Map Locations of contig_269363 (7423 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_269363

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_43313 7 2573 bp MLOC_43313.2 Available Available LOC_Os01g42460.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m04358 protein BAH domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_43313






Contig Sequence (7423 bp)

>contig_269363 7423 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCTTTCTATGCGCTGTAGGTAGCTCTAGCCTCCAGCCAAATTTAGGATAAACAAATTAA
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AGGAAGTATAATAGTAAATAAATAGTGGCGGATAAATGAAAGAACATTTGAATGATGGTT
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AGATTACACTATGGACTATATACGGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTGTAGATTCATT
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CAGTTGAGTTGCCCGTCGTCAGCCCCTCGTGCTATGCCCCCCGTTGTCTCTGTTTGTCTT
TGTTTGTTTCAGTGTCCGTAACCCTAGGTCTGTATTGGATGGGGACCGATCGTGTTAGAG
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GGGTTATGTCTTTACTGTTTTGTTGTTGTCCTACAAGAAAAAGTGAATTGACTAAGAACA
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TATTGATGTCTGGTATACCCTTTTTTATCTTTCTAGGCCTATGGTAAGGGCAAATTGAGC
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GTTCCTTCCTTACTCACATATTTGCATTTTCTTTTAATTGGATTGATCCACAGACCAGAA
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GTACACAGAAAGTTTTCTCTGATAAGATGCCTTCAAAGAAGTTGAAATTATCTCAAGATC
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TGCACTAAAAGGATAAGGTATATTTTGATCCCTTTTCGGGGAAGTATGAACTCCACTTTA
GTCTGGTGTGTTTGGAACATTTTTTTGACAAATTTAATGCCATACCATATGCCAAAGACA
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CATCTGAAGTATTATTTACGTGTTCAGCTATATTTGTTAAAACATTAATAGATTTAATCT
TGGGCACATATAATCGATTATTTGTACTCAAGTAGTGATCTAAACACTCTTATATTTCTT
TACAGAGGGAGTACACAGCAATTAAAGGGGTCTCATATTTCTCAATTATTTTGCTTTATG
GACTTGTTGTTTATTTAGTAGAATATTATCTGCTTTTGATAGAGATTTGACCGATGCTAT
TTACGAGTAGGTTTGACTTGATAAACCATGCACAAAATGCTGTCATTTACAGTTTGCTAC
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TGGTTCAAACCGATGGTGAGTGATCTTTTCTTTGCTGTAAAGTCGCTTGTATATATGCTA
TTATTATTATGAAGTATATGTCATATCTGCAGTCTACATTGGATAAATCGTTTCATCAAG
TTAGCATAGTACTAAATTGTATCCTTTGATTTTCAGTTCTGTGTTATTGTCTATTGAATG
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TGGGATGAAAAACTGCCATTGGCTGATAAGGAGGGGAAGCTGGTGTATATTCAGAATCTT
GACATACGGTTTGGAGCTTCTGAAATAGTGGTACTATCTTCGTTTTCTTTATTTGGTTGT
CATTAAGCCCGAGCTGCTTCTAGTTCTCTATTCGTGTTCCTGGCCTAGAAGGATCATCTT
CTTGTCTTCTTGTTGAATAGCTTAAGCTATCTGTTCTGTATGCCGCGTTTGGCATTGATG
TGGATTATGATGATCTAGCTTTTCCAACTGACTCTTTCTTATTATTTTCGTTTGGCTAAG
CCAACTCTTTCCTGCTTCCATTCCTATTTTCCCCCAGCAGATTATCATAAACAAGTCACC
ACAGCACAATCCAGCAACCACAAGCTGAGCTTAACACAGCTGTGTGCACTTATTTATGCC
TGCTTAACTTCTACAATCTCTTACAAAATGTGTCCTCATGTTGTGAAAGAAGGAATTATA
TGCTTCTGCTCAAGGAAGTAAAATAATAGTATATATGTTTTTTATTTGTTATCAAGTAGC
AGTACAGACAAGTTGAAACTATTGGGGCATGAAAAAGTTGATAAACTCTCTGCATACCCA
TCTCTTTTACTCAAGGATCTTTGTCCACCCTGTTCAGTATTCATTCTACTCTTGCTCTGT
TTAGTCTTCATTTTCGTTTCACATGTTATCTGCTCATCTCGTGTATTGCTGCATCAATTT
AATGAACTTATCTTATTACGATCATGTTTGCAGGAACTTATACGTGAGGCGCTACAACTG
TCTTGTACTGCTAAGCCTATTAACCACCCGACCTACGATGATCCTAACAATGGCGAGTGA
ACTTCTACACAAATTCTAACATGTTCATCTAACCTTATCCAACGCAGTTTTAAATAAAAT
GCCCCTTCACATTTGTAGGAAAAGCATATGTTGTATTCAAATCTAGAAGTGCTGCTGATG
AAGCTGTTATGAAAATTAATTCAGGCTTGGTTGTGGGTGGAAGGTAACTCGCTCTATTGT
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GAATTTCATACCAAGCGTCGCTACTGTTTGTTATGTTTCACATGATGGAACCTCGGTTCA
GTGTGCAGCATTGCAATTGCCGGTCATACAGTTTGTATGTGACTGCCACTCTGCACTGCA
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TGATTAATTGTATTTCTTGCAGACCCCTTTACTGCAGCAAAGGGTTACTCAAGGTCCCAA
AACCAGCTTCAGGAGCTCTGGTTGGGCACTTAACCATCAGTAATCAGAAAATGAACCCAA
GACAACGAGAAGAGCAGGTCCTGATGGTCTCCTATAATTAATACCATCACAGTTTCTCCT
TTTCTGTACATGATATCAATGGAAATGTTGTTATTTCTGCAGAAGAAGGCAGTGTCGACA
TCACATTGTTCTCAACCCAACACAATAGAATATGATCTGGCCTTGGATTGGATGCTTGTC
CGAGAAAAGCAAGCAATGAAGTTCAGTATACTTCATAAGGTAAATGCAATTCCTACGTAC
TTTTTGTGCGTGGGTTCTCTAAGTTGAGACCTTAATTTTTAGCATGTCCAATATTGTTTT
GCAGAGGCACGCGGGTGAGAGGAAGTCGTTTGCAGCCAAGATGGCGAAGTAAGTAGCTTC
TTTGGAATCGCTTAACCAATGGGAATGGGAACCGCCAGATGGAGTTGTCAACCATCATCC
CTTGGAGCTTGGTGTGTTGTTCACCCGAAGCAACACTTATCATCAAGTTTTTTGTTGCTG
CGGCAACCTTATATGCGCTGATGGTTTATGTTTGGCTTCAACTAATTGAACTCGGAGGAG
GCTAACTGCAACGTAGGACGTTCGTTCTTTCTTAAGGAAGTAGATGTATAGGGGTGGGAA
TTATGAGCACGTTAACTTCAGGAATCAGAGTAGTGGGAAGTTTCTCATGACATATCTTGA
GGAATCGGAGTAGTGCCGTAGAGAAGTAGACCTTGCAGCAAAGCCGGAGGCGGTTTTAGC
TTAACTGTAAGCCAGCTTAGTGACGGTGCCCATCTGCTGCCGCTGCTGCATGTTTTAGGA
TAGCAAATCATGCAATATGTATGTTCAGAAAGTTCACGGCTTGGCTATCTTTTCTGGTTC
ATGGTACCGTATTCTTGTATGGCCCAAGTGCAGTGTCCATTTGAGAGTCTTCTACTGTAT
TATTGCTCTGCACCAGACTCACCGAGTCATGAGACGTGTTGTGTTCCACGCTGATTCATC
TGCGTTCGTGGCGACCTTCAGCTGATCGGTGCCTTTGAATGAGTGGTAAAGTTTAGTCTG
ACGTACCCTCGCTTGTGTTGGACGTGTGACCATGCTATAAGGGGAACCCCAAGATAGGAT
CGAAGGCCATCCAACCACACGCATCAAATATCCGTCTCCTTCCTCAAGAAAAATGAATTA
AGGAGAGAAACACCAACAGCTATGCAGTAAAAAGGGAATTAAGGAGAGAAGCACCAACAG
CTATGCAGTGAAAAGAGAGGGGCATAAGATGTGTTCAGTGTGAAAATATGTCCTAGAGTC
AATAATAAATTAGTTATTATGAAATGAATTAAAGAGATGAGCATCAACAAATAAATTAGT
TATTATGAAATGAATTAAAGAGATGAGCATCAACAACTATGCAGTGAAAAAGGAGGAGCA
TAAGATGGGTTCATTGTTGGAAATATGCCCTAGANNNNNNNATAAATTAGTTATTATCAT
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CAGATCCTGTCGCTGGCGCCCCTTCCTCCCTGCCCTCTCCCCTCGCCACCGTCGAATGAC
ATGGTTGGGCGAAGCTTGTCGCCTGGACGGCGGTGGCGGGGCT