTGTTGTGGAATATGATTTTCTTTTCTGGGAAGATGCTCATGTGGAAAATAA
TACTCCTGAAGTTAGCTATATTGCTCGTCATAATCAATGAAATACTAGAAGAAATATTGA
TACACAATAAAATAAAATAAATAAATCGGTGCCACCTGGTACTCAAGGAGAGTCAATTCC
GCATTCCGTCGATAATACTGGAAGAGCACAGCATGAATGACCATTTCTCTAGAGGAGCGG
TTCGTAGTCACCTTTACAACAGCTGCTGGTCATGTGATACCAGATGCTTGTACTTCTGAT
CCACGTTCGCCACTCTCGCCGCCTCTGTCAAACCCTTGGTGACCACCATCTTCAGGATGT
CGGCACCCTCTTTTATGGCTGAATCAATCTAGGTTCAGAGCAAAAGATGCGCACACACAA
AGGATAAGCGTCTGGCTGTCGTGCACGAGTTAAGACAAATTTTTATTTGTTGTCCTTCTA
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GGAAGGAACACTTAAGTGGTCCTTCGGATATCTTCAGGTTGTGGAATACACCTCCAGTCA
GTCAGATTGTTTTCAGTTTGACACACAATATCTTGATGTCTGTCTAAATTATCCATAGCA
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AGGTGTTTCTAAATTAATTAATAGGAATAAGCATAACTTAAACTAGAACTCAAGGGTAAT
AGAAATGGAGATTTTATACCCGTTCACGACCAGTCTTGTTGAACTTCTGAAGCACAAAAG
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TCGTCCAAATTCTCGGTTCTTGCGAAAATGGTAGATCACACTCTTCAACCTGATAAACTA
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TACCATCAACCATCCCTGCATCAATAGAAATGAAAGCACCTTCAATTCAATTCAACCCTT
TGTACTTGAAAACAGAGCATCAATTACCCGAAAAGTAAAGAGGAATGTTATTTTCTGGGA
GCATATGGATGGAGTGAAACCTTCACCAAATAGTGCTTTGAAGTGATTTTTGGTCAGGGG
TATGTTCTGAGACTCTGCAAATGCATCTATCATATCAAACCCAACCTGCAAGGTGAAATG
ACACAAATGAATTATGACAATAAAGCTGAGAGCCACCTGCATTTCAAGCAGAAGATGAGA
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GCCAACAACGAGCCATGGTTGGATTGCCGAGCATGATGGTGATAATGACGAAGAGACATA
ACGCTTCGAAAGTAACGGAGCAAATCTGACCAGCTTTCCCTGCATTATTTACAGGACCAT
AGGCGTCTAAACAGCCACAAGTGCAAAACCTGTTGGAAATCTGCAAAGGAAACCAATTTG
TTCTTTTGAGTGCCCATTGGTCATGCTGCAACAAACAAGAGGCAAAACCATACATATGTG
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GAAACTGAATATGGCGCATACTTTGGCACAGAGGTGATGCCCACTGGCCACAGTAGAGCC
TTGCTGTTTCACTAAGCGAGTAAATGCAAGTATCCAATGCAGAGACAGCTTGATCAGTCA
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AGGTCACATGACTGCAACACCGACGTGCCCTGGCCTCGTCCTAATGGCCGCGTTGCGAAA
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GCCGCACAGGGCGCGGTCCCGAAGCCCAGCGGAGGCGGCGGTAGCGACGGCACGGCGAAG
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TGCTCAGGACGGCAACGCGCTCAAGGCACCAGCACCCGTCGCGTCGCCTTTCTTCTCCGA
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GCAGAAAACTACAAAAAGAGAAACGAGATCTGTATATGGCACACCACATCTTTGGGAGCC
ACTAGTTGACGAGTTTTCTTCAAGAGCAAGTCAGTGAGCACTGGCATGTTCTCAGCCGCC
GTCACATGTCATATTTTTTGAACGGTTTTTTCAGTCTTTTATATTTTTTTGCACACATTT
TCTGGTTTTTAGAATGGTTTATTTATTTATTTTTTGCATTTCGGTTTTCATTGGTATTTC
TTAGTTTTTTGGCAAAAAACGTGATTTTTTTTTTACGAGAGGCACGGTTTTGCTTTTGTG
AGAGGCACGGTTTTGCCTTTGTGAGAGGCATGATCGTGCCTTTCGGAAAGGAAAAAACGT
GTTTTTTGTTATTTTTTCGTGAGAGACACGGTTTTGCCTTCGTGAGAGACAAGTTCGTGC
CTCTCAAAAAGGGAAAATCGCATTTCTTTTTTTCGCGAGAGGTACAGTTTTGTTTCTGCG
AGAGACACGGTTTTGTGTTCACCGTGCCTCTTGGAAAGGAAAAACAATGCGAAAAATGTG
CTTTCTGTTATTTTTTTATCGCGAGAGGCATGATTTTTTTTATACATTTTTTTTCATAAA
AAAGTTTATCAAAAGCTATCAACATGGGATCTAGTTTCAAAGATCTCGACACGAGAAATC
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CATCATTTGTCGTAACCTGAGAAGATGTAAGTGATTTTAAAAAGGTGTATTCCTCATTTA
GTGATTTCCCACATTTTGTTGCAAAAATACCAAACTCAGTGAATGCCGTTCATTCTCAGA
TCTTGTGATCAAGCACGTTGCTGCCTGTACACGAACGGAAAAAACAATATAGGATCCTGA
TAAGTGACATGTGTATGGGCTGAAGGAGGACGGGCTGGATGCCCTTTAGGCCATCCATTG
CGCCTAGCCAGCTTTTTTGTCATTAATTACTTTAAAATTGCATGGTCAATGGTTTATATT
TTCCATGAACCACAAACTAAATTCACCATGGTGAATTACTTAAATTTGTTATGATACATG
CATTAAATATTGCTAGGACTTATGCAAAAAATTATTTTCATGGTCAAAATACTAACGTTG
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TTAAATTTTCTGTGGCTCATTACTAAATAATGTGATGATGAATTAATAAAAATTCCCATG
AAAAGTAGTTGAAATATAATGATTGCTTTAAAGCTATAAGAAAAAAACTAGATTAAGCAT
ACCATGACAACTTTAGTGTAAACACTATGGCAATTTCAATGTAAACATAATGGAAACTTT
TGGACCAAAAAAGTCATCGAAACATATCAATATGGGATCTAGTTTTGAAGATCCCGTCGA
GACGAATTTAATAATAAAAATTAATTTTTAATCGAATTTTTTTATTAAAGAGATAAAAAA
AAATAAGTTTGAAAAAAAAAATCAGCTGATGCCATTGTGTTTGAAATGGCAAGATGAATA
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CGCGCCAACCCAACCTACCTATTGCATCTGACTGTAGCTTCATATGATTTTTTTGCAACA
AAGATAATCGAGTGCTAAAAGTGTGTGTCCAACAGGGACATACGCTTTCATGGCAGGAGC
GGCATATGCTGACCTTATGGATCTCTTCCATGTTGAATTCCATCTCAAGTGATTGCAATT
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ACTCACCAGAAGCAAAAAAAAGCTGAAAATATAAAGAAGTTGTTTTTGTAAATGTAACAT
GATAGTGCAAACTTCGTGCATTTGTCATCTATACTACTAATAAAAGATCAAACGCAAACT
TCCCTAAGTACACACAGCTATTACCCCCACAAAAACAAACACCAATCACCATCACACAAT
TAGGCAACAAATAAAAATCTAACAGCTTTCCACCATCCACACAGCACCACCGTGTGCATT
TACTAATTAAAGTAAGGCTGGCCGTGCTCCACCTCCTCCTCAAAGGAAAATGAACGCCTG
GTCAATTAGGAAACTGTAATCACGAGTGCCTATCTAATCCCACAAAAT
